Martin Kreitman - Martin Kreitman
Martin Kreitman | |
|---|---|
| narozený | Martin Edward Kreitman |
| Alma mater | Harvardská Univerzita (PhD) University of Florida Univerzita Stony Brook (vysokoškolák) |
| Známý jako | McDonald – Kreitmanův test |
| Ocenění | MacArthur Fellows Program (1991) |
| Vědecká kariéra | |
| Instituce | University of Chicago Harvardská Univerzita Univerzita Stony Brook University of Florida |
| Teze | Variace nukleotidové sekvence alkohol dehydrogenázy v Drosophila melanogaster (1983) |
| Doktorský poradce | Richard Lewontin[1][2] |
| webová stránka | rybník |
Martin Edward Kreitman je Američan genetik na University of Chicago,[3][4][5] nejznámější pro McDonald – Kreitmanův test který se používá k odvození míry adaptivního vývoje v populačních genetických studiích.
Vzdělávání
Kreitman vystudoval Univerzita Stony Brook s Bakalář věd stupně biologie v roce 1975 a od University of Florida s Mistr vědy vzdělání v oboru Zoologie, v roce 1977. Pokračoval ve studiu na Harvardská Univerzita, promoval s Ph.D. v Populační genetika konkrétně Sekvence nukleotidů Varianta Alkohol dehydrogenáza v Drosophila melanogaster[6] v roce 1983.[7]
Výzkum
Laboratoř Kreitman provádí výzkum ve čtyřech hlavních oblastech:[8][9][10][11]
"Genetika molekulární populace a vývoj (Drosophila a Arabidopsis )"[12]
"Kanalizace ve vývoji a vývoji (Drosophila) "[12]
"Evoluční dynamika z odolnost vůči chorobám a patogenita (Arabidopsis) "[12]
Ceny a vyznamenání
- 1991 MacArthur Fellows Program
- šéfredaktor „Journal of Molecular Evolution „z roku 1999
- Vedoucí sekce části „Evoluční / srovnávací genetika“ Fakulty 1000 biologie [13]
- 2010 jmenován členem Americká akademie umění a věd [14]
Nedávné publikace
- Ludwig, M. Z .; Manu; Kittler, R .; White, K. P .; Kreitman, M. (2011). Malik, Harmit S (ed.). „Důsledky architektury Eukaryotic Enhancer pro dynamiku, vývoj a fitness genových výrazů“. Genetika PLOS. 7 (11): e1002364. doi:10.1371 / journal.pgen.1002364. PMC 3213169. PMID 22102826.
- On, B. Z .; Holloway, A. K .; Maerkl, S. J .; Kreitman, M. (2011). Petrov, Dmitrij A (ed.). "Pozitivní výběr podporuje obrat stránek vázajících transkripční faktory? Test s regulačními moduly Drosophila Cis". Genetika PLOS. 7 (4): e1002053. doi:10.1371 / journal.pgen.1002053. PMC 3084208. PMID 21572512.
- Lott, S.E .; Ludwig, M. Z .; Kreitman, M. (2011). „Evoluce a dědičnost raného embryonálního vzorování u Drosophila Simulans a D. Sechellia“. Vývoj. 65 (5): 1388–1399. doi:10.1111 / j.1558-5646.2010.01206.x. PMC 3083464. PMID 21121913.
- Bakker, E. G .; Traw, M. B .; Toomajian, C .; Kreitman, M .; Bergelson, J. (2008). „Nízké hladiny polymorfismu v genech, které řídí aktivaci obranné reakce u Arabidopsis thaliana“. Genetika. 178 (4): 2031–2043. doi:10.1534 / genetika.107.083279. PMC 2323794. PMID 18245336.
- Araki, H .; Innan, H .; Kreitman, M .; Bergelson, J. (2007). "Molekulární vývoj genů ostrovů patogenity u Pseudomonas viridiflava". Genetika. 177 (2): 1031–1041. doi:10.1534 / genetika.107.077925. PMC 2034611. PMID 17720907.
- Lott, S.E .; Kreitman, M .; Palsson, A .; Alekseeva, E .; Ludwig, M. Z. (2007). „Kanalizace segmentace a její vývoj v Drosophile“. Sborník Národní akademie věd. 104 (26): 10926–10931. Bibcode:2007PNAS..10410926L. doi:10.1073 / pnas.0701359104. PMC 1891814. PMID 17569783.
- Bakker, E. G. (2006). „Průzkum genomových polymorfismů R genů u Arabidopsis“. Rostlinná buňka online. 18 (8): 1803–1818. doi:10.1105 / tpc.106.042614. PMC 1533970. PMID 16798885.
