PTX3 - PTX3

Tento článek je o proteinu a genu. U alba 2014 viz PTX, sv. III.
PTX3
Identifikátory
AliasyPTX3, TNFAIP5, TSG-14, pentraxin 3
Externí IDOMIM: 602492 MGI: 104641 HomoloGene: 7500 Genové karty: PTX3
Umístění genu (člověk)
Chromozom 3 (lidský)
Chr.Chromozom 3 (lidský)[1]
Chromozom 3 (lidský)
Genomic location for PTX3
Genomic location for PTX3
Kapela3q25,32Start157,436,850 bp[1]
Konec157,443,633 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE PTX3 206157 at fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

5806

19288

Ensembl

ENSG00000163661

ENSMUSG00000027832

UniProt

P26022

P48759

RefSeq (mRNA)

NM_002852

NM_008987

RefSeq (protein)

NP_002843

NP_033013

Místo (UCSC)Chr 3: 157,44 - 157,44 MbChr 3: 66,22 - 66,23 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Protein související s Pentraxinem PTX3 také známý jako TNF-indukovatelný protein genu 14 (TSG-14) je a protein že u lidí je kódován PTX3 gen.[5][6]

Pentraxin 3 (ptx3) je členem skupiny pentraxin nadčeleď. Tato super rodina se vyznačuje cyklickou multimerní strukturou.[7]PTX3 je rychle produkován a uvolňován několika typy buněk, zejména mononukleárními fagocyty, dendritické buňky (DC), fibroblasty a endoteliální buňky v reakci na primární zánětlivé signály [např. mýtný receptor (TLR) zapojení, TNFa, IL-1 p ].[8][9] PTX3 se váže s vysokou afinitou ke komponentě komplementu C1q, extracelulární matricová složka TNFα indukovaný protein 6 (TNFAIP6; také nazývaný TNF stimulovaný gen 6, TSG-6) a vybrané mikroorganismy, včetně Aspergillus fumigatus a Pseudomonas aeruginosa.[10][11][12][13][14]PTX3 aktivuje klasická cesta doplňku aktivace a usnadňuje rozpoznávání patogenů pomocí makrofágy a DC.[9][10][12]

Struktura

Lidský a myší PTX3, lokalizovaný v syntenické oblasti chromozom 3 (q24-28), jsou vysoce konzervované, sdílejí 82% identických a 92% konzervovaných aminokyselin. Lidský gen PTX3 je organizován do tří exonů kódujících vedoucí peptid (který je štěpen ze zralého proteinu), amino-terminál doména a pentraxinová doména proteinu.

Přepisovaný protein PTX3 je dlouhý 381 aminokyselin, má předpokládanou molekulovou hmotnost 40 165 Da a skládá se z karboxy-terminál 203 aminokyselina dlouhá doména pentraxinu spojená s doménou amino-terminál 178 aminokyselinová dlouhá doména nesouvisí s jinými známými proteiny. Karboxyterminální doména PTX3 obsahuje kanonický podpis pentraxinu (HxCxS / TWxS) a dva konzervované cysteiny (Cys-210 a Cys-271) a sdílí 57% konzervovaných a 17% identických aminokyselin s krátkými pentraxiny. Přítomnost amino-vázaného glykosylace místo v karboxyterminální doméně v Asn -220 odpovídá za vyšší molekulovou hmotnost pozorovanou v SDS – STRÁNKA za redukčních podmínek (45 kDa na rozdíl od předpokládaných 40 kDa). V nativních podmínkách jsou protomery PTX3 sestaveny do multimerů.[11] The Krystalická struktura PTX3 dosud nebyla stanovena, avšak podle modelování, doména pentraxinu PTX3 se dobře přizpůsobuje terciárnímu záhybu MÍZA, s téměř všemi β-řetězce a α-šroubovice segmenty konzervovány.[15]

