AsponA antisense RNA - AsponA antisense RNA
| AsponA antisense RNA | |
|---|---|
 Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence AsponA antisense RNA | |
| Identifikátory | |
| Rfam | RF02812 |
| Další údaje | |
| Domény | Bakterie |
| JÍT | GO termín musí začínat GO: |
| TAK | SO: 0000077,SO: 0000370 |
| PDB struktur | PDBe |
AsponA je malý asRNA přepsal antisense na gen 1A nazývaný protein vázající penicilin ponA. Byl identifikován RNAseq a exprese byla ověřena 5 'a 3' ZÁVOD experimenty v Pseudomanas aeruginosa. AsponA exprese byla regulována nahoru nebo dolů při různých antibiotických stresech. Díky své poloze může zabránit transkripci nebo translaci opačného genu.[1] Studie Wurtzel et al. a Ferrara et al. také detekoval jeho výraz.[2][3]
Viz také
Reference
- ^ Gómez-Lozano M, Marvig RL, Tulstrup MV, Molin S (září 2014). "Exprese antisense malých RNA v reakci na stres v Pseudomonas aeruginosa". BMC Genomics. 15: 783. doi:10.1186/1471-2164-15-783. PMC 4180829. PMID 25213728.
- ^ Wurtzel O, Yoder-Himes DR, Han K, Dandekar AA, Edelheit S, Greenberg EP, Sorek R, Lory S (září 2012). „Transkriptom jednoho nukleotidu s rozlišením Pseudomonas aeruginosa pěstovaný v tělesné teplotě“. PLoS patogeny. 8 (9): e1002945. doi:10.1371 / journal.ppat.1002945. PMC 3460626. PMID 23028334.
- ^ Ferrara S, Brugnoli M, De Bonis A, Righetti F, Delvillani F, Dehò G, Horner D, Briani F, Bertoni G (2012). „Srovnávací profilování kmenů Pseudomonas aeruginosa odhaluje rozdílnou expresi nových jedinečných a konzervovaných malých RNA“. PLOS ONE. 7 (5): e36553. doi:10.1371 / journal.pone.0036553. PMC 3349714. PMID 22590564.