Kovově kódovaná afinitní značka - Metal-coded affinity tag

Kovově kódovaná afinitní značka je metoda používaná pro kvantitativní proteomika podle hmotnostní spektrometrie který používá komplex kovových chelátů 1,4,7,10-tetraazacyklododekan-1,4,7,10-tetraacetát (DOTA) spojený s různými lanthanid ionty.[1][2] Kovové komplexy se připojují k cystein zbytky bílkoviny ve vzorku.

Proteomická analýza

Pro proteomika zdola nahoru mohou být proteiny odděleny dvourozměrná gelová elektroforéza a analyzovány laserová desorpce / ionizace za pomoci matice (MALDI) nebo ionizace elektrosprejem hmotnostní spektrometrie pro relativní kvantifikaci nebo hmotnostní spektrometrie s indukčně vázanou plazmou pro absolutní kvantifikaci. Pro proteomika shora dolů se analyzují nestrávené značené proteiny.

Viz také

Reference

  1. ^ Ahrends, R .; Pieper, S .; Kuhn, A .; Weisshoff, H .; Hamester, M .; Lindemann, T .; Scheler, C .; Lehmann, K .; Taubner, K .; Linscheid, M. W. (2007). „Kovově kódovaný přístup k afinitní značce ke kvantitativní proteomice“. Molekulární a buněčná proteomika. 6 (11): 1907–1916. doi:10,1074 / mcp.M700152-MCP200. ISSN  1535-9476. PMID  17627934.
  2. ^ Messana, Irene; Cabras, Tiziana; Iavarone, Federica; Vincenzoni, Federica; Urbani, Andrea; Castagnola, Massimo (2013). "Odhalení různých proteomických platforem". Journal of Separation Science. 36 (1): 128–139. doi:10.1002 / jssc.201200830. ISSN  1615-9306. PMID  23212829.