PTX3 v krvi

PTX3 se chová jako protein akutní fáze reakce, protože hladiny PTX3 v krvi, nízké za normálních podmínek (asi 25 ng / ml u myší, <2 ng / ml u lidí), rychle rostou (vrcholí za 6–8 h po indukci) a dramaticky (200–800 ng / ml) během endotoxický šok, sepse a další zánětlivé a infekční stavy, které korelují se závažností onemocnění. Hladiny PTX3 v mozkomíšním moku pomáhají rozlišovat mezi bakteriální a aseptickou meningoencefalitidou.[16] Za těchto podmínek je PTX3 rychlý marker pro primární lokální aktivaci imunita a zánět.[17][18][19][20][21]

Patogen versus apoptotické sebepoznání

Podobně jako ostatní členové rodiny pentraxinů se váže PTX3 apoptotické buňky, čímž inhibuje jejich rozpoznávání DC. K vazbě dochází pozdě v apoptotickém procesu a zvyšuje produkci cytokinů pomocí DC. Kromě toho zvyšuje preinkubace apoptotických buněk s PTX3 C1q vazba a depozice C3 na buněčný povrch, což naznačuje roli PTX3 v komplementem zprostředkované clearance apoptotických buněk.[22][23][24] Kromě toho v přítomnosti umírajících buněk PTX3 omezuje křížovou prezentaci antigenů odvozených od umírajících buněk. Tyto výsledky naznačují, že PTX3 má dvojí roli: ochranu před patogeny a kontrolu autoimunity.[24][25]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000163661 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027832 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Breviario F, d'Aniello EM, Golay J, Peri G, Bottazzi B, Bairoch A, Saccone S, Marzella R, Predazzi V, Rocchi M (listopad 1992). "Interleukin-1-indukovatelné geny v endotelových buňkách. Klonování nového genu souvisejícího s C-reaktivním proteinem a sérovou amyloidovou složkou P". The Journal of Biological Chemistry. 267 (31): 22190–7. PMID  1429570.
  6. ^ „Entrez Gene: PTX3 gen související s pentraxinem, rychle indukovaný IL-1 beta“.
  7. ^ Emsley J, White HE, O'Hara BP, Oliva G, Srinivasan N, Tickle IJ, Blundell TL, Pepys MB, Wood SP (leden 1994). "Struktura pentamerní složky lidského séra amyloidu P". Příroda. 367 (6461): 338–45. Bibcode:1994 Natur.367..338E. doi:10.1038 / 367338a0. PMID  8114934. S2CID  4284282.
  8. ^ Wirestam L, Enocsson H, Skogh T, Eloranta ML, Rönnblom L, Sjöwall C, Wetterö J (červenec 2017). „Interferon-α se shoduje s potlačenými hladinami pentraxinu-3 (PTX3) v systémovém lupus erythematodes a reguluje leukocytový PTX3 in vitro“. Klinická a experimentální imunologie. 189 (1): 83–91. doi:10.1111 / cei.12957. PMC  5461103. PMID  28257596.
  9. ^ A b Garlanda C, Bottazzi B, Bastone A, Mantovani A (2005). „Pentraxiny na křižovatce mezi vrozenou imunitou, zánětem, depozicí matrice a plodností žen“. Výroční přehled imunologie. 23: 337–66. doi:10.1146 / annurev.immunol.23.021704.115756. PMID  15771574.
