Rodina PTS L-askorbátu - PTS L-Ascorbate Family - Wikipedia

Fosfotransferázová permeáza
Identifikátory
SymbolPTS
PfamPF03611
InterProIPR004703
TCDB4.A.7
OPM nadčeleď426
OPM protein5zov

The Rodina PTS L-askorbát (L-Asc) (TC # 4.A.7 ) zahrnuje nosiče specifické pro L-askorbát, a je součástí Nadčeleď PTS-AG. Jediný PTS permeáza rodiny L-Asc PTS permeací byla funkčně charakterizována. Toto je systém SgaTBA, přejmenovaný na UlaABC (utilization of L-Ascorbate) Yew a Gerlt.[1][2]

Systém SgaTBA

SgaTBA permeáza se skládá ze tří proteinů: SgaT, SgaB a SgaA. SgaT je protein 12 TMS, pravděpodobně velmi vzdáleně příbuzný s MFS hexuronátovou permeázou Escherichia coli (TC # 2.A.1.14.2 ), který pravděpodobně funguje jako protein PTS IIC[3][4]. Tento genový produkt, stejně jako SgaB a SgaA, jsou všechny nezbytné anaerobní Využití, transport a L-askorbát fosforylace.[5] Toto je první zdokumentovaný příklad, kdy dva cukerně specifické energetické vazebné proteiny PTS permeázy jsou více příbuzné proteinům dvou různých rodin. The sga regulace je řízena blízkým represorem YjfQ.[5][6]

Homologie

Homology SgaT, stejně jako jiné PTS proteinové homology, byly identifikovány u velkého počtu evolučně odlišných bakterie, ale ne v archaea nebo eukaryoty.[5] Mezi bakterie, které kódují homology SgaT, patří řada Gramnegativní proteobakterie, stejně jako mnoho nízkých a vysokých G + C Grampozitivní bakterie. Kromě druhů Corynebacterium, Streptomyces a Bacil, téměř všechny organismy mající homology SgaTBA jsou lidé / zvířata patogeny.

Několik organismů má dva nebo více paralogů SgaT, včetně E-coli, který má tři. V některých z homologů nalezených v jiných bakteriích jsou domény SgaB fúzovány C-koncem s doménami SgaT. Například to platí pro domnělé transportéry v Vibrio cholerae, Pasteurella multocida a Mycoplasma pulmonis. Homology SgaB a SgaA, ale ne SgaT, se také nacházejí v transkripční aktivátorové proteiny kde fungují spíše v regulaci než v přepravě cukru.[7]

Transportní reakce

Skupinová translokační reakce katalyzovaná SgaTBA je:

L-askorbát (out) → L-askorbát-6-fosfát (in)

Reference

  1. ^ Tchieu JH, Norris V, Edwards JS, Saier MH (červenec 2001). "Kompletní systém fosfotransferázy v Escherichia coli". Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology. 3 (3): 329–46. PMID  11361063.
  2. ^ Yew WS, Gerlt JA (leden 2002). „Využití L-askorbátu Escherichia coli K-12: přiřazení funkcí k produktům operonů yjf-sga a yia-sgb“. Journal of Bacteriology. 184 (1): 302–6. doi:10.1128 / jb.184.1.302-306.2002. PMC  134747. PMID  11741871.
  3. ^ Luo P, Yu X, Wang W, Fan S, Li X, Wang J (březen 2015). "Krystalová struktura transportéru vitaminu C s fosforylací". Přírodní strukturní a molekulární biologie. 22 (3): 238–41. doi:10.1038 / nsmb.2975. PMID  25686089.
  4. ^ Luo P, Dai S, Zeng J, Duan J, Shi H, Wang J (2018). „Konformace transportéru l-askorbátu směřující dovnitř naznačuje mechanismus výtahu“. Objev buněk. 4: 35. doi:10.1038 / s41421-018-0037-r. PMC  6048161. PMID  30038796.
  5. ^ A b C Zhang Z, Aboulwafa M, Smith MH, Saier MH (duben 2003). „Transportér askorbátu Escherichia coli“. Journal of Bacteriology. 185 (7): 2243–50. doi:10.1128 / jb.185.7.2243-2250.2003. PMC  151508. PMID  12644495.
  6. ^ Campos E, Aguilar J, Baldoma L, Badia J (listopad 2002). "Gen yjfQ kóduje represor yjfR-X regulonu (ula), který se podílí na metabolismu L-askorbátu v Escherichia coli". Journal of Bacteriology. 184 (21): 6065–8. doi:10.1128 / jb.184.21.6065-6068.2002. PMC  135402. PMID  12374842.
  7. ^ Greenberg DB, Stülke J, Saier MH (říjen 2002). "Analýza domény transkripčních regulátorů nesoucích regulační domény PTS". Výzkum v mikrobiologii. 153 (8): 519–26. doi:10.1016 / s0923-2508 (02) 01362-1. PMID  12437213.

Do tato úprava, tento článek používá obsah z „4.A.7 Rodina PTS L-askorbát (L-Asc)“, který je licencován způsobem, který umožňuje opětovné použití v rámci Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License, ale ne pod GFDL. Je třeba dodržovat všechny příslušné podmínky.