Pseudomonas sRNA - Pseudomonas sRNA

Pseudomonas sRNA jsou nekódující RNA (ncRNA), které byly předpovězeny bioinformatické program SRNApredict2. Tento program identifikuje domnělé sRNA hledáním společné lokalizace genetických rysů běžně spojených s geny kódujícími sRNA a výraz predikovaných sRNA bylo následně potvrzeno Northern blot analýza. Ukázalo se, že tyto sRNA jsou konzervovaný přes několik pseudomonas jejich funkce je však ještě třeba určit.^[1] Využití genetického přístupu Tet-Trap RNAT byly identifikovány geny post-transkripčně regulované posunem teploty: ptxS (podílí se na virulenci) a PA5194.^[2]

Viz také

Reference

^ Livny, J .; Brencic, A .; Lory, S .; Waldor, K. (2006). „Identifikace 17 sRNA Pseudomonas aeruginosa a predikce genů kódujících sRNA u 10 různých patogenů pomocí bioinformatického nástroje sRNAPredict2“ (Volný plný text). Výzkum nukleových kyselin. 34 (12): 3484–3493. doi:10.1093 / nar / gkl453. ISSN 0305-1048. PMC 1524904. PMID 16870723.^{[trvalý mrtvý odkaz ]}
^ Delvillani, Francesco; Sciandrone, Barbara; Peano, Clelia; Petiti, Luca; Berens, Christian; Georgi, Christiane; Ferrara, Silvia; Bertoni, Giovanni; Pasini, Maria Enrica (prosinec 2014). „Tet-Trap, genetický přístup k identifikaci bakteriálních RNA teploměrů: aplikace na Pseudomonas aeruginosa“. RNA. 20 (12): 1963–1976. doi:10.1261 / rna.044354.114. ISSN 1469-9001. PMC 4238360. PMID 25336583.

[pmid16870723-1] Livny, J .; Brencic, A .; Lory, S .; Waldor, K. (2006). „Identifikace 17 sRNA Pseudomonas aeruginosa a predikce genů kódujících sRNA u 10 různých patogenů pomocí bioinformatického nástroje sRNAPredict2“ (Volný plný text). Výzkum nukleových kyselin. 34 (12): 3484–3493. doi:10.1093 / nar / gkl453. ISSN 0305-1048. PMC 1524904. PMID 16870723.^{[trvalý mrtvý odkaz ]}

[2] Delvillani, Francesco; Sciandrone, Barbara; Peano, Clelia; Petiti, Luca; Berens, Christian; Georgi, Christiane; Ferrara, Silvia; Bertoni, Giovanni; Pasini, Maria Enrica (prosinec 2014). „Tet-Trap, genetický přístup k identifikaci bakteriálních RNA teploměrů: aplikace na Pseudomonas aeruginosa“. RNA. 20 (12): 1963–1976. doi:10.1261 / rna.044354.114. ISSN 1469-9001. PMC 4238360. PMID 25336583.

[1]

[2]