NDUFB2 - NDUFB2

NDUFB2
Identifikátory
Aliasy	NDUFB2, AGGG, CI-AGGG, NADH: ubichinon oxidoreduktázová podjednotka B2
Externí ID	OMIM: 603838 MGI: 1915448 HomoloGene: 3341 Genové karty: NDUFB2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	140,722,790 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Aktivita NADH dehydrogenázy (ubichinon);
Buněčná složka	• mitochondriální vnitřní membrána; • komplex mitochondriálních dýchacích řetězců I.; • transport elektronů; • membrána; • mitochondrie;
Biologický proces	• oxidačně-redukční proces; • transport mitochondriálních elektronů, NADH na ubichinon; • sestava komplexu mitochondriálních dýchacích řetězců I.;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4708
	68198
	ENSG00000090266
	ENSMUSG00000002416
	O95178
	Q9CPU2
	NM_004546
	NM_026612; NM_001358797
	NP_004537
	NP_080888; NP_001345726
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

NADH dehydrogenáza [ubichinon] 1 beta subkomplex podjednotka 2, mitochondriální je enzym že u lidí je kódován NDUFB2 gen.^[4]^[5]^[6] NADH dehydrogenáza (ubichinon) 1 beta subkomplex, 2, 8 kDa je doplňkovou podjednotkou NADH dehydrogenáza (ubichinon) komplex, který se nachází v mitochondriální vnitřní membrána. Je také známý jako Komplex I. a je největším z pěti komplexů elektronový transportní řetězec.^[7]

Struktura

Gen NDUFB2, umístěný na q rameni chromozom 7 v pozici 34 je dlouhý 9 966 párů bází a skládá se ze 4 exonů.^[6] NDUFB2 protein váží 12 kDa a je složen ze 105 aminokyselin.^[8]^[9] NDUFB2 je podjednotka enzymu NADH dehydrogenáza (ubichinon), největší z dýchacích komplexů. Konstrukce je ve tvaru L s dlouhou, hydrofobní transmembránový doména a hydrofilní doména pro periferní rameno, která zahrnuje všechna známá redoxní centra a vazebné místo NADH.^[7] NDUFB3 je jednou z přibližně 31 hydrofobních podjednotek, které tvoří transmembránovou oblast komplexu I. Bylo poznamenáno, že N-terminál hydrofobní doména má potenciál být složena do alfa šroubovice přes vnitřní mitochondriální membrána s C-terminál hydrofilní doména interagující s globulárními podjednotkami komplexu I. Vysoce konzervovaný dvoudoménová struktura naznačuje, že tato vlastnost je zásadní pro funkci proteinu a že hydrofobní doména působí jako kotva pro NADH dehydrogenáza (ubichinon) komplex na vnitřní mitochondriální membráně. Analýza hydropatie odhalila, že tato podjednotka a 4 další podjednotky mají celkový hydrofilní vzorec, i když se nacházejí v hydrofobní proteinové (HP) frakci komplexu I.^[6]

Funkce

Lidský gen NDUFB2 kóduje podjednotku Komplex I. z dýchací řetězec, který přenáší elektrony z NADH na ubichinon.^[6] NDUFB2 je však doplňkovou podjednotkou komplexu, o které se předpokládá, že se nepodílí na katalýze.^[10] Zpočátku, NADH váže se na komplex I a přenáší dva elektrony na isoalloxazinový kruh z flavin mononukleotid (FMN) protetické rameno k vytvoření FMNH₂. Elektrony jsou přenášeny řadou klastry železo-síra (Fe-S) v protetickém rameni a nakonec na koenzym Q10 (CoQ), který je redukován na ubichinol (CoQH₂). Tok elektronů mění redoxní stav proteinu, což vede ke konformační změně a strK. posun ionizovatelného postranního řetězce, který pumpuje čtyři vodíkové ionty z mitochondriální matrice.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000090266 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Emahazion T, Beskow A, Gyllensten U, Brookes AJ (listopad 1998). "Intronové radiační hybridní mapování 15 komplexních I genů řetězce transportu lidských elektronů". Cytogenet Cell Genet. 82 (1–2): 115–9. doi:10.1159/000015082. PMID 9763677. S2CID 46818955.
^ Loeffen JL, Triepels RH, van den Heuvel LP, Schuelke M, Buskens CA, Smeets RJ, Trijbels JM, Smeitink JA (leden 1999). "cDNA osmi nukleárních kódovaných podjednotek NADH: ubichinon oxidoreduktáza: charakterizace cDNA lidského komplexu dokončena". Biochem Biophys Res Commun. 253 (2): 415–22. doi:10.1006 / bbrc.1998.9786. PMID 9878551.
^ ^A ^b ^C ^d „Entrez Gene: NDUFB2 NADH dehydrogenáza (ubichinon) 1 beta subkomplex, 2, 8 kDa“.
^ ^A ^b ^C Voet D, Voet JG, Pratt CW (2013). „Kapitola 18“. Základy biochemie: život na molekulární úrovni (4. vydání). Hoboken, NJ: Wiley. str. 581–620. ISBN 978-0-470-54784-7.
^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečních proteomů pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.
^ „NADH dehydrogenáza [ubichinon] 1 beta podkomplex podjednotka 1“. Srdeční organelární proteinová atlasová znalostní databáze (COPaKB).
^ "NDUFB2 - NADH dehydrogenáza [ubichinon] 1 beta podkomplex podjednotka 2". UniProt: centrum pro informace o proteinech. Konsorcium UniProt. Citováno 2. dubna 2015.

Další čtení

Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Yeh CH, Pang JH, Wu YC a kol. (2004). „Diferenciální zobrazovací polymerázová řetězová reakce identifikuje nikotinamidadenindinukleotid-ubichinonoxidoreduktázu jako gen regulovaný ischemií / reperfúzí v kardiomyocytech“. Hruď. 125 (1): 228–35. doi:10,1378 / hrudník. 125.1.228. PMID 14718445.
Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR a kol. (2003). „Lidský chromozom 7: sekvence DNA a biologie“. Věda. 300 (5620): 767–72. Bibcode:2003Sci ... 300..767S. doi:10.1126 / science.1083423. PMC 2882961. PMID 12690205.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Zhang QH, Ye M, Wu XY a kol. (2001). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“. Genome Res. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.
Sanger Center, The; Washington University Genome Sequencing Cente, The (1999). „Směrem k úplné sekvenci lidského genomu“. Genome Res. 8 (11): 1097–108. doi:10.1101 / gr.8.11.1097. PMID 9847074.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000090266 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9763677-4] Emahazion T, Beskow A, Gyllensten U, Brookes AJ (listopad 1998). "Intronové radiační hybridní mapování 15 komplexních I genů řetězce transportu lidských elektronů". Cytogenet Cell Genet. 82 (1–2): 115–9. doi:10.1159/000015082. PMID 9763677. S2CID 46818955.

[pmid9878551-5] Loeffen JL, Triepels RH, van den Heuvel LP, Schuelke M, Buskens CA, Smeets RJ, Trijbels JM, Smeitink JA (leden 1999). "cDNA osmi nukleárních kódovaných podjednotek NADH: ubichinon oxidoreduktáza: charakterizace cDNA lidského komplexu dokončena". Biochem Biophys Res Commun. 253 (2): 415–22. doi:10.1006 / bbrc.1998.9786. PMID 9878551.

[entrez-6] A ^b ^C ^d „Entrez Gene: NDUFB2 NADH dehydrogenáza (ubichinon) 1 beta subkomplex, 2, 8 kDa“.

[Biochem-7] A ^b ^C Voet D, Voet JG, Pratt CW (2013). „Kapitola 18“. Základy biochemie: život na molekulární úrovni (4. vydání). Hoboken, NJ: Wiley. str. 581–620. ISBN 978-0-470-54784-7.

[COPaKB-8] Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečních proteomů pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.

[url_COPaKB-9] „NADH dehydrogenáza [ubichinon] 1 beta podkomplex podjednotka 1“. Srdeční organelární proteinová atlasová znalostní databáze (COPaKB).

[uniprot-10] "NDUFB2 - NADH dehydrogenáza [ubichinon] 1 beta podkomplex podjednotka 2". UniProt: centrum pro informace o proteinech. Konsorcium UniProt. Citováno 2. dubna 2015.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]