LRRC8A - LRRC8A

LRRC8A
Identifikátory
Aliasy	LRRC8A, AGM5, LRRC8, SWELL1, repetice bohatá na leucin obsahující 8 členů rodiny A, repetice bohatá na leucin obsahující 8 členů rodiny A, repetice bohaté na leucin obsahující 8 VRAC podjednotky A
Externí ID	OMIM: 608360 MGI: 2652847 HomoloGene: 18617 Genové karty: LRRC8A
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	128,918,039 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	30,263,790 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita aniontového kanálu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • objemově citlivá aktivita aniontového kanálu; • identická vazba na protein;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • povrch buňky; • komplex iontových kanálů; • membrána; • cytoplazma; • buněčná membrána; • integrální součást plazmatické membrány;
Biologický proces	• diferenciace pre-B buněk; • reakce na osmotický stres; • homeostáza objemu buněk; • diferenciace buněk; • iontový transport; • transport aniontů; • regulace aniontové dopravy; • aniontový transmembránový transport; • signální transdukce; • transmembránová doprava; • doprava; • transport anorganických aniontů; • transport taurinu; • aspartátový transport; • hexamerizace bílkovin;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	56262
	241296
	ENSG00000136802
	ENSMUSG00000007476
	Q8IWT6
	Q80WG5
	NM_001127244; NM_001127245; NM_019594
	NM_177725
	NP_001120716; NP_001120717; NP_062540
	NP_808393
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Na leucin bohatý protein 8A s obsahem opakování je protein že u lidí je kódován LRRC8A gen.^[5] Vědci zjistili, že tento protein spolu s dalšími proteiny LRRC8 LRRC8B, LRRC8C, LRRC8D, a LRRC8E, je podjednotka heteromerního proteinu aniontový kanál regulovaný objemem (VRAC).^[6] (VRAC) jsou zásadní pro regulaci velikosti buněk transportem chloridových iontů a různých organických osmolytů, jako je taurin nebo glutamát, přes plazmatickou membránu,^[7] a to není jediná funkce, se kterou jsou tyto kanály spojeny.

Zatímco LRRC8A je jedním z mnoha proteinů, které mohou být součástí VRAC, je nejdůležitější podjednotkou pro schopnost kanálu fungovat.^[8]^[9] I když víme, že je to nezbytné pro funkci VRAC, jiné studie zjistily, že to není dostatečné pro celou škálu obvyklých aktivit VRAC.^[10] Zde přicházejí další proteiny LRRC8, protože odlišné složení těchto podjednotek ovlivňuje rozsah specificity pro VRAC.^[11]^[12]

Transmembránová část proteinů LRRC8 je podobná jako v Pannexiny.^[13] Samotný LRRC8A může tvořit hexamerní VRAC, pro který byla stanovena cyro-EM struktura v jeho myších a lidských verzích.^[14]^[15]^[16]

