RANGAP1 - RANGAP1
Běžel protein aktivující GTPázu 1 je enzym že u lidí je kódován RANGAP1 gen.[5][6]
Funkce
RanGAP1, je homodimerní 65-kD polypeptid, který specificky indukuje GTPáza činnost BĚŽEL, ale ne z RAS více než 1 000krát. RanGAP1 je okamžitým antagonistou RCC1, molekula regulátoru, která udržuje RAN v aktivním stavu, GTP -vázaný stav. Gen RANGAP1 kóduje polypeptid s 587 aminokyselinami. Sekvence nesouvisí se sekvencí Aktivátory GTPázy pro ostatní Proteiny související s RAS, ale je 88% identický s Rangap1 (Fug1), myším homologem kvasinek Rna1p. RanGAP1 a RCC1 řídí transport závislý na RAN mezi jádrem a cytoplazmou. RanGAP1 je klíčovým regulátorem Cyklus RAN GTP / GDP.[6]
Interakce
RanGAP1 je transportní protein, který pomáhá transportovat další proteiny z cytoplazmy do jádra. Malý modifikátor související s ubikvitinem s ním musí být spojen, než může být lokalizován v jaderném póru.[7]
RANGAP1 bylo prokázáno komunikovat s:
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100401 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022391 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Bischoff FR, Krebber H, Kempf T, Hermes I, Ponstingl H (duben 1995). „Lidský protein RanGTPáza aktivující RanGAP1 je homolog kvasinkového Rna1p zapojeného do zpracování a transportu mRNA“. Proc Natl Acad Sci U S A. 92 (5): 1749–53. doi:10.1073 / pnas.92.5.1749. PMC 42597. PMID 7878053.
- ^ A b „Entrez Gene: RANGAP1 běžel protein aktivující GTPázu 1“.
- ^ Hochstrasser M (2000). „Biochemie. Vše v rodině ubikvitinu“. Věda. 289 (5479): 563–4. doi:10.1126 / science.289.5479.563. PMID 10939967.
- ^ Hillig RC, Renault L, Vetter IR, Drell T, Wittinghofer A, Becker J (červen 1999). "Krystalová struktura rna1p: nový záhyb pro protein aktivující GTPázu". Mol. Buňka. 3 (6): 781–91. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 80010-1. PMID 10394366.
- ^ Becker J, Melchior F, Gerke V, Bischoff FR, Ponstingl H, Wittinghofer A (květen 1995). „RNA1 kóduje protein aktivující GTPázu specifický pro Gsp1p, Ran / TC4 homolog Saccharomyces cerevisiae“. J. Biol. Chem. 270 (20): 11860–5. doi:10.1074 / jbc.270.20.11860. PMID 7744835.
- ^ Bischoff FR, Klebe C, Kretschmer J, Wittinghofer A, Ponstingl H (březen 1994). „RanGAP1 indukuje aktivitu GTPázy u Ran souvisejícího s jaderným Ras“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 91 (7): 2587–91. doi:10.1073 / pnas.91.7.2587. PMC 43414. PMID 8146159.
- ^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3: 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
- ^ Tatham MH, Kim S, Yu B, Jaffray E, Song J, Zheng J, Rodriguez MS, Hay RT, Chen Y (srpen 2003). "Role N-terminálního místa Ubc9 ve vazbě a konjugaci SUMO-1, -2 a -3". Biochemie. 42 (33): 9959–69. doi:10.1021 / bi0345283. PMID 12924945.
- ^ Knipscheer P, Flotho A, Klug H, Olsen JV, van Dijk WJ, Fish A, Johnson ES, Mann M, Sixma TK, Pichler A (srpen 2008). „Sumoylace Ubc9 reguluje diskriminaci cíle SUMO“. Mol. Buňka. 31 (3): 371–82. doi:10.1016 / j.molcel.2008.05.022. PMID 18691969.
Další čtení
- Becker J, Melchior F, Gerke V, Bischoff FR, Ponstingl H, Wittinghofer A (1995). „RNA1 kóduje protein aktivující GTPázu specifický pro Gsp1p, Ran / TC4 homolog Saccharomyces cerevisiae“. J. Biol. Chem. 270 (20): 11860–5. doi:10.1074 / jbc.270.20.11860. PMID 7744835.
- Bischoff FR, Klebe C, Kretschmer J, Wittinghofer A, Ponstingl H (1994). „RanGAP1 indukuje aktivitu GTPázy u Ran souvisejícího s jaderným Ras“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 91 (7): 2587–91. doi:10.1073 / pnas.91.7.2587. PMC 43414. PMID 8146159.