  10. ^ A b Diniz SN, Nomizo R, Cisalpino PS, Teixeira MM, Brown GD, Mantovani A, Gordon S, Reis LF, Dias AA (duben 2004). "PTX3 funguje jako opsonin pro internalizaci zymosanu závislou na dectinu-1 makrofágy". Journal of Leukocyte Biology. 75 (4): 649–56. doi:10.1189 / jlb.0803371. PMID  14726497. S2CID  1172342.
  11. ^ A b Bottazzi B, Vouret-Craviari V, Bastone A, De Gioia L, Matteucci C, Peri G, Spreafico F, Pausa M, D'Ettorre C, Gianazza E, Tagliabue A, Salmona M, Tedesco F, Introna M, Mantovani A ( Prosince 1997). "Tvorba multimerů a rozpoznávání ligandu dlouhým pentraxinem PTX3. Podobnosti a rozdíly s krátkými p-pentraxiny C-reaktivním proteinem a sérovým amyloidem P". The Journal of Biological Chemistry. 272 (52): 32817–23. doi:10.1074 / jbc.272.52.32817. PMID  9407058.
  12. ^ A b Garlanda C, Hirsch E, Bozza S, Salustri A, De Acetis M, Nota R, Maccagno A, Riva F, Bottazzi B, Peri G, Doni A, Vago L, Botto M, De Santis R, Carminati P, Siracusa G, Altruda F, Vecchi A, Romani L, Mantovani A (listopad 2002). „Neredundantní role dlouhého pentraxinu PTX3 v vrozené imunitní reakci proti houbám“. Příroda. 420 (6912): 182–6. Bibcode:2002 Natur.420..182G. doi:10.1038 / nature01195. PMID  12432394. S2CID  4414588.
  13. ^ Nauta AJ, Bottazzi B, Mantovani A, Salvatori G, Kishore U, Schwaeble WJ, Gingras AR, Tzima S, Vivanco F, Egido J, Tijsma O, Hack EC, Daha MR, Roos A (únor 2003). "Biochemická a funkční charakterizace interakce mezi pentraxinem 3 a C1q". European Journal of Immunology. 33 (2): 465–73. doi:10.1002 / imu.200310022. PMID  12645945. S2CID  9479617.
  14. ^ Salustri A, Garlanda C, Hirsch E, De Acetis M, Maccagno A, Bottazzi B, Doni A, Bastone A, Mantovani G, Beck Peccoz P, Salvatori G, Mahoney DJ, Day AJ, Siracusa G, Romani L, Mantovani A ( Dubna 2004). „PTX3 hraje klíčovou roli v organizaci extracelulární matrix cumulus oophorus a při oplodnění in vivo“. Rozvoj. 131 (7): 1577–86. doi:10.1242 / dev.01056. PMID  14998931.
  15. ^ Introna M, Alles VV, Castellano M, Picardi G, De Gioia L, Bottazzai B, Peri G, Breviario F, Salmona M, De Gregorio L, Dragani TA, Srinivasan N, Blundell TL, Hamilton TA, Mantovani A (březen 1996) . "Klonování myší ptx3, nový člen rodiny genů pentraxinu exprimovaný na extrahepatálních místech". Krev. 87 (5): 1862–72. doi:10.1182 / krev. V87.5.1862.1862. PMID  8634434.
  16. ^ Zatta M, Di Bella S, Bottazzi B, Rossi F, D'Agaro P, Segat L a kol. (Prosinec 2019). "Stanovení hladin pentraxinu 3 v mozkomíšním moku během infekcí centrálního nervového systému". Evropský žurnál klinické mikrobiologie a infekčních nemocí. 39 (4): 665–670. doi:10.1007 / s10096-019-03767-w. PMID  31813079. S2CID  208812200.
  17. ^ Muller B, Peri G, Doni A, Torri V, Landmann R, Bottazzi B, Mantovani A (červenec 2001). „Cirkulující hladiny dlouhého pentraxinu PTX3 korelují se závažností infekce u kriticky nemocných pacientů“. Léčba kritické péče. 29 (7): 1404–7. doi:10.1097/00003246-200107000-00017. PMID  11445697. S2CID  1709839.