Kromě své role ve VRAC je také spojena s proteinovou rodinou LRRC8 agamaglobulinemie -5.^[17]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136802 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000007476 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: LRRC8A, bohatý na leucin obsahující 8 rodin, člen A“.
^ Voss FK, Ullrich F, Münch J, Lazarow K, Lutter D, Mah N, Andrade-Navarro MA, von Kries JP, Stauber T, Jentsch TJ (květen 2014). „Identifikace heteromeru LRRC8 jako základní složky objemově regulovaného aniontového kanálu VRAC“ (PDF). Věda. 344 (6184): 634–8. Bibcode:2014Sci ... 344..634V. doi:10.1126 / science.1252826. PMID 24790029. S2CID 24709412.
^ Jentsch TJ (květen 2016). "VRAC a další iontové kanály a transportéry v regulaci objemu buněk a dále". Nature Reviews Molecular Cell Biology. 17 (5): 293–307. doi:10.1038 / nrm.2016.29. PMID 27033257. S2CID 40565653.
^ Hyzinski-García MC, Rudkouskaya A, Mongin AA (listopad 2014). „Protein LRRC8A je nepostradatelný pro uvolňování excitačních aminokyselin v astrocytech aktivovaných otokem a ATP“. The Journal of Physiology. 592 (22): 4855–62. doi:10.1113 / jphysiol.2014.278887. PMC 4259531. PMID 25172945.
^ Yamada T, Wondergem R, Morrison R, Yin VP, Strange K (říjen 2016). „Protein LRRC8A bohatý na leucin je nezbytný pro Cl-proudy aktivované otokem a embryonální vývoj u zebrafish“. Fyziologické zprávy. 4 (19): e12940. doi:10,14814 / phy2.12940. PMC 5064130. PMID 27688432.
^ Okada T, Islam MR, Tsiferova NA, Okada Y, Sabirov RZ (březen 2017). „Specifické a zásadní, ale nedostatečné role LRRC8A v činnosti objemově citlivého ven směřujícího aniontového kanálu (VSOR)“. Kanály. 11 (2): 109–120. doi:10.1080/19336950.2016.1247133. PMC 5398601. PMID 27764579.
^ Lutter D, Ullrich F, Lueck JC, Kempa S, Jentsch TJ (březen 2017). „Selektivní transport neurotransmiterů a modulátorů odlišnými objemově regulovanými aniontovými kanály LRRC8“. Journal of Cell Science. 130 (6): 1122–1133. doi:10.1242 / jcs.196253. PMID 28193731.
^ Planells-Cases R, Lutter D, Guyader C, Gerhards NM, Ullrich F, Elger DA, Kucukosmanoglu A, Xu G, Voss FK, Reincke SM, Stauber T, Blomen VA, Vis DJ, Wessels LF, Brummelkamp TR, Borst P, Rottenberg S, Jentsch TJ (prosinec 2015). „Podjednotkové složení kanálů VRAC určuje specificitu substrátu a buněčnou rezistenci vůči protinádorovým lékům na bázi Pt“. Časopis EMBO. 34 (24): 2993–3008. doi:10.15252 / embj.201592409. PMC 4687416. PMID 26530471.
^ Abascal, F; Zardoya, R (červenec 2012). „Proteiny LRRC8 sdílejí společného předka s pannexiny a mohou tvořit hexamerické kanály zapojené do komunikace mezi buňkami“. BioEssays: Novinky a recenze v molekulární, buněčné a vývojové biologii. 34 (7): 551–60. doi:10.1002 / bies.201100173. hdl:10261/124027. PMID 22532330. S2CID 24648128.
^ Deneka, D; Sawicka, M; Lam, AKM; Paulino, C; Dutzler, R (červen 2018). "Struktura aniontového kanálu regulovaného objemem rodiny LRRC8". Příroda. 558 (7709): 254–259. Bibcode:2018Natur.558..254D. doi:10.1038 / s41586-018-0134-r. PMID 29769723. S2CID 21696249.
^ Kefauver, JM; Saotome, K; Dubin, AE; Pallesen, J; Cottrell, CA; Cahalan, SM; Qiu, Z; Hong, G; Crowley, CS; Whitwam, T; Lee, WH; Ward, AB; Patapoutian, A (10. srpna 2018). "Struktura aniontového kanálu regulovaného lidským objemem". eLife. 7. doi:10,7554 / eLife.38461. PMC 6086657. PMID 30095067.
^ Kasuya, G; Nakane, T; Yokoyama, T; Jia, Y; Inoue, M; Watanabe, K; Nakamura, R; Nishizawa, T; Kusakizako, T; Tsutsumi, A; Yanagisawa, H; Dohmae, N; Hattori, M; Ichijo, H; Yan, Z; Kikkawa, M; Shirouzu, M; Ishitani, R; Nureki, O (září 2018). "Kryo-EM struktury lidského aniontového kanálu regulovaného objemem LRRC8". Přírodní strukturní a molekulární biologie. 25 (9): 797–804. doi:10.1038 / s41594-018-0109-6. PMID 30127360. S2CID 52047355.
^ Sawada A, Takihara Y, Kim JY, Matsuda-Hashii Y, Tokimasa S, Fujisaki H, Kubota K, Endo H, Onodera T, Ohta H, Ozono K, Hara J (prosinec 2003). „Vrozená mutace nového genu LRRC8 způsobuje agamaglobulinemii u lidí“. The Journal of Clinical Investigation. 112 (11): 1707–13. doi:10,1172 / JCI18937. PMC 281644. PMID 14660746.

