LCCL doména - LCCL domain
| LCCL | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | LCCL | ||||||||
| Pfam | PF03815 | ||||||||
| Pfam klan | CL0513 | ||||||||
| InterPro | IPR004043 | ||||||||
| KOCOUR | 1jbi | ||||||||
| SCOP2 | 1jbi / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
V molekulární biologii se LCCL doména je proteinová doména který byl pojmenován po několika dobře charakterizovaných bílkoviny u kterých bylo zjištěno, že je obsahují, a to Limulus koagulační faktor C., Cochlin (Coch-5b2) a Lgl1 (CRISPLD2 ). Je to asi 100 aminokyseliny doména, jejíž C-terminál část obsahuje vysoce konzervované histidin v konzervovaný motiv YxxxSxxCxAAVHxGVI. LCCL modul je považován za samostatně skládací doména, která byla použita pro konstrukci různých modulárních bílkoviny přes míchání exonů. Bylo zjištěno v různých metazoan bílkoviny ve spojení s doplňují domény typu B., Lektinové domény typu C., von Willebrandovy domény typu A., CUB domény, diskoidinové lektinové domény nebo CAP domény. Bylo navrženo, že by mohla být zapojena LCCL doména lipopolysacharid (LPS) vazba.[1][2] LCCL vykazuje román složit.[3]
Některé proteiny, o nichž je známo, že obsahují doménu LCCL, zahrnují Limulus faktor C, citlivý na LPS endotoxin trypsin typ serinová proteáza který slouží k ochraně organismus z bakteriální infekce; obratlovců kochleární protein kochlin nebo coch-5b2 (Cochlin je pravděpodobně a vylučováno protein, mutace ovlivňující LCCL doménu coch-5b2 způsobují poruchu hluchoty DFNA9 u lidí); a savčí pozdě těhotenství plíce protein Lgl1, obsahuje dvě tandemové kopie domény LCCL.[4]
Reference
- ^ Trexler M, Banyai L, Patthy L (září 2000). "Modul LCCL". Eur. J. Biochem. 267 (18): 5751–7. doi:10.1046 / j.1432-1327.2000.01641.x. PMID 10971586.
- ^ Robertson NG, Lu L, Heller S, Merchant SN, Eavey RD, McKenna M, Nadol JB, Miyamoto RT, Linthicum FH, Lubianca Neto JF, Hudspeth AJ, Seidman CE, Morton CC, Seidman JG (listopad 1998). „Mutace v novém kochleárním genu způsobují DFNA9, lidskou nesyndromovou hluchotu s vestibulární dysfunkcí“. Nat. Genet. 20 (3): 299–303. doi:10.1038/3118. PMID 9806553. S2CID 16350815.
- ^ Liepinsh, E; Trexler, M; Kaikkonen, A; Weigelt, J; Bányai, L; Patthy, L; Otting, G (1. října 2001). „Struktura NMR domény LCCL a důsledky pro poruchu hluchoty DFNA9“. Časopis EMBO. 20 (19): 5347–53. doi:10.1093 / emboj / 20.19.5347. PMC 125649. PMID 11574466.
- ^ Kaplan F, Ledoux P, Kassamali FQ, Gagnon S, Post M, Koehler D, Deimling J, Sweezey NB (červen 1999). „Nový vývojově regulovaný gen v plicním mezenchymu: homologie s inhibitorem trypsinu odvozeným od nádoru“. Dopoledne. J. Physiol. 276 (6 Pt 1): L1027-36. doi:10.1152 / ajplung.1999.276.6.L1027. PMID 10362728.