Holin nadčeleď III - Holin superfamily III - Wikipedia

The Holin Superfamily III je nadčeleď integrální membránové transportní proteiny. Je to jeden ze sedmi různých holinské superrodiny celkem. Obecně se předpokládá, že tyto proteiny hrají roli v regulované buněčné smrti, i když funkčnost se mezi rodinami a jednotlivými členy liší.

Členové holinské nadrodiny III jsou odvozeni od Proteobakterie, Synergistetes, Aktinobakterie, Deinococcus a Archaea. Tato nadrodina zahrnuje sedm rodin TC:

Členové všech rodin (s výjimkou rodiny Hol-X; TC # 1.E.34 ) mají tři transmembránové segmenty (TMS). Zdá se, že členové rodiny Hol-X mají dva domnělé TMS. Chybějící TMS v proteinech rodiny 34 je N-koncový TMS, jak bylo zjištěno vícenásobným srovnáním.[1] Těchto sedm rodin má průměrnou velikost 110, 96, 105, 112, 143, 159 a 108 aminoacylových zbytků (aas). Všimněte si, že jediná rodina se členy, u nichž se předpokládá, že budou mít jen dva TMS, je ta, která obsahuje největší homology; je to způsobeno hydrofilními rozšířeními. Průměrná velikost proteinů v celé nadrodině je 114 aas se standardní odchylkou 23 aas.[1]

Viz také

Reference

  1. ^ A b Reddy, Bhaskara L .; Saier, Milton H. (01.11.2013). „Topologické a fylogenetické analýzy bakteriálních rodin holinů a superrodin“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - biomembrány. 1828 (11): 2654–2671. doi:10.1016 / j.bbemem.2013.07.004. ISSN  0006-3002. PMC  3788059. PMID  23856191.