Další čtení

Eggermont J, Trouet D, Carton I, Nilius B (2001). "Buněčná funkce a řízení aniontových kanálů regulovaných objemem". Buněčná biochemie a biofyzika. 35 (3): 263–74. doi:10,1385 / CBB: 35: 3: 263. PMID 11894846. S2CID 31821726.
Mongin AA (březen 2016). „Anionový kanál regulovaný objemem - šílenství v mozku“. Archiv Pflügers. 468 (3): 421–41. doi:10.1007 / s00424-015-1765-6. PMC 4752865. PMID 26620797.
Nagase T, Kikuno R, Ishikawa KI, Hirosawa M, Ohara O (únor 2000). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XVI. Kompletní sekvence 150 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. Výzkum DNA. 7 (1): 65–73. doi:10.1093 / dnares / 7.1.65. PMID 10718198.
Kubota K, Kim JY, Sawada A, Tokimasa S, Fujisaki H, Matsuda-Hashii Y, Ozono K, Hara J (duben 2004). „LRRC8 zapojený do vývoje B buněk patří do nové rodiny opakujících se proteinů bohatých na leucin“. FEBS Dopisy. 564 (1–2): 147–52. doi:10.1016 / S0014-5793 (04) 00332-1. PMID 15094057. S2CID 29283213.
Smits G, Kajava AV (červenec 2004). "LRRC8 extracelulární doména je složena ze 17 opakování bohatých na leucin". Molekulární imunologie. 41 (5): 561–2. doi:10.1016 / j.molimm.2004.04.001. PMID 15183935.
Otsuki T, Ota T, Nishikawa T, Hayashi K, Suzuki Y, Yamamoto J, Wakamatsu A, Kimura K, Sakamoto K, Hatano N, Kawai Y, Ishii S, Saito K, Kojima S, Sugiyama T, Ono T, Okano K , Yoshikawa Y, Aotsuka S, Sasaki N, Hattori A, Okumura K, Nagai K, Sugano S, Isogai T (2007). "Signální sekvence a klíčové slovo trap in silico pro výběr lidských cDNA plné délky kódujících sekreci nebo membránové proteiny z knihoven cDNA opatřených oligo". Výzkum DNA. 12 (2): 117–26. doi:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID 16303743.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (listopad 2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

Tento článek o gen na lidský chromozom 9 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136802 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000007476 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: LRRC8A, bohatý na leucin obsahující 8 rodin, člen A“.

[Voss_2014-6] Voss FK, Ullrich F, Münch J, Lazarow K, Lutter D, Mah N, Andrade-Navarro MA, von Kries JP, Stauber T, Jentsch TJ (květen 2014). „Identifikace heteromeru LRRC8 jako základní složky objemově regulovaného aniontového kanálu VRAC“ (PDF). Věda. 344 (6184): 634–8. Bibcode:2014Sci ... 344..634V. doi:10.1126 / science.1252826. PMID 24790029. S2CID 24709412.

[Jentsch_2016-7] Jentsch TJ (květen 2016). "VRAC a další iontové kanály a transportéry v regulaci objemu buněk a dále". Nature Reviews Molecular Cell Biology. 17 (5): 293–307. doi:10.1038 / nrm.2016.29. PMID 27033257. S2CID 40565653.

[Hyzinski-García_2014-8] Hyzinski-García MC, Rudkouskaya A, Mongin AA (listopad 2014). „Protein LRRC8A je nepostradatelný pro uvolňování excitačních aminokyselin v astrocytech aktivovaných otokem a ATP“. The Journal of Physiology. 592 (22): 4855–62. doi:10.1113 / jphysiol.2014.278887. PMC 4259531. PMID 25172945.

[Yamada_2016-9] Yamada T, Wondergem R, Morrison R, Yin VP, Strange K (říjen 2016). „Protein LRRC8A bohatý na leucin je nezbytný pro Cl-proudy aktivované otokem a embryonální vývoj u zebrafish“. Fyziologické zprávy. 4 (19): e12940. doi:10,14814 / phy2.12940. PMC 5064130. PMID 27688432.

[Okada_2017-10] Okada T, Islam MR, Tsiferova NA, Okada Y, Sabirov RZ (březen 2017). „Specifické a zásadní, ale nedostatečné role LRRC8A v činnosti objemově citlivého ven směřujícího aniontového kanálu (VSOR)“. Kanály. 11 (2): 109–120. doi:10.1080/19336950.2016.1247133. PMC 5398601. PMID 27764579.

[Lutter_2017-11] Lutter D, Ullrich F, Lueck JC, Kempa S, Jentsch TJ (březen 2017). „Selektivní transport neurotransmiterů a modulátorů odlišnými objemově regulovanými aniontovými kanály LRRC8“. Journal of Cell Science. 130 (6): 1122–1133. doi:10.1242 / jcs.196253. PMID 28193731.

[Planells-Cases_2015-12] Planells-Cases R, Lutter D, Guyader C, Gerhards NM, Ullrich F, Elger DA, Kucukosmanoglu A, Xu G, Voss FK, Reincke SM, Stauber T, Blomen VA, Vis DJ, Wessels LF, Brummelkamp TR, Borst P, Rottenberg S, Jentsch TJ (prosinec 2015). „Podjednotkové složení kanálů VRAC určuje specificitu substrátu a buněčnou rezistenci vůči protinádorovým lékům na bázi Pt“. Časopis EMBO. 34 (24): 2993–3008. doi:10.15252 / embj.201592409. PMC 4687416. PMID 26530471.

[13] Abascal, F; Zardoya, R (červenec 2012). „Proteiny LRRC8 sdílejí společného předka s pannexiny a mohou tvořit hexamerické kanály zapojené do komunikace mezi buňkami“. BioEssays: Novinky a recenze v molekulární, buněčné a vývojové biologii. 34 (7): 551–60. doi:10.1002 / bies.201100173. hdl:10261/124027. PMID 22532330. S2CID 24648128.

[14] Deneka, D; Sawicka, M; Lam, AKM; Paulino, C; Dutzler, R (červen 2018). "Struktura aniontového kanálu regulovaného objemem rodiny LRRC8". Příroda. 558 (7709): 254–259. Bibcode:2018Natur.558..254D. doi:10.1038 / s41586-018-0134-r. PMID 29769723. S2CID 21696249.

[15] Kefauver, JM; Saotome, K; Dubin, AE; Pallesen, J; Cottrell, CA; Cahalan, SM; Qiu, Z; Hong, G; Crowley, CS; Whitwam, T; Lee, WH; Ward, AB; Patapoutian, A (10. srpna 2018). "Struktura aniontového kanálu regulovaného lidským objemem". eLife. 7. doi:10,7554 / eLife.38461. PMC 6086657. PMID 30095067.

[16] Kasuya, G; Nakane, T; Yokoyama, T; Jia, Y; Inoue, M; Watanabe, K; Nakamura, R; Nishizawa, T; Kusakizako, T; Tsutsumi, A; Yanagisawa, H; Dohmae, N; Hattori, M; Ichijo, H; Yan, Z; Kikkawa, M; Shirouzu, M; Ishitani, R; Nureki, O (září 2018). "Kryo-EM struktury lidského aniontového kanálu regulovaného objemem LRRC8". Přírodní strukturní a molekulární biologie. 25 (9): 797–804. doi:10.1038 / s41594-018-0109-6. PMID 30127360. S2CID 52047355.

[Sawada_2003-17] Sawada A, Takihara Y, Kim JY, Matsuda-Hashii Y, Tokimasa S, Fujisaki H, Kubota K, Endo H, Onodera T, Ohta H, Ozono K, Hara J (prosinec 2003). „Vrozená mutace nového genu LRRC8 způsobuje agamaglobulinemii u lidí“. The Journal of Clinical Investigation. 112 (11): 1707–13. doi:10,1172 / JCI18937. PMC 281644. PMID 14660746.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]