Nina Papavasiliou - Nina Papavasiliou

Nina Papavasiliou
Nina Papavasiliou z The Rockefeller University.jpg
Alma materRockefellerova univerzitaOberlin College
OceněníSearle Scholar, NIH Cena ředitele za projekt transformativního výzkumu, cena ERC Consolidator
Vědecká kariéra
PoleImunologie, Molekulární biologie
InstituceNěmecké centrum pro výzkum rakoviny, Rockefellerova univerzita, univerzita Yale
Doktorský poradceMichel C. Nussenzweig

Nina Papavasiliou je imunolog a profesor Helmholtz v divizi imunitní rozmanitosti na Německé centrum pro výzkum rakoviny v Heidelbergu v Německu. Je také mimořádnou profesorkou na Rockefellerova univerzita, kde dříve působila jako docentka a vedoucí Laboratoře biologie lymfocytů. Ona je nejlépe známá pro její práci v oblastech DNA a Úpravy RNA.

Vzdělání a časná kariéra

Papavasiliou získala bakalářský titul z Oberlin College v biologii v roce 1992. Poté dokončila doktorát na Rockefellerova univerzita v Michel C. Nussenzweig Laboratoř molekulární imunologie. Tam začala studovat jak B buňka receptory antigenu - nebo protilátky ukotven k buněčné membráně - podstoupit mutaci, aby mohli konkrétně rozpoznat konkrétní antigen a vyvolat imunitní odpověď.[1][2] Sledovala tento zájem Lékařská fakulta Yale, kde pracovala jako postdoktorandka v laboratoři Davida G. Schatze.[3][4]

Výzkum

Výzkum společnosti Papavasiliou se zaměřuje na demystifikaci toho, jak buňky a organismy diverzifikují a rozšiřují informace zakódované v jejich genomech, a to jak na úrovni DNA, tak RNA. Otevřela svoji laboratoř biologie lymfocytů v Rockefellerova univerzita v roce 2001 jako odborný asistent.[5] Hodně z rané práce její skupiny bylo děláno v kontextu adaptivní imunitní odpověď, který je schopen bojovat proti širokému spektru patogenů, které se snaží napadnout hostitele rychlou generací nových protilátek, které jsou schopny konkrétně rozpoznat daného útočníka. Její skupina pracovala na charakterizaci činnosti společnosti enzym známý jako aktivací vyvolaná cytidindeamináza (POMOC).[6][7] Změny AID cytidin (C) zbytky do uracil (U) v DNA, která je rozpoznána jako poškození DNA a opravena takovým způsobem, který zavádí thymidin (T), účinně mutující Cs na Ts v DNA. Proces je známý jako somatická hypermutace a je jak B buňky může rychle zavést mutace DNA do receptorů, které rozpoznávají útočníky, známé jako antigeny. Laboratoř společnosti Papavasiliou pracovala na pochopení toho, jak je exprese AID regulována v imunitním systému a jak AID cílí na určité geny pro mutaci.[8][9][10]

Papavasiliou také studuje Úpravy RNA v kontextu vrozená imunitní odpověď použitím sekvenování nové generace a bioinformatika přístupy k identifikaci a charakterizaci cílů úpravy RNA. Její skupina nejprve identifikovala nové cíle úpravy RNA z APOBEC1, který mutuje a cytosin do a uracil v přepisu RNA a dříve se předpokládalo, že pouze upravuje Apolipoprotein B (apoB) v tenkém střevě.[11] Její skupina se od té doby přesunula k pokusu charakterizovat potenciální roli, kterou může úprava APOBEC1 hrát mimo svou funkci s apoB.[12]

Papavasiliou se naposledy rozešel ke studiu mechanismů antigenní variace —Nebo jak patogeny mění své povrchové proteiny, aby unikly imunitní odpovědi - pomocí Trypanosoma brucei parazit, který způsobuje Africká spavá nemoc, jako modelový organismus. Její skupina vyvinula nové nástroje pro lepší pochopení dynamiky přepínání proteinového obalu v trypanosomech a pracuje na lepším porozumění mechanismům, kterými jsou trypanosomy schopné diverzifikovat své obalové proteiny v průběhu infekce.[13][14][15]

V roce 2016 se Papavasiliou přestěhovala do Německé centrum pro výzkum rakoviny zahájit svou laboratoř v divizi imunitní rozmanitosti s další podporou od a Evropská rada pro výzkum Konsolidační grant.[16][17]

