PASTA doména - PASTA domain - Wikipedia
| PASTA doména | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Kreslená reprezentace domény PASTA ze Staphylococcus aureus. Položka PDB 3m9g | |||||||||||
| Identifikátory | |||||||||||
| Symbol | TĚSTOVINY | ||||||||||
| Pfam | PF03793 | ||||||||||
| InterPro | IPR005543 | ||||||||||
| CHYTRÝ | TĚSTOVINY | ||||||||||
| STRÁNKA | PDOC51178 | ||||||||||
| SCOP2 | 1rp5 / Rozsah / SUPFAM | ||||||||||
| CDD | cd06573 | ||||||||||
| |||||||||||
The PASTA doména je malý proteinová doména které se mohou vázat na beta-laktam kruhová část různých β-laktamová antibiotika.[1] Doména byla původně objevena v roce 2002 Yeatsem a kolegy jako oblast podobnosti sekvence nalezená v proteiny vázající penicilin a kinázy podobné PknB nalezené v některých bakteriích. Název je zkratka odvozená z PBP And Serine /Threoninkináza Apřidružená doména.
Struktura
Doména PASTA přijímá strukturu složenou z alfa-šroubovice následovaný třemi beta vlákna. Nedávné strukturální studie ukazují, že extracelulární oblast PknB, která je složena ze čtyř domén PASTA, vykazuje lineární uspořádání domén.[2]
Distribuce druhů
Domény PASTA se nacházejí v různých bakteriálních druzích, včetně grampozitivních firmicutes a aktinobakterie.
Reference
- ^ Yeats C, Finn RD, Bateman A (září 2002). "Doména PASTA: doména vázající beta-laktam". Trends Biochem. Sci. 27 (9): 438–440. doi:10.1016 / s0968-0004 (02) 02164-3. PMID 12217513.
- ^ Barthe P, Mukamolova GV, Roumestand C, Cohen-Gonsaud M (květen 2010). „Struktura extracelulární domény PknB PASTA z mycobacterium tuberculosis naznačuje aktivaci kinázy závislou na ligandu“. Struktura. 18 (5): 606–15. doi:10.1016 / j.str.2010.02.013. PMID 20462494.