- Bakker, E. G .; Stahl, E. A .; Toomajian, C .; Nordborg, M .; Kreitman, M .; Bergelson, J. (2006). "Distribuce genetických variací v rámci místních populací Arabidopsis thaliana a mezi nimi v rámci jejich druhů". Molekulární ekologie. 15 (5): 1405–1418. doi:10.1111 / j.1365-294X.2006.02884.x. PMID 16626462.
- Araki, H. (2006). „Polymorfismus přítomnosti / nepřítomnosti pro alternativní ostrovy patogenity v Pseudomonas viridiflava, patogenu Arabidopsis“. Sborník Národní akademie věd. 103 (15): 5887–5892. Bibcode:2006PNAS..103,5887A. doi:10.1073 / pnas.0601431103. PMC 1458668. PMID 16581904.
- Nordborg, M .; Hu, T. T .; Ishino, Y .; Jhaveri, J .; Toomajian, C .; Zheng, H .; Bakker, E .; Calabrese, P .; Gladstone, J .; Goyal, R .; Jakobsson, M .; Kim, S .; Morozov, Y .; Padhukasahasram, B .; Plagnol, V .; Rosenberg, N. A .; Shah, C .; Wall, J. D .; Wang, J .; Zhao, K .; Kalbfleisch, T .; Schulz, V .; Kreitman, M .; Bergelson, J. (2005). „Vzor polymorfismu u Arabidopsis thaliana“. PLOS Biology. 3 (7): e196. doi:10.1371 / journal.pbio.0030196. PMC 1135296. PMID 15907155.
- Ludwig, M. Z .; Palsson, A .; Alekseeva, E .; Bergman, C. M .; Nathan, J .; Kreitman, M. (2005). "Funkční vývoj cis-regulačního modulu". PLOS Biology. 3 (4): e93. doi:10.1371 / journal.pbio.0030093. PMC 1064851. PMID 15757364.
- Kreitman, M .; Di Rienzo, A. (2004). Msgstr "Vyrovnávací nároky na vyvažování výběru". Trendy v genetice. 20 (7): 300–304. doi:10.1016 / j.tig.2004.05.002. PMID 15219394.
- Goss, E. M .; Kreitman, M .; Bergelson, J. (2004). "Genetická rozmanitost, rekombinace a kryptické clady u Pseudomonas viridiflava infikující přírodní populace Arabidopsis thaliana". Genetika. 169 (1): 21–35. doi:10.1534 / genetika.104.031351. PMC 1448860. PMID 15489535.
- Mauricio, R .; Stahl, E. A .; Korves, T .; Tian, D .; Kreitman, M .; Bergelson, J. (2003). "Přirozený výběr pro polymorfismus v genu odolnosti vůči chorobám Rps2 z Arabidopsis thaliana". Genetika. 163 (2): 735–746. PMC 1462445. PMID 12618410.
- Tian, D .; Traw, M. B .; Chen, J. Q .; Kreitman, M .; Bergelson, J. (2003). „Fitness náklady na rezistenci u Arabidopsis thaliana zprostředkovanou R-geny“. Příroda. 423 (6935): 74–77. Bibcode:2003Natur.423 ... 74T. doi:10.1038 / nature01588. PMID 12721627.
- Toomajian, C .; Ajioka, R. S .; Jorde, L. B .; Kushner, J. P .; Kreitman, M. (2003). „Metoda pro detekci nedávné selekce v lidském genomu z odhadů alelového věku“. Genetika. 165 (1): 287–297. PMC 1462736. PMID 14504236.
- Tian, D. (2002). "Podpis vyvážení výběru v Arabidopsis". Sborník Národní akademie věd. 99 (17): 11525–11530. Bibcode:2002PNAS ... 9911525T. doi:10.1073 / pnas.172203599. PMC 123289. PMID 12172007.
- Toomajian, C .; Kreitman, M. (2002). "Variace sekvence a struktura haplotypu na lidském HFE lokusu". Genetika. 161 (4): 1609–1623. PMC 1462210. PMID 12196404.
- Jakob, K .; Goss, E. M .; Araki, H .; Van, T .; Kreitman, M .; Bergelson, J. (2002). „Pseudomonas viridiflava a P. Syringae - přírodní patogeny Arabidopsis thaliana“. Molekulární interakce rostlin a mikrobů. 15 (12): 1195–1203. doi:10.1094 / MPMI.2002.15.12.1195. PMID 12481991.
- Comeron, J. M .; Kreitman, M. (2002). „Populační, evoluční a genomické důsledky výběru interference“. Genetika. 161 (1): 389–410. PMC 1462104. PMID 12019253.
- Nordborg, M .; Borevitz, J. O .; Bergelson, J .; Berry, C. C .; Chory, J .; Hagenblad, J .; Kreitman, M .; Maloof, J. N .; Noyes, T .; Oefner, P. J .; Stahl, E. A .; Weigel, D. (2002). "Rozsah vazebné nerovnováhy u Arabidopsis thaliana". Genetika přírody. 30 (2): 190–193. doi:10.1038 / ng813. PMID 11780140.
