Proton-dependentní oligopeptidový transportér - Proton-dependent oligopeptide transporter
| POT rodina | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | PTR2 | ||||||||
| Pfam | PF00854 | ||||||||
| InterPro | IPR000109 | ||||||||
| STRÁNKA | PDOC00784 | ||||||||
| TCDB | 2.A.17 | ||||||||
| OPM nadčeleď | 15 | ||||||||
| OPM protein | 2xut | ||||||||
| |||||||||
Bílkoviny Rodina protonově závislých oligopeptidových transportérů (POT) (nazývané také Rodina PTR (transport peptidů)) se nacházejí ve zvířatech, rostlinách, kvasnicích, archaea a obojí Gramnegativní a Grampozitivní bakterie, a jsou součástí hlavní pomocná rodina. Transport peptidů do buněk je dobře zdokumentovaným biologickým fenoménem, kterého je dosaženo specifickými, energeticky závislými transportéry, které se nacházejí v řadě různorodých organismů, jako jsou bakterie a lidé. The transportér oligopeptidů závislý na protonu (PTR) rodina proteinů se liší od Transportéry peptidů typu ABC a byla odhalena sekvenční analýzou řady nedávno objevených peptidových transportních proteinů.[1] Tyto proteiny, které se zdají být zapojeny hlavně do příjmu malých peptidů se současným příjmem protonu.[2]
Funkce
Zatímco většina členů rodiny POT katalyzuje peptid doprava, jeden je dusičnan permeát a člověk může přepravovat histidin, stejně jako peptidy. Některé z peptidových transportérů mohou také transportovat antibiotika. Fungují protony symport, ale substrát: H+ stechiometrie je variabilní: vysoce afinitní krysí PepT2 nosič katalyzuje příjem 2 a 3 H+ s neutrálními, respektive aniontovými dipeptidy, zatímco nosič s nízkou afinitou PepT1 katalyzuje absorpci jednoho H+ na neutrální peptid.[3][4]
Transportní reakce
Generalizovaná transportní reakce katalyzovaná proteiny rodiny POT je:
substrát (ven) + H (ven) → substrát (dovnitř) H+ (v)
Struktura a mechanismus
Proteiny mají délku přibližně 450-600 aminoacylových zbytků, přičemž eukaryotické proteiny jsou obecně delší než bakteriální proteiny. Vykazují 12 domnělých nebo zavedených transmembránové α-šroubovicové klíče.
Páry solný most interakce mezi transmembránovými šroubovicemi fungují v tandemu a zajišťují střídavý přenos přístupu v rámci rodiny PTR.[5] Klíčové role zbytků konzervovaných mezi bakteriálními a eukaryotickými homology naznačují konzervovaný mechanismus rozpoznávání a transportu peptidů, který byl v některých případech u jednotlivých druhů nenápadně upraven.
Podskupiny
- Transportér oligopeptidů, peptid: H + symportér InterPro: IPR004768
- Transportér aminokyselin / peptidů InterPro: IPR005279
Lidské proteiny obsahující tuto doménu
FP12591; PEPT1; PTR4; SLC15A1; SLC15A2; SLC15A3; SLC15A4; hPEPT1-RF;
Reference
- ^ Naider F, Becker JM, Steiner HY (1995). "Rodina PTR: nová skupina transportérů peptidů". Mol. Microbiol. 16 (5): 825–834. doi:10.1111 / j.1365-2958.1995.tb02310.x. PMID 7476181.
- ^ Skurray RA, Paulsen IT (1994). "Rodina POT transportních proteinů". Trends Biochem. Sci. 19 (10): 404. doi:10.1016/0968-0004(94)90087-6. PMID 7817396.
- ^ Bucking, Carol; Schulte, Patricia M. (01.04.2012). „Environmentální a nutriční regulace exprese a funkce dvou izoforem peptidových transportérů (PepT1) v euryhaline teleost“. Srovnávací biochemie a fyziologie. Část A, Molekulární a integrativní fyziologie. 161 (4): 379–387. doi:10.1016 / j.cbpa.2011.12.008. ISSN 1531-4332. PMID 22227314.
- ^ Chen, Xing-Zhen (29. ledna 1999). "Stechiometrie a kinetika vysokoafinitního H + vázaného peptidového transportéru PepT2". Journal of Biological Chemistry. 274 (5): 2773–2779. doi:10.1074 / jbc.274.5.2773. PMID 9915809.
- ^ Doki, Shintaro; Kato, Hideaki E .; Solcan, Nicolae; Iwaki, Masayo; Koyama, Michio; Hattori, Motoyuki; Iwase, Norihiko; Tsukazaki, Tomoya; Sugita, Yuji (09.07.2013). "Strukturální základ pro dynamický mechanismus protonově vázaného symportu pomocí peptidového transportéru POT". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 110 (28): 11343–11348. Bibcode:2013PNAS..11011343D. doi:10.1073 / pnas.1301079110. ISSN 1091-6490. PMC 3710879. PMID 23798427.
Do tato úprava, tento článek používá obsah z „2.A.17 Rodina oligopeptidových transportérů závislých na protonu (POT / PTR)“, který je licencován způsobem, který umožňuje opětovné použití v rámci Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License, ale ne pod GFDL. Je třeba dodržovat všechny příslušné podmínky.
 | Tento membránový protein –Příbuzný článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |