PNKD - PNKD
PNKD je zkratka pro neurologickou pohybovou poruchu člověka paroxysmální nekinezogenní dyskineze. Stejně jako mnoho jiných poruch lidské genetiky se PNKD také týká nemoci, genu nemoci a kódovaného proteinu. (PNKD) je a protein že u lidí je kódován PNKD gen.[5][6] Alternativní sestřih vede k transkripci tří izoformy. Myš ortolog se nazývá mozkový protein 17 (Brp17).
Struktura
Tento gen je umístěn na chromozomu 2 v pásu 2q35 a obsahuje 12 exony.[6] Alespoň tři izoformy různých délek (dlouhé, střední a krátké) lze vyrobit alternativním sestřihem tohoto genu. Zatímco genové produkty dlouhých (PNKD-L) a středních (PNKD-M) izoforem obsahují C-terminál β-laktamázová doména krátká (PNKD-S) izoforma, běžně označovaná jako regulátor myofibrillogeneze-1 (MR-1), obsahuje pouze tři exony a postrádá homologii k jakémukoli známému proteinu.[7][8] Tyto izoformy se také liší svou tkáňově specifickou expresí a subcelulární lokalizace. Konkrétně je PNKD-L vyjádřen pouze v centrální nervový systém zatímco PNKD-M a PNKD-S jsou všudypřítomně exprimovány v tkáních.[7] Kromě toho se PNKD-L lokalizuje do buněčná membrána, PNKD-S do cytoplazma a jádro a PNKD-M do mitochondrie.[9]
Funkce
Funkce proteinů PNKD není známa, ale dlouhé a střední izoformy PNKD obsahují konzervované β-laktamázová doména což naznačuje, že může fungovat jako enzym. Nejbližší savčí homolog k PNKD je HAGH, enzym zahrnuje dvoustupňovou reakci k hydrolýze SLG a produkci kyseliny D-mléčné a redukovaného GSH. Hydrolytická aktivita PNKD je však minimální.[7]
Dlouhá forma PNKD je neuronově specifická a kóduje synaptický protein, který se dominantně lokalizuje na presynaptickou membránu. Postsynaptická oblast a vezikulární struktura mají také příležitostně dlouhou formu PNKD. Dlouhá forma PNKD interaguje s presynaptickým proteinem RIM a inhibuje synaptickou exocytózu. PNKD s mutacemi onemocnění je méně účinný při inhibici, čímž se zvyšuje synaptické uvolňování. To by způsobilo nadměrné uvolňování neurotransmiterů v mozku a možná hlavní příčinu spouštění epilepsie u pacientů s PNKD.[10]
Klinický význam
Bodové mutace v PNKD exonu 1 způsobují u člověka dědičnou neurologickou poruchu pohybu, paroxysmální ne-kinezigenní dyskineze.[6] Nadměrná exprese PNKD byla také spojena s více druhy rakoviny, včetně duktální adenokarcinom pankreatu,[11] rakovina žaludku,[12] rakovina vaječníků,[13] a rakovina prsu[8] a může sloužit jako terapeutický cíl pro léčbu těchto rakovin nebo a biomarker pro hodnocení výsledku pacienta. Zapojené signální dráhy se mohou lišit v závislosti na rakovině. Například v buňkách lidské rakoviny prsu (MCF7) může PNKD podporovat proliferaci nádorových buněk aktivací MEK / ERK signální dráhy, zatímco v buňkách lidského hepatomu (HepG2) může PNKD fungovat přes MLC2 / FAK / AKT cesta.[8]
Interakce
PNKD bylo prokázáno komunikovat s:
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000127838 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026179 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Fink JK, Rainer S, Wilkowski J, Jones SM, Kume A, Hedera P, Albin R, Mathay J, Girbach L, Varvil T, Otterud B, Leppert M (červenec 1996). „Paroxysmální dystonická choreoatetóza: těsná vazba na chromozom 2q“. American Journal of Human Genetics. 59 (1): 140–5. PMC 1915128. PMID 8659518.
- ^ A b C "Entrez Gene: PNKD paroxysmální nekinezogenní dyskineze".
- ^ A b C Shen Y, Lee HY, Rawson J, Ojha S, Babbitt P, Fu YH, Ptácek LJ (červen 2011). „Mutace v PNKD způsobující paroxysmální dyskinezi mění štěpení a stabilitu proteinů“. Lidská molekulární genetika. 20 (12): 2322–32. doi:10,1093 / hmg / ddr125. PMC 3098736. PMID 21487022.
- ^ A b C Gong Y, He H, Liu H, Zhang C, Zhao W, Shao RG (srpen 2014). „Fosforylace regulátoru-1 myofibrillogeneze aktivuje signální dráhu MAPK a indukuje proliferaci a migraci v buňkách MCF7 lidské rakoviny prsu“. FEBS Dopisy. 588 (17): 2903–10. doi:10.1016 / j.febslet.2014.07.018. PMID 25066297. S2CID 38906043.
- ^ „PNKD - pravděpodobná hydroláza PNKD - Homo sapiens (člověk) - gen a protein PNKD“. www.uniprot.org. Citováno 2016-07-25.
- ^ A b C Shen Y, Ge WP, Li Y, Hirano A, Lee HY, Rohlmann A, Missler M, Tsien RW, Jan LY, Fu YH, Ptáček LJ (březen 2015). "Protein mutovaný v paroxysmální dyskinezi interaguje s proteinem aktivní zóny RIM a potlačuje exaptózu synaptických vezikul". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 112 (10): 2935–41. doi:10.1073 / pnas.1501364112. PMC 4364199. PMID 25730884.
- ^ Zhao CY, Guo ZJ, Dai SM, Zhang Y, Zhou JJ (říjen 2013). „Klinickopatologický a prognostický význam exprese proteinu regulátoru 1 myofibrillogeneze v duktálním adenokarcinomu pankreatu“. Biologie nádorů. 34 (5): 2983–7. doi:10.1007 / s13277-013-0862-4. PMID 23696030. S2CID 6019528.
- ^ Guo J, Dong B, Ji JF, Wu AW (říjen 2012). „Nadměrná exprese regulátoru myofibrillogeneze-1 je spojena se špatnou prognózou pacientů s rakovinou žaludku“. World Journal of Gastroenterology. 18 (38): 5434–41. doi:10,3748 / wjg.v18.i38.5434. PMC 3471113. PMID 23082061.
- ^ Lu RQ, Sun M, Gao X, Guo L (březen 2012). „[Exprese nového biomarkeru, MR-1S, u ovariálního karcinomu a jeho biologický význam]“. Zhonghua Zhong Liu Za Zhi [Chinese Journal of Oncology]. 34 (3): 176–81. doi:10.3760 / cma.j.issn.0253-3766.2012.03.004. PMID 22780969.