- Bergman, C. M .; Kreitman, M. (2001). „Analýza konzervované nekódující DNA v Drosophile odhaluje podobná omezení v intergenních a intronových sekvencích“. Výzkum genomu. 11 (8): 1335–1345. doi:10,1101 / gr. 178701. PMID 11483574.
- Bergelson, J .; Kreitman, M .; Stahl, E. A .; Tian, D. (2001). „Evoluční dynamika rostlinných R genů“. Věda. 292 (5525): 2281–2285. doi:10.1126 / science.1061337. PMID 11423651.
- Comeron, J. M .; Kreitman, M. (2000). „Korelace mezi délkou intronu a rekombinací v drosophile. Dynamická rovnováha mezi mutačními a selektivními silami“. Genetika. 156 (3): 1175–1190. PMC 1461334. PMID 11063693.
- Ludwig, M. Z .; Bergman, C .; Patel, N. H .; Kreitman, M. (2000). "Důkazy pro stabilizaci výběru v eukaryotickém zesilovacím prvku". Příroda. 403 (6769): 564–567. Bibcode:2000Natur.403..564L. doi:10.1038/35000615. PMID 10676967.
- Bergelson, J .; Stahl, E. A .; Dwyer, G .; Mauricio, R .; Kreitman, M. (1999). "Dynamika polymorfismu rezistence vůči chorobám na lokusu Rpm1 Arabidopsis". Příroda. 400 (6745): 667–671. Bibcode:1999 Natur.400..667S. doi:10.1038/23260. PMID 10458161.
- Comeron, J. M .; Kreitman, M .; Aguadé, M. (1999). „Přirozený výběr na synonymních místech koreluje s délkou genu a rekombinací v Drosophile“. Genetika. 151 (1): 239–249. PMC 1460462. PMID 9872963.
- Ludwig, M. Z .; Patel, N. H .; Kreitman, M. (1998). "Funkční analýza vývoje předvečer zesilovače pruhů 2 v Drosophile: Pravidla pro zachování a změnu". Rozvoj. 125 (5): 949–958. PMID 9449677.
Reference
- ^ „K 30. výročí sekvenování DNA v populační genetice | Přál bych si, abys mě rozzlobil dříve“. Archivovány od originál dne 06.08.2013.
- ^ Keith, T. P .; Riley, M. A .; Kreitman, M.; Lewontin, R. C.; Curtis, D .; Chambers, G. (1987). "Pořadí strukturálního genu pro xanthin dehydrogenázu (růžový lokus) v Drosophila melanogaster". Genetika. 116 (1): 67–73. PMC 1203122. PMID 3036646.
- ^ http://pondside.uchicago.edu/ecol-evol/people/kreitman.html
- ^ „Martin Kreitman | Financování z obnovy zákona | University of Chicago“.
- ^ Publikace Martina Kreitmana indexováno podle Scopus bibliografická databáze. (vyžadováno předplatné)
- ^ Kreitman, Martin Edward (1983). Variace nukleotidové sekvence alkohol dehydrogenázy v Drosophila melanogaster (Disertační práce). Harvardská Univerzita. ProQuest 303271509.
- ^ „Archivovaná kopie“. Archivovány od originál dne 10.06.2010. Citováno 2010-04-25.CS1 maint: archivovaná kopie jako titul (odkaz)
- ^ Kreitman, M. (1983). „Nukleotidový polymorfismus na lokusu alkoholdehydrogenázy Drosophila melanogaster“. Příroda. 304 (5925): 412–417. Bibcode:1983 Natur.304..412K. doi:10.1038 / 304412a0. PMID 6410283.
- ^ McDonald, J. H .; Kreitman, Martin (1991). „Adaptivní vývoj bílkovin na lokusu Adh v Drosophile“. Příroda. 351 (6328): 652–654. Bibcode:1991 Natur.351..652M. doi:10.1038 / 351652a0. PMID 1904993.
- ^ Hudson, R. R .; Kreitman, M .; Aguadé, M. (1987). „Test neutrální molekulární evoluce na základě nukleotidových údajů“. Genetika. 116 (1): 153–159. PMC 1203113. PMID 3110004.
- ^ Kreitman, Martin (2000). "Metody detekce výběru v populacích s aplikacemi na člověka". Roční přehled genomiky a lidské genetiky. 1: 539–559. doi:10.1146 / annurev.genom.1.1.539. PMID 11701640.
- ^ A b C d "Fakulta | Ekologie a evoluce | University of Chicago". Archivovány od originál dne 06.08.2013.
- ^ http://f1000biology.com/about/members/8008
- ^ http://www.igsb.org/news/martin-kreitman-named-fellow-of-the-american-academy-of-arts-and-sciences/
externí odkazy
- „Martin Kreitman“, Scientific Commons