PIP4K2B - PIP4K2B

PIP4K2B
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1BO1, 3WZZ, 3X01, 3X02, 3X03, 3X04, 3X05, 3X06, 3X07, 3X08, 3X09, 3X0A, 3X0B, 3X0C
Identifikátory
Aliasy	PIP4K2B, PI5P4KB, PIP5K2B, PIP5KIIB, PIP5KIIbeta, PIP5P4KB, fosfatidylinositol-5-fosfát 4-kináza typu 2 beta
Externí ID	OMIM: 603261 MGI: 1934234 HomoloGene: 2634 Genové karty: PIP4K2B
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	38,800,126 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	97,744,704 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • vazba nukleotidů; • Aktivita 1-fosfatidylinositol-4-fosfát 5-kinázy; • kinázová aktivita; • aktivita fosfatidylinositol fosfát kinázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • ATP vazba; • Aktivita 1-fosfatidylinositol-3-fosfát 4-kinázy; • Aktivita 1-fosfatidylinositol-5-fosfát 4-kinázy; • aktivita homodimerizace proteinu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • buněčná membrána; • autofagozom; • endoplazmatické retikulum; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• metabolický proces fosfatidylinositolu; • pozitivní regulace sestavy autofagozomu; • fosforylace; • signální dráha receptoru buněčného povrchu; • regulace autofagie; • proces biosyntézy fosfatidylinositolu; • fosforylace fosfatidylinositolu; • regulace signalizace fosfatidylinositol 3-kinázy; • fosfolipidový metabolický proces;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8396
	108083
	ENSG00000277292; ENSG00000276293
	ENSMUSG00000018547
	P78356
	Q80XI4
	NM_003559; NM_138687
	NM_054051
	NP_003550
	NP_473392
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Fosfatidylinositol-5-fosfát 4-kináza typu 2 beta je enzym že u lidí je kódován PIP4K2B gen.^[5]^[6]^[7]^[8]

Protein kódovaný tímto genem katalyzuje fosforylace z fosfatidylinositol 4-fosfát na pátém hydroxyl z myo-inositol zvonit do formy fosfatidylinositol 4,5-bisfosfát. Tento gen je členem fosfatidylinositol-4-fosfát 5-kináza rodina. Kódovaná proteinová sekvence nevykazuje podobnost s jinou kinázy, ale protein vykazuje kinázovou aktivitu. Navíc kódovaný protein interaguje s p55 TNF receptor.^[8]

Interakce

PIP4K2B bylo prokázáno komunikovat s TNFRSF1A.^[5] Kromě toho bylo prokázáno, že PIP4K2B interaguje s PIP4K2A a může modulovat buněčnou lokalizaci PIP4K2A.^[9]

Struktura

Struktura PIP4K2B byla stanovena prostřednictvím Rentgenová krystalografie.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000276293 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000277292, ENSG00000276293 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000018547 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Castellino AM, Parker GJ, Boronenkov IV, Anderson RA, Chao MV (duben 1997). „Nová interakce mezi juxtamembránovou oblastí receptoru faktoru nekrotizující faktor p55 a fosfatidylinositol-4-fosfát-5-kinázou“. J Biol Chem. 272 (9): 5861–70. doi:10.1074 / jbc.272.9.5861. PMID 9038203.
^ Luoh SW, Venkatesan N, Tripathi R (únor 2004). „Nadměrná exprese amplifikovaného genu Pip4k2beta z 17q11-12 v buňkách rakoviny prsu poskytuje výhodu proliferace“. Onkogen. 23 (7): 1354–63. doi:10.1038 / sj.onc.1207251. PMID 14691457.
^ Rameh LE, Tolias KF, Duckworth BC, Cantley LC (listopad 1997). „Nová cesta pro syntézu fosfatidylinositol-4,5-bisfosfátu“. Příroda. 390 (6656): 192–6. Bibcode:1997 Natur.390..192R. doi:10.1038/36621. PMID 9367159. S2CID 4403301.
^ ^A ^b „Entrez Gene: PIP5K2B fosfatidylinositol-4-fosfát 5-kináza, typ II, beta“.
^ Bultsma, Yvette; Keune, Willem-Jan; Divecha, Nullin (01.09.2010). „PIP4Kβ interaguje s a moduluje nukleární lokalizaci vysoce aktivní izoformy PtdIns5P-4-kinázy PIP4Kα“. Biochemical Journal. 430 (2): 223–235. doi:10.1042 / bj20100341. ISSN 0264-6021. PMID 20583997.
^ Rao, Vibha D; Misra, Saurav; Boronenkov, Igor V; Anderson, Richard A; Hurley, James H (1998). "Struktura typu IIβ fosfatidylinositol fosfát kinázy". Buňka. 94 (6): 829–839. doi:10.1016 / s0092-8674 (00) 81741-9. PMID 9753329. S2CID 18221569.

Další čtení

Niiro H, Clark EA (2003). „Větve dráhy receptoru antigenu B buněk jsou směrovány pomocí proteinových kanálů Bam32 a Carma1“. Imunita. 19 (5): 637–40. doi:10.1016 / S1074-7613 (03) 00303-0. PMID 14614850.
Carpenter CL (2004). "Btk-dependentní regulace syntézy fosfoinositidů". Biochem. Soc. Trans. 32 (Pt 2): 326–9. doi:10.1042 / BST0320326. PMID 15046600.
Rao VD, Misra S, Boronenkov IV, et al. (1998). "Struktura typu II beta-fosfatidylinositolfosfát kinázy: proteinová kináza se zploštila pro mezifázovou fosforylaci". Buňka. 94 (6): 829–39. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81741-9. PMID 9753329. S2CID 18221569.
Boronenkov IV, Loijens JC, Umeda M, Anderson RA (1999). „Fosfoinositidové signální dráhy v jádrech jsou spojeny s jadernými skvrnami obsahujícími faktory zpracování pre-mRNA“. Mol. Biol. Buňka. 9 (12): 3547–60. doi:10,1091 / mbc.9.12.3547. PMC 25675. PMID 9843587.
Kutsenko AS, Gizatullin RZ, Al-Amin AN a kol. (2002). „NotI lemující sekvence: nástroj pro objev genů a ověření lidského genomu“. Nucleic Acids Res. 30 (14): 3163–70. doi:10.1093 / nar / gkf428. PMC 135748. PMID 12136098.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Lim J, Hao T, Shaw C a kol. (2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–14. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569. S2CID 13709685.
Richardson JP, Wang M, Clarke JH a kol. (2007). „Genomické značení endogenní fosfatidylinositol-5-fosfát-4-kinázy typu IIbeta v buňkách DT40 odhaluje nukleární lokalizaci“. Buňka. Signál. 19 (6): 1309–14. doi:10.1016 / j.cellsig.2007.01.010. PMC 1868964. PMID 17303380.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000276293 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000277292, ENSG00000276293 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000018547 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9038203-5] A ^b Castellino AM, Parker GJ, Boronenkov IV, Anderson RA, Chao MV (duben 1997). „Nová interakce mezi juxtamembránovou oblastí receptoru faktoru nekrotizující faktor p55 a fosfatidylinositol-4-fosfát-5-kinázou“. J Biol Chem. 272 (9): 5861–70. doi:10.1074 / jbc.272.9.5861. PMID 9038203.

[pmid14691457-6] Luoh SW, Venkatesan N, Tripathi R (únor 2004). „Nadměrná exprese amplifikovaného genu Pip4k2beta z 17q11-12 v buňkách rakoviny prsu poskytuje výhodu proliferace“. Onkogen. 23 (7): 1354–63. doi:10.1038 / sj.onc.1207251. PMID 14691457.

[pmid9367159-7] Rameh LE, Tolias KF, Duckworth BC, Cantley LC (listopad 1997). „Nová cesta pro syntézu fosfatidylinositol-4,5-bisfosfátu“. Příroda. 390 (6656): 192–6. Bibcode:1997 Natur.390..192R. doi:10.1038/36621. PMID 9367159. S2CID 4403301.

[entrez-8] A ^b „Entrez Gene: PIP5K2B fosfatidylinositol-4-fosfát 5-kináza, typ II, beta“.

[9] Bultsma, Yvette; Keune, Willem-Jan; Divecha, Nullin (01.09.2010). „PIP4Kβ interaguje s a moduluje nukleární lokalizaci vysoce aktivní izoformy PtdIns5P-4-kinázy PIP4Kα“. Biochemical Journal. 430 (2): 223–235. doi:10.1042 / bj20100341. ISSN 0264-6021. PMID 20583997.

[10] Rao, Vibha D; Misra, Saurav; Boronenkov, Igor V; Anderson, Richard A; Hurley, James H (1998). "Struktura typu IIβ fosfatidylinositol fosfát kinázy". Buňka. 94 (6): 829–839. doi:10.1016 / s0092-8674 (00) 81741-9. PMID 9753329. S2CID 18221569.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]