- Krebber H, Ponstingl H (1997). "Všudypřítomná exprese a varlat specifická alternativní polyadenylace mRNA pro lidský Ran GTPase aktivátor RanGAP1". Gen. 180 (1–2): 7–11. doi:10.1016 / S0378-1119 (96) 00389-7. PMID 8973340.
- Matunis MJ, Coutavas E, Blobel G (1997). „Nová modifikace podobná ubikvitinu moduluje rozdělení proteinu RanGAP1 aktivujícího Ran-GTPázu mezi cytosol a komplex jaderných pórů“. J. Cell Biol. 135 (6 Pt 1): 1457–70. doi:10.1083 / jcb.135.6.1457. PMC 2133973. PMID 8978815.
- Mahajan R, Delphin C, Guan T, Gerace L, Melchior F (1997). „Malý polypeptid související s ubikvitinem zapojený do cílení RanGAP1 na protein komplexu jaderných pórů RanBP2“. Buňka. 88 (1): 97–107. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81862-0. PMID 9019411.
- Görlich D, Dabrowski M, Bischoff FR, Kutay U, Bork P, Hartmann E, Prehn S, Izaurralde E (1997). „Nová třída proteinů vázajících RanGTP“. J. Cell Biol. 138 (1): 65–80. doi:10.1083 / jcb.138.1.65. PMC 2139951. PMID 9214382.
- Scheffzek K, Ahmadian MR, Kabsch W, Wiesmüller L, Lautwein A, Schmitz F, Wittinghofer A (1998). „Komplex Ras-RasGAP: strukturální základ pro aktivaci GTPázy a její ztrátu u onkogenních mutantů Ras“. Věda. 277 (5324): 333–8. doi:10.1126 / science.277.5324.333. PMID 9219684.
- Mahajan R, Gerace L, Melchior F (1998). „Molekulární charakterizace modifikace SUMO-1 RanGAP1 a její role ve sdružení jaderných obálek“. J. Cell Biol. 140 (2): 259–70. doi:10.1083 / jcb.140.2.259. PMC 2132567. PMID 9442102.
- Kamitani T, Kito K, Nguyen HP, Fukuda-Kamitani T, Yeh ET (1998). „Charakterizace druhého člena rodiny sentrinů proteinů podobných ubikvitinu“. J. Biol. Chem. 273 (18): 11349–53. doi:10.1074 / jbc.273.18.11349. PMID 9556629.
- Okuma T, Honda R, Ichikawa G, Tsumagari N, Yasuda H (1999). „Modifikace SUMO-1 in vitro vyžaduje dva enzymatické kroky, E1 a E2.“ Biochem. Biophys. Res. Commun. 254 (3): 693–8. doi:10.1006 / bbrc.1998.9995. PMID 9920803.
- Hillig RC, Renault L, Vetter IR, Drell T, Wittinghofer A, Becker J (1999). "Krystalová struktura rna1p: nový záhyb pro protein aktivující GTPázu". Mol. Buňka. 3 (6): 781–91. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 80010-1. PMID 10394366.
- Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN , Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (1999). „Sekvence DNA lidského chromozomu 22“. Příroda. 402 (6761): 489–95. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.
- Nagase T, Nakayama M, Nakajima D, Kikuno R, Ohara O (2001). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XX. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 8 (2): 85–95. doi:10.1093 / dnares / 8.2.85. PMID 11347906.
- Bernier-Villamor V, Sampson DA, Matunis MJ, Lima CD (2002). „Strukturální základ pro konjugaci SUMO zprostředkovanou E2 odhalený komplexem mezi ubikvitinem konjugujícím enzymem Ubc9 a RanGAP1“. Buňka. 108 (3): 345–56. doi:10.1016 / S0092-8674 (02) 00630-X. PMID 11853669.
- Joseph J, Tan SH, Karpova TS, McNally JG, Dasso M (2002). „SUMO-1 cílí RanGAP1 na kinetochory a mitotická vřetena“. J. Cell Biol. 156 (4): 595–602. doi:10.1083 / jcb.200110109. PMC 2174074. PMID 11854305.
- Zhang H, Saitoh H, Matunis MJ (2002). „Enzymy modifikační dráhy SUMO se lokalizují na vlákna komplexu jaderných pórů“. Mol. Buňka. Biol. 22 (18): 6498–508. doi:10.1128 / MCB.22.18.6498-6508.2002. PMC 135644. PMID 12192048.
- Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
- Macauley MS, Errington WJ, Okon M, Schärpf M, Mackereth CD, Schulman BA, McIntosh LP (2005). „Strukturální a dynamická nezávislost isopeptidem vázaných RanGAP1 a SUMO-1“. J. Biol. Chem. 279 (47): 49131–7. doi:10,1074 / jbc.M408705200. PMID 15355965.