Rodina P21 Holin - P21 holin family
The Rodina Phage 21 S (P21 Holin) (TC # 1.E.1 ) je členem Holinova nadčeleď II.[1]
Bakteriofág P21 Lysis protein S holin (TC # 1.E.1.1.1 ) je prototyp holínů třídy II. Lysis S proteiny mají dva transmembránové segmenty (TMS), s N-a C-konci na cytoplazmatický straně vnitřní membrány.[2] TMS1 může být pro funkci postradatelný.[3]
Homologem holinu P21 je holín bakteriofága H-19B (TC # 1.E.1.1.3 ). Gen, který jej kóduje, je spojován s genem toxinu I podobným Shiga E-coli.[4] Může fungovat při vývozu toxinů, jak bylo navrženo pro X. nematophila holin-1 (TC # 1.E.2.1.4 ).[5]
Reprezentativní seznam proteinů patřících do rodiny holinů P21 lze nalézt v Databáze klasifikace transportérů.
Viz také
Další čtení
- Gaeng, Susanne; Scherer, Siegfried; Neve, Horst; Loessner, Martin J. (01.07.2000). "Genové klonování a exprese a sekrece bakterií Listeria monocytogenes Bacteriophage-Lytic Enzymes in Lactococcus lactis".Aplikovaná a environmentální mikrobiologie 66 (7): 2951–2958. ISSN 0099-2240. PMC 92096. PMID 10877791.
- Lacal, J. C.; Santos, E; Notario, V; Barbacid, M; Yamazaki, S; Kung, H; Seamans, C; McAndrew, S; Crowl, R (01.09.1984). „Exprese normálních a transformujících genů H-ras v Escherichia coli a čištění jejich kódovaných proteinů p21.“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických 81(17): 5305–5309. ISSN 0027-8424. PMC 391692.PMID 6089191.
- Pang, Ting; Savva, Christos G .; Fleming, Karen G.; Struck, Douglas K .; Young, Ry (10.11.2009).„Struktura smrtelné fágové dírky“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických 106 (45): 18966–18971.doi:10.1073 / pnas.0907941106. ISSN 1091-6490.PMC 2776468. PMID 19861547.
- Park, Taehyun; Struck, Douglas K .; Dankenbring, Chelsey A .; Young, Ry (01.12.2007). „Pinholin lambdoidního fága 21: kontrola lýzy membránovou depolarizací“. Journal of Bacteriology 189(24): 9135–9139. doi:10.1128 / JB.00847-07. ISSN 1098-5530. PMC 2168629. PMID 17827300.
- Srividhya, K. V .; Krishnaswamy, S. (01.08.2007). "Subklasifikace a cílená charakterizace prophage kódované dvousložkové kazety pro lýzu buněk".Journal of Biosciences 32 (5): 979–990. ISSN 0250-5991.PMID 17914239.
Reference
- ^ Reddy, Bhaskara L .; Saier, Milton H. (01.11.2013). „Topologické a fylogenetické analýzy bakteriálních rodin holinů a superrodin“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - biomembrány. 1828 (11): 2654–2671. doi:10.1016 / j.bbemem.2013.07.004. ISSN 0006-3002. PMC 3788059. PMID 23856191.
- ^ Gründling, A .; Bläsi, U .; Young, R. (2000-01-14). „Biochemické a genetické důkazy pro tři transmembránové domény ve třídě I holin, lambda S“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (2): 769–776. doi:10.1074 / jbc.275.2.769. ISSN 0021-9258. PMID 10625606.
- ^ Park, Taehyun; Struck, Douglas K .; Deaton, John F .; Young, Ry (2006-12-26). "Topologická dynamika holinů v naprogramované bakteriální lýze". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 103 (52): 19713–19718. Bibcode:2006PNAS..10319713P. doi:10.1073 / pnas.0600943103. ISSN 0027-8424. PMC 1750887. PMID 17172454.
- ^ Neely, M. N .; Friedman, D. I. (01.06.1998). „Funkční a genetická analýza regulačních oblastí kolifágu H-19B: umístění shiga-like toxinu a geny pro lýzu naznačují roli fágových funkcí při uvolňování toxinu“ (PDF). Molekulární mikrobiologie. 28 (6): 1255–1267. doi:10.1046 / j.1365-2958.1998.00890.x. hdl:2027.42/74784. ISSN 0950-382X. PMID 9680214.
- ^ Brillard, Julien; Boyer-Giglio, Marie Hélène; Boemare, Noël; Givaudan, Alain (2003-01-21). „Holinová lokusová charakterizace z lysogenního Xenorhabdus nematophila a jeho zapojení do hemolytického fenotypu SheA z Escherichia coli“. Mikrobiologické dopisy FEMS. 218 (1): 107–113. doi:10.1016 / s0378-1097 (02) 01139-4. ISSN 0378-1097. PMID 12583905.
Od 10. března 2016 je tento článek zcela nebo zčásti odvozen od Databáze klasifikace transportérů (TCDB). Držitel autorských práv licencoval obsah způsobem, který umožňuje jeