Rodina P35 Holin - P35 holin family - Wikipedia

The Rodina PRD1 Phage P35 Holin (P35 Holin) (TC # 1. E.5 ) je členem Holin Superfamily III.[1] Prototypem této rodiny je lipid obsahující PRD1 enterobakteriální fágový holinový protein P35 (12,8 kDa; TC # 1.E.5.1.1 ) kódovaný genem XXXV (orfT).[2] Je to součást typického systému holin-endolysin, který funguje lyžovat hostitelská bakteriální buňka.

Struktura

P35 holin (TC # 1.E.5.1.1 ) má 3 transmembránové segmenty (TMS) s 5 pozitivně nabitými zbytky mezi TMS 1 a 2. Má 4 pozitivně nabité zbytky na C-konec.[2] Má se tedy za to, že N-konec je v periplazmě a C-konec je v cytoplazmě. Homology 109 aminoacylových zbytků (aas), které mají také 3 domnělé TMS, jsou kódovány v genomech Xylella fastidiosa kmeny.[2]

Funkce

Reakce katalyzovaná holínem P35 je:

autolysin (in) → autolysin (out)

Viz také

Reference

  1. ^ Reddy, Bhaskara L .; Saier, Milton H. (01.11.2013). „Topologické a fylogenetické analýzy bakteriálních rodin holinů a superrodin“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - biomembrány. 1828 (11): 2654–2671. doi:10.1016 / j.bbemem.2013.07.004. ISSN  0006-3002. PMC  3788059. PMID  23856191.
  2. ^ A b C Rydman, Pia S .; Bamford, Dennis H. (01.07.2003). "Identifikace a mutační analýza bakteriofágového PRD1 holinového proteinu P35". Journal of Bacteriology. 185 (13): 3795–3803. doi:10.1128 / jb.185.13.3795-3803.2003. ISSN  0021-9193. PMC  161566. PMID  12813073.

Od 10. března 2016 je tento článek zcela nebo zčásti odvozen od Databáze klasifikace transportérů (TCDB). Držitel autorských práv licencoval obsah způsobem, který umožňuje jeho opětovné použití pod CC BY-SA 3.0 a GFDL. Je třeba dodržovat všechny příslušné podmínky. Původní text byl v "1.E.5 Rodina PRD1 Phage P35 Holin (P35 Holin)"