TAF1A - TAF1A - Wikipedia

TAF1A
Identifikátory
Aliasy	TAF1A, MGC: 17061, RAFI48, SL1, TAFI48, faktor spojený s proteinem vázajícím se na TATA, RNA polymeráza I podjednotka A
Externí ID	OMIM: 604903 MGI: 109578 HomoloGene: 4155 Genové karty: TAF1A
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	222,589,933 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• mikrotubulární cytoskelet; • Komplex transkripčních faktorů RNA polymerázy I.; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy I.; • transkripce z promotoru RNA polymerázy I.; • ukončení transkripce RNA polymerázy I.; • pozitivní regulace genové exprese, epigenetická; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • prodloužení transkripce z promotoru RNA polymerázy I.;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9015
	21339
	ENSG00000143498
	ENSMUSG00000072258
	Q15573; Q5JRA7
	P97357
	NM_001201536; NM_005681; NM_139352
	NM_001277957; NM_001277958; NM_001277959; NM_021466
	NP_001188465; NP_005672; NP_647603
	NP_001264886; NP_001264887; NP_001264888; NP_067441
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

TATA box-binding protein-associated associated RNA RNA polymerase I subunit A je enzym že u lidí je kódován TAF1A gen.^[4]^[5]

Funkce

Zahájení transkripce RNA polymerázou I vyžaduje vytvoření komplexu složeného z proteinu vázajícího TATA (TBP) a tří faktorů souvisejících s TBP (TAF) specifických pro RNA polymerázu I. Tento komplex, známý jako selektivní faktor 1 (SL1), váže se na základní promotor genů ribozomální RNA, aby správně umístil polymerázu, a působí jako kanál pro regulační signály. Tento gen kóduje nejmenší SL1-specifický TAF. Byly identifikovány dva přepisy kódující různé izoformy.^[5]

Interakce

Bylo prokázáno, že TAF1A komunikovat s Jaderný fosfoprotein bohatý na kyselý leucin 32, člen rodiny A^[6] a SADA bílkovin.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000143498 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Comai L, Zomerdijk JC, Beckmann H, Zhou S, Admon A, Tjian R (prosinec 1994). "Rekonstituce transkripčního faktoru SL1: výlučná vazba TBP podjednotkami SL1 nebo TFIID". Věda. 266 (5193): 1966–72. doi:10.1126 / science.7801123. PMID 7801123.
^ ^A ^b „Entrez Gene: TAF1A TATA box binding protein (TBP)-associated associated factor, RNA polymerase I, A, 48kDa“.
^ ^A ^b Seo SB, McNamara P, Heo S, Turner A, Lane WS, Chakravarti D (leden 2001). "Regulace acetylace a transkripce histonu pomocí INHAT, lidského buněčného komplexu obsahujícího onkoprotein". Buňka. 104 (1): 119–30. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00196-9. PMID 11163245.

Další čtení

Rudloff U, Eberhard D, Tora L, Stunnenberg H, Grummt I (1994). „Faktory spojené s TBP interagují s DNA a řídí druhovou specificitu transkripce RNA polymerázy I“. EMBO J.. 13 (11): 2611–6. PMC 395135. PMID 8013460.
Di Pietro C, Rapisarda A, Amico V, Bonaiuto C, Viola A, Scalia M, Motta S, Amato A, Engel H, Messina A, Sichel G, Grzeschik K, Purrello M (2000). „Genomická lokalizace lidských genů TAF1A, TAF1B a TAF1C kódující podjednotky TAF (I) 48, TAF (I) 63 a TAF (I) 110 obecného transkripčního iniciačního faktoru třídy SL1.“ Cytogenet. Cell Genet. 89 (1–2): 133–6. doi:10.1159/000015592. PMID 10894955.
Zhai W, Comai L (2000). "Represe transkripce RNA polymerázy I tumor supresorem p53". Mol. Buňka. Biol. 20 (16): 5930–8. doi:10.1128 / MCB.20.16.5930-5938.2000. PMC 86070. PMID 10913176.
Seo SB, McNamara P, Heo S, Turner A, Lane WS, Chakravarti D (2001). "Regulace acetylace a transkripce histonu pomocí INHAT, lidského buněčného komplexu obsahujícího onkoprotein". Buňka. 104 (1): 119–30. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00196-9. PMID 11163245.
Miller G, Panov KI, Friedrich JK, Trinkle-Mulcahy L, Lamond AI, Zomerdijk JC (2001). „hRRN3 je nezbytný pro nábor RNA polymerázy I zprostředkovaný SL1 na promotory genu rRNA“. EMBO J.. 20 (6): 1373–82. doi:10.1093 / emboj / 20.6.1373. PMC 145519. PMID 11250903.
Dynes JL, Xu S, Bothner S, Lahti JM, Hori RT (2004). „Karboxyl-konec směruje TAF (I) 48 do jádra a jádra a spojuje se s několika nukleárními importními receptory“. J. Biochem. 135 (3): 429–38. doi:10.1093 / jb / mvh051. PMID 15113842.
Yamamoto K, Yamamoto M, Hanada K, Nogi Y, Matsuyama T, Muramatsu M (2004). „Mnohočetné interakce protein-protein pomocí faktoru PAF49 asociovaného s RNA polymerázou I a role PAF49 v transkripci rRNA“. Mol. Buňka. Biol. 24 (14): 6338–49. doi:10.1128 / MCB.24.14.6338-6349.2004. PMC 434256. PMID 15226435.
Grandori C, Gomez-Roman N, Felton-Edkins ZA, Ngouenet C, Galloway DA, Eisenman RN, White RJ (2005). „c-Myc se váže na lidskou ribozomální DNA a stimuluje transkripci genů rRNA RNA polymerázou I“. Nat. Cell Biol. 7 (3): 311–8. doi:10.1038 / ncb1224. PMID 15723054.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000143498 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7801123-4] Comai L, Zomerdijk JC, Beckmann H, Zhou S, Admon A, Tjian R (prosinec 1994). "Rekonstituce transkripčního faktoru SL1: výlučná vazba TBP podjednotkami SL1 nebo TFIID". Věda. 266 (5193): 1966–72. doi:10.1126 / science.7801123. PMID 7801123.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: TAF1A TATA box binding protein (TBP)-associated associated factor, RNA polymerase I, A, 48kDa“.

[pmid11163245-6] A ^b Seo SB, McNamara P, Heo S, Turner A, Lane WS, Chakravarti D (leden 2001). "Regulace acetylace a transkripce histonu pomocí INHAT, lidského buněčného komplexu obsahujícího onkoprotein". Buňka. 104 (1): 119–30. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00196-9. PMID 11163245.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]