Ocenění a vyznamenání

Reference

  1. ^ Papavasiliou, Fotini; Jankovič, Mila; Gong, Shiaoching; Nussenzweig, Michel C. (01.04.1997). "Kontrola přeskupení genů imunoglobulinu ve vývoji B buněk". Aktuální názor na imunologii. 9 (2): 233–238. doi:10.1016 / S0952-7915 (97) 80141-0. ISSN  0952-7915. PMID  9099793.
  2. ^ Papavasiliou, Fotini; Casellas, Rafael; Suh, Heikyung; Qin, Xiao-Feng; Besmer, Eva; Pelanda, Roberta; Nemazee, David; Rajewsky, Klaus; Nussenzweig, Michel C. (10.10.1997). „V (D) J rekombinace ve zralých B buňkách: mechanismus pro změnu protilátkových odpovědí“. Věda. 278 (5336): 298–301. doi:10.1126 / science.278.5336.298. ISSN  0036-8075. PMID  9323210.
  3. ^ Papavasiliou, F. Nina; Schatz, David G. (listopad 2000). „Dvouřetězcová DNA narušená buněčným cyklem v somatické hypermutaci imunoglobulinových genů“. Příroda. 408 (6809): 216–221. doi:10.1038/35041599. ISSN  0028-0836. PMID  11089977. S2CID  4407389.
  4. ^ Papavasiliou, F. Nina; Schatz, David G (duben 2002). "Somatická hypermutace imunoglobulinových genů". Buňka. 109 (2): S35 – S44. doi:10.1016 / S0092-8674 (02) 00706-7. ISSN  0092-8674. PMID  11983151. S2CID  15533869.
  5. ^ „F. Nina Papavasiliou - naši vědci“. Naši vědci. Archivovány od originál dne 03.07.2018. Citováno 2018-07-03.
  6. ^ Dickerson, Sarah K .; Market, Eleonora; Besmer, Eva; Papavasiliou, F. Nina (19. 5. 2003). „AID zprostředkovává hypermutaci deaktivací jednořetězcové DNA“. The Journal of Experimental Medicine. 197 (10): 1291–1296. doi:10.1084 / jem.20030481. ISSN  0022-1007. PMC  2193777. PMID  12756266.
  7. ^ Besmer, Eva; Market, Eleonora; Papavasiliou, F. Nina (červen 2006). „Transkripční elongační komplex řídí aktivaci indukovanou cytidindeaminázou zprostředkovanou deaminaci DNA“. Molekulární a buněčná biologie. 26 (11): 4378–4385. doi:10.1128 / MCB.02375-05. ISSN  0270-7306. PMC  1489098. PMID  16705187.
  8. ^ Crouch, Elizabeth E .; Li, Zhiyu; Takizawa, Makiko; Fichtner-Feigl, Stefan; Gourzi, Polyxeni; Montaño, Carolina; Feigenbaum, Lionel; Wilson, Patrick; Janz, Siegfried (14.05.2007). „Regulace exprese AID v imunitní odpovědi“. The Journal of Experimental Medicine. 204 (5): 1145–1156. doi:10.1084 / jem.20061952. ISSN  0022-1007. PMC  2118564. PMID  17452520.
  9. ^ Teng, Grace; Hakimpour, Paul; Landgraf, Pablo; Rýže, Amanda; Tuschl, Thomas; Casellas, Rafael; Papavasiliou, F. Nina (květen 2008). „MicroRNA-155 je negativní regulátor aktivací indukované cytidindeaminázy“. Imunita. 28 (5): 621–629. doi:10.1016 / j.immuni.2008.03.015. ISSN  1097-4180. PMC  2430982. PMID  18450484.
  10. ^ Delker, Rebecca K .; Zhou, Yanjiao; Strikoudis, Alexandros; Stebbins, C. Erec; Papavasiliou, F. Nina (2013-01-15). „Genetický screening založený na rozpustnosti identifikuje prstový protein RING 126 jako E3 ligázu pro aktivaci vyvolanou cytidindeaminázu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 110 (3): 1029–1034. doi:10.1073 / pnas.1214538110. ISSN  1091-6490. PMC  3549133. PMID  23277564.
  11. ^ Rosenberg, Brad R .; Hamilton, Claire E .; Mwangi, Michael M .; Dewell, Scott; Papavasiliou, F. Nina (únor 2011). „Sekvenování v celém transkriptomu odhaluje četné cíle pro úpravu mRNA APOBEC1 v 3 'UTR transkriptu“. Přírodní strukturní a molekulární biologie. 18 (2): 230–236. doi:10.1038 / nsmb.1975. ISSN  1545-9985. PMC  3075553. PMID  21258325.
  12. ^ Rayon-Estrada, Violeta; Harjanto, Dewi; Hamilton, Claire E .; Berchiche, Yamina A .; Gantman, Emily Conn; Sakmar, Thomas P .; Bulloch, Karen; Gagnidze, Khatuna; Harroch, Sheila (12. prosince 2017). „Epitranskriptomické profilování napříč buněčnými typy odhaluje asociace mezi editací RNA zprostředkovanou APOBEC1, výsledky genové exprese a buněčnou funkcí“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 114 (50): 13296–13301. doi:10.1073 / pnas.1714227114. ISSN  1091-6490. PMC  5740640. PMID  29167373.
  13. ^ „Parazit rozbije svou vlastní DNA, aby se vyhnul detekci“. ScienceDaily. Citováno 2018-07-03.
  14. ^ „Studie navrhuje nový způsob, jak pomoci imunitnímu systému bojovat proti parazitům se spavou nemocí“. EurekAlert!. Citováno 2018-07-03.
  15. ^ „Studie navrhuje nový způsob, jak pomoci imunitnímu systému bojovat proti parazitům“. EurekAlert!. Citováno 2018-07-03.
  16. ^ „Imunitní rozmanitost“. www.dkfz.de. Citováno 2018-07-03.
  17. ^ „PROJEKTY FINANCOVANÉ ERC“. ERC: Evropská rada pro výzkum. Citováno 2018-07-03.
  18. ^ „F. Nina Papavasiliou - naši vědci“. Naši vědci. Archivovány od originál dne 2018-10-11. Citováno 2018-10-10.
  19. ^ „Program Searle Scholars: F. Nina Papavasiliou (2003)“. www.searlescholars.net. Archivovány od originál dne 03.07.2018. Citováno 2018-07-03.
  20. ^ „F. Nina Papavasiliou - naši vědci“. Naši vědci. Archivovány od originál dne 2018-10-11. Citováno 2018-10-10.
  21. ^ Holland, Jennifer. „Cena G. Jeanette Thorbecke“. www.leukocytebiology.org. Citováno 2018-07-03.
  22. ^ „Nadace Vilcek - finalisté“. www.vilcek.org. Archivovány od originál dne 03.07.2018. Citováno 2018-07-03.
  23. ^ generátor, metaznačky. „Informace o projektu - NIH RePORTER - NIH Research Portfolio Online Reporting Tools Výdaje a výsledky“. projectreporter.nih.gov. Citováno 2018-07-03.