Seznam počítačově podporovaného softwaru pro organickou syntézu - List of computer-assisted organic synthesis software
Počítač software pro počítačem podporovaná organická syntéza (CAOS) se používá v organická chemie a výpočetní chemie usnadnit úkoly navrhování a předvídání chemické reakce. Problém CAOS se omezuje na identifikaci řady chemických reakcí, které mohou z výchozích materiálů vytvořit požadovaný cíl molekula. Algoritmy CAOS obvykle používají dva databáze: první ze známých chemických reakcí a druhá ze známých výchozích materiálů (tj. obvykle komerčně dostupné molekuly). Žádoucí syntetické plány stojí méně, mají vysoký výtěžek a nepoužívejte nebezpečné reakce a meziprodukty. Typicky se jedná o problém plánování, v CAOS bylo dosaženo významného pokroku.
Některé příklady balíčků CAOS jsou:
- Spaya - Volně přístupný nástroj pro plánování retrosyntézy poskytovaný společností Iktos
- WODCA - žádná zkušební verze; proprietární software[1]
- Organic Synthesis Exploration Tool (OSET) - open-source software opuštěný[2]
- CHIRON - žádná zkušební verze; proprietární software[3]
- SynGen - demo verze; proprietární software; jedinečný program pro automatické generování organické syntézy; se zaměřuje na generování nejkratších a nejlevnějších syntetických cest pro danou cílovou organickou sloučeninu, a je tak užitečným nástrojem pro plánování syntézy
- LHASA - demo k dispozici, ale není propojeno (?); proprietární software
- SYLVIA - demo verze; proprietární software; rychle hodnotí snadnost syntézy organických sloučenin; mohou upřednostňovat tisíce struktur (např. generovaných de novo designovými experimenty nebo získávaných z velkých virtuálních složených knihoven) podle jejich syntetické složitosti[4]
- ChemPlanner (dříve ARChem - Route Designer) - je expertní systém pomoci chemikům navrhnout životaschopné syntetické cesty pro jejich cílové molekuly the znalostní báze reakčních pravidel je algoritmicky odvozeno z reakčních databází a komerčně dostupné výchozí materiály se používají jako ukončovací body pro retrosyntetické vyhledávání
- ICSYNTH - počítačový návrhový nástroj pro syntézu, který umožňuje chemikům generovat syntetické dráhy pro cílovou molekulu a vícekrokový interaktivní syntézní strom; v jeho jádru je algoritmická chemická znalostní báze transformačních knihoven, které jsou automaticky generovány z reakčních databází.[5]
- Chematica (Nyní známý jako Synthia)
Viz také
- Srovnání softwaru pro modelování molekulární mechaniky
- Software pro molekulární design
- Editor molekul
- Molekulární modelování na GPU
- Seznam softwaru pro modelování nanostruktur
- Semi-empirické metody kvantové chemie
- Výpočtové chemické metody ve fyzice pevných látek, s periodickými okrajovými podmínkami
- Programy valenčních vazeb