  18. ^ Fazzini F, Peri G, Doni A, Dell'Antonio G, Dal Cin E, Bozzolo E, D'Auria F, Praderio L, Ciboddo G, Sabbadini MG, Manfredi AA, Mantovani A, Querini PR (prosinec 2001). „PTX3 v vaskulitidách malých cév: nezávislý indikátor aktivity onemocnění vytvářený v místech zánětu“. Artritida a revmatismus. 44 (12): 2841–50. doi:10.1002 / 1529-0131 (200112) 44:12 <2841 :: AID-ART472> 3.0.CO; 2-6. PMID  11762945.
  19. ^ Mairuhu AT, Peri G, Setiati TE, Hack CE, Koraka P, Soemantri A, Osterhaus AD, Brandjes DP, van der Meer JW, Mantovani A, van Gorp EC (srpen 2005). "Zvýšené plazmatické hladiny dlouhého pentraxinu, pentraxinu 3, u těžkých infekcí virem dengue". Journal of Medical Virology. 76 (4): 547–52. doi:10.1002 / jmv.20397. PMID  15977234. S2CID  24762210.
  20. ^ Azzurri A, Sow OY, Amedei A, Bah B, Diallo S, Peri G, Benagiano M, D'Elios MM, Mantovani A, Del Prete G (leden 2005). „IFN-gama-indukovatelný protein 10 a plazmatické hladiny pentraxinu 3 jsou nástroje pro monitorování zánětu a aktivity onemocnění u infekce Mycobacterium tuberculosis“. Mikroby a infekce. 7 (1): 1–8. doi:10.1016 / j.micinf.2004.09.004. PMID  15716076.
  21. ^ Latini R, Maggioni AP, Peri G, Gonzini L, Lucci D, Mocarelli P, Vago L, Pasqualini F, Signorini S, Soldateschi D, Tarli L, Schweiger C, Fresco C, Cecere R, Tognoni G, Mantovani A (říjen 2004 ). „Prognostický význam dlouhého pentraxinu PTX3 při akutním infarktu myokardu“. Oběh. 110 (16): 2349–54. doi:10.1161 / 01.CIR.0000145167.30987.2E. PMID  15477419.
  22. ^ Gershov D, Kim S, Brot N, Elkon KB (listopad 2000). „C-reaktivní protein se váže na apoptotické buňky, chrání buňky před sestavením komponent terminálního komplementu a udržuje protizánětlivou vrozenou imunitní odpověď: důsledky pro systémovou autoimunitu“. The Journal of Experimental Medicine. 192 (9): 1353–64. doi:10.1084 / jem.192.9.1353. PMC  2193350. PMID  11067883.
  23. ^ Familian A, Zwart B, Huisman HG, Rensink I, Roem D, Hordijk PL, Aarden LA, Hack CE (červenec 2001). "Vazba složky séra amyloidu P na apoptotické buňky nezávislá na chromatinu". Journal of Immunology. 167 (2): 647–54. doi:10,4049 / jimmunol.167.2.647. PMID  11441067.
  24. ^ A b Rovere P, Peri G, Fazzini F, Bottazzi B, Doni A, Bondanza A, Zimmermann VS, Garlanda C, Fascio U, Sabbadini MG, Rugarli C, Mantovani A, Manfredi AA (prosinec 2000). „Dlouhý pentraxin PTX3 se váže na apoptotické buňky a reguluje jejich clearance dendritickými buňkami prezentujícími antigen“. Krev. 96 (13): 4300–6. doi:10,1182 / krev. V96.13.4300. PMID  11110705.
  25. ^ Baruah P, Propato A, Dumitriu IE, Rovere-Querini P, Russo V, Fontana R, Accapezzato D, Peri G, Mantovani A, Barnaba V, Manfredi AA (leden 2006). „Receptor pro rozpoznávání vzorů PTX3 je získáván na synapse mezi umírajícími a dendritickými buňkami a upravuje křížovou prezentaci vlastních, virových a nádorových antigenů“. Krev. 107 (1): 151–8. doi:10.1182 / krev-2005-03-1112. PMID  16166594.

Další čtení