NDUFB10 - NDUFB10 - Wikipedia
NADH dehydrogenáza [ubichinon] 1 beta subkomplexní podjednotka 10 je enzym že u lidí je kódován NDUFB10 gen.[5][6][7] NADH dehydrogenáza (ubichinon) 1 beta subkomplexní podjednotka 10 je doplňkovou podjednotkou NADH dehydrogenáza (ubichinon) komplex, který se nachází v mitochondriální vnitřní membrána. Je také známý jako Komplex I. a je největším z pěti komplexů elektronový transportní řetězec.[8]
Gen
Gen NDUFB10 se nachází na p rameni chromozom 16 na pozici 13,3 a je 2 459 párů bází dlouhý.[9][10]
Struktura
NDUFB10 protein váží 21 kDa a je složen ze 172 aminokyselin.[9][10] NDUFB10 je podjednotka enzymu NADH dehydrogenáza (ubichinon), největší z dýchacích komplexů. Konstrukce je ve tvaru L s dlouhou, hydrofobní transmembránový doména a hydrofilní doména pro periferní rameno, která zahrnuje všechna známá redoxní centra a vazebné místo NADH.[8] Bylo poznamenáno, že N-terminál hydrofobní doména má potenciál být složena do alfa šroubovice přes vnitřní mitochondriální membrána s C-terminál hydrofilní doména interagující s globulárními podjednotkami komplexu I. Vysoce konzervovaný dvoudoménová struktura naznačuje, že tato vlastnost je zásadní pro funkci proteinu a že hydrofobní doména působí jako kotva pro NADH dehydrogenáza (ubichinon) komplex na vnitřní mitochondriální membráně.[7]
Funkce
Protein kódovaný tímto genem je doplňkovou podjednotkou více podjednotky NADH: ubichinon oxidoreduktáza (komplex I ), který se přímo nepodílí na katalýze. Savčí komplex I se skládá ze 45 různých podjednotek. Najde se na mitochondriální vnitřní membrána. Tento proteinový komplex má aktivitu NADH dehydrogenázy a aktivitu oxidoreduktázy. Přenáší elektrony z NADH do dýchací řetězec. Předpokládá se, že okamžitý akceptor elektronů pro enzym ubichinon. Alternativní sestřih dochází v tomto místě a byly identifikovány dvě varianty transkriptu kódující odlišné izoformy.[7] Zpočátku, NADH váže se na komplex I a přenáší dva elektrony na isoalloxazinový kruh z flavin mononukleotid (FMN) protetické rameno k vytvoření FMNH2. Elektrony jsou přenášeny řadou klastry železo-síra (Fe-S) v protetickém rameni a nakonec na koenzym Q10 (CoQ), který je redukován na ubichinol (CoQH2). Tok elektronů mění redoxní stav proteinu, což vede ke konformační změně a strK. posun ionizovatelného postranního řetězce, který pumpuje čtyři vodíkové ionty z mitochondriální matrice.[8]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000140990 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040048 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Emahazion T, Beskow A, Gyllensten U, Brookes AJ (listopad 1998). "Intronové radiační hybridní mapování 15 komplexních I genů řetězce transportu lidských elektronů". Cytogenetika a genetika buněk. 82 (1–2): 115–9. doi:10.1159/000015082. PMID 9763677. S2CID 46818955.
- ^ Loeffen JL, Triepels RH, van den Heuvel LP, Schuelke M, Buskens CA, Smeets RJ, Trijbels JM, Smeitink JA (prosinec 1998). "cDNA osmi nukleárních kódovaných podjednotek NADH: ubichinon oxidoreduktáza: charakterizace cDNA lidského komplexu dokončena". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 253 (2): 415–22. doi:10.1006 / bbrc.1998.9786. PMID 9878551.
- ^ A b C „Entrez Gene: NDUFB10 NADH dehydrogenáza (ubichinon) 1 beta subkomplex, 10, 22 kDa“.
- ^ A b C Voet D, Voet JG, Pratt CW (2013). „Kapitola 18“. Základy biochemie: život na molekulární úrovni (4. vydání). Hoboken, NJ: Wiley. str. 581–620. ISBN 978-0-470-54784-7.
- ^ A b Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečních proteomů pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.
- ^ A b "NADH dehydrogenáza [ubichinon] 1 beta podkomplex podjednotka 10". Srdeční organelární proteinová atlasová znalostní databáze (COPaKB).
Další čtení
- Sheffler DJ, Kroeze WK, Garcia BG, Deutch AY, Hufeisen SJ, Leahy P, Brüning JC, Roth BL (březen 2006). „p90 ribozomální S6 kináza 2 působí tonizující brzdou na signalizaci receptoru spojeného s G proteinem“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 103 (12): 4717–22. Bibcode:2006PNAS..103.4717S. doi:10.1073 / pnas.0600585103. PMC 1450237. PMID 16537434.
- Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, Sakakibara Y, Chiba J, Mizushima-Sugano J, Nakai K, Sugano S (září 2004). „Porovnání sekvencí lidských a myších genů odhaluje homologní blokovou strukturu v promotorových oblastech“. Výzkum genomu. 14 (9): 1711–8. doi:10,1101 / gr. 2435604. PMC 515316. PMID 15342556.
- Yano M, Terada K, Mori M (říjen 2003). „AIP je mitochondriální importní mediátor, který se váže jak na importní receptor Tom20, tak na preproteiny“. The Journal of Cell Biology. 163 (1): 45–56. doi:10.1083 / jcb.200305051. PMC 2173431. PMID 14557246.
- Daniels RJ, Peden JF, Lloyd C, Horsley SW, Clark K, Tufarelli C, Kearney L, Buckle VJ, Doggett NA, Flint J, Higgs DR (únor 2001). "Sekvence, struktura a patologie plně anotovaného terminálu 2 Mb krátkého ramene lidského chromozomu 16". Lidská molekulární genetika. 10 (4): 339–52. doi:10,1093 / hmg / 10,4,339. PMID 11157797.
- Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (říjen 2000). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“. Výzkum genomu. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.
Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.