Holin nadčeleď II - Holin superfamily II
The Holin nadčeleď II je nadčeleď předpokládaného vytváření pórů bílkoviny. Je to jeden ze sedmi různých holinské superrodiny celkem. Obecně se předpokládá, že tyto proteiny hrají roli regulovaně buněčná smrt, i když se funkce mezi rodinami a jednotlivými členy liší. Holin superrodina II zahrnuje rodiny TC:
- 1.E.1 - Rodina P21 Holin S (P21 Holin)
- 1.E.6 - Rodina T7 Holin (T7 Holin)
- 1.E.7 - Rodina HP1 Holin (HP1 Holin)
- 1.E.25 - The Pseudomonas rodina fágů F116 Holin (F116 Holin)
- 1.E.50 - Rodina beta-proteobakteriálních holinů (BP-Hol)
Všechny čtyři z těchto rodin pocházejí z Proteobakterie a mají relativně malé velikosti, průměrná velikost proteinů v celé nadrodině je 78 ± 14 aminoacylových zbytků (aas). Lze nalézt některé výjimky (tj. Protein rodiny Lysis S s 720 aas, TC # 1.E.1.1.7 ). Jako v Holin nadčeleď I., proteiny v těchto rodinách obecně vykazují 2 transmembránové klíče (TMS). Rodiny 1 a 6 v Superrodině II jsou uznávanými doménami v Databáze chráněných domén (CDD) jako superrodiny Lysis S a PHA00426, zatímco rodinám 7 a 25 chybí rozpoznané konzervované domény.[1]
Viz také
Reference
- ^ Reddy, Bhaskara L .; Saier, Milton H. (01.11.2013). „Topologické a fylogenetické analýzy rodin bakteriálních holinů a superrodin“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembrány. 1828 (11): 2654–2671. doi:10.1016 / j.bbemem.2013.07.004. ISSN 0006-3002. PMC 3788059. PMID 23856191.
 | Tento membránový protein –Vztahující se článek je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |