PDE8A - PDE8A

PDE8A
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3ECM, 3ECN
Identifikátory
Aliasy	PDE8A, HsT19550, fosfodiesteráza 8A
Externí ID	OMIM: 602972 MGI: 1277116 HomoloGene: 1957 Genové karty: PDE8A
EC číslo	3.1.4.53
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 15 (lidský)
Konec	85,139,145 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	81,334,533 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita diesterové hydrolázy fosforečné; • aktivita hydrolázy; • Aktivita 3 ', 5'-cyklického nukleotidu fosfodiesterázy; • vazba kovových iontů; • Aktivita 3 ', 5'-cyklické-AMP fosfodiesterázy; • vazba kinázy; • Aktivita 3 ', 5'-cyklické-GMP fosfodiesterázy;
Buněčná složka	• cytosol; • extracelulární exosom;
Biologický proces	• metabolický proces cyklických nukleotidů; • cAMP katabolický proces; • regulace transkripce, DNA-šablony; • signální transdukce; • pozitivní regulace fosforylace bílkovin; • negativní regulace buněčné smrti; • pozitivní regulace kaskády ERK1 a ERK2; • buněčná odpověď na stimul epidermálního růstového faktoru; • negativní regulace buněčné smrti vyvolané peroxidem vodíku; • Signální dráha receptoru spřaženého s G-proteinem;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5151
	18584
	ENSG00000073417
	ENSMUSG00000025584
	O60658
	O88502
NM_001243137; NM_002605; NM_173454; NM_173455; NM_173456;
	NM_173457
	NM_008803
	NP_001230066; NP_002596; NP_775656
	NP_032829
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Vysoce afinitní cAMP specifická a IBMX necitlivá 3 ', 5'-cyklická fosfodiesteráza 8A je enzym že u lidí je kódován PDE8A gen.^[5]^[6] Práce Sebastiaana Bolu a kol. ukázal, že 5 různých varianty přepisu a jejich odpovídající izoformy jsou vyjádřený v člověku makrofágy, a naznačuje, že tento protein může být vyžadován HIV-1 pro jeho replikace.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000073417 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025584 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Fisher DA, Smith JF, Pillar JS, St Denis SH, Cheng JB (červenec 1998). "Izolace a charakterizace PDE8A, nové lidské cAMP-specifické fosfodiesterázy". Biochem Biophys Res Commun. 246 (3): 570–577. doi:10.1006 / bbrc.1998.8684. PMID 9618252.
^ „Entrezův gen: PDE8A fosfodiesteráza 8A“.
^ Bol SM, Booiman T, Bunnik EM, Moerland PD, van Dort K, Strauss JF III, Sieberer M, Schuitemaker H, Kootstra NA, van 't Wout AB (září 2011). „Polymorfismus v faktoru závislosti na HIV-1 PDE8A ovlivňuje hladinu mRNA a replikaci HIV-1 v primárních makrofágech“. Virologie. 420 (1): 32–42. doi:10.1016 / j.virol.2011.08.013. PMID 21920574.

Další čtení

Bass BL (2002). „Editace RNA adenosindeaminázami, které působí na RNA“. Annu. Biochem. 71: 817–846. doi:10.1146 / annurev.biochem.71.110601.135501. PMC 1823043. PMID 12045112.
Zauli G, Milani D, Mirandola P a kol. (2001). „HIV-1 Tat protein down-reguluje expresi transkripčního faktoru CREB v neuronálních buňkách PC12 cestou fosfatidylinositol 3-kinázy / AKT / cyklické nukleosidové fosfodiesterázy“. FASEB J. 15 (2): 483–491. doi:10.1096 / fj.00-0354com. PMID 11156964.
Glavas NA, Ostenson C, Schaefer JB, et al. (2001). "Aktivace T buněk reguluje cyklické nukleotidové fosfodiesterázy 8A1 a 7A3". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 98 (11): 6319–6324. doi:10.1073 / pnas.101131098. PMC 33466. PMID 11371644.
Wang P, Wu P, Egan RW, Billah MM (2002). „Varianty sestřihu lidské fosfodiesterázy 8A: klonování, organizace genů a distribuce tkání“. Gen. 280 (1–2): 183–194. doi:10.1016 / S0378-1119 (01) 00783-1. PMID 11738832.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–16903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Gamanuma M, Yuasa K, Sasaki T a kol. (2003). "Srovnání enzymatické charakterizace a genové organizace rodiny cyklických nukleotidů fosfodiesterázy 8 u lidí". Buňka. Signál. 15 (6): 565–574. doi:10.1016 / S0898-6568 (02) 00146-8. PMID 12681444.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–45. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–2127. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wu P, Wang P (2005). „Per-Arnt-Sim doménově závislá asociace cAMP-fosfodiesterázy 8A1 s proteiny IkappaB“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (51): 17634–17639. doi:10.1073 / pnas.0407649101. PMC 539753. PMID 15596729.

Tento článek o gen na lidský chromozom 15 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000073417 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025584 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9618252-5] Fisher DA, Smith JF, Pillar JS, St Denis SH, Cheng JB (červenec 1998). "Izolace a charakterizace PDE8A, nové lidské cAMP-specifické fosfodiesterázy". Biochem Biophys Res Commun. 246 (3): 570–577. doi:10.1006 / bbrc.1998.8684. PMID 9618252.

[entrez-6] „Entrezův gen: PDE8A fosfodiesteráza 8A“.

[pmid21920574-7] Bol SM, Booiman T, Bunnik EM, Moerland PD, van Dort K, Strauss JF III, Sieberer M, Schuitemaker H, Kootstra NA, van 't Wout AB (září 2011). „Polymorfismus v faktoru závislosti na HIV-1 PDE8A ovlivňuje hladinu mRNA a replikaci HIV-1 v primárních makrofágech“. Virologie. 420 (1): 32–42. doi:10.1016 / j.virol.2011.08.013. PMID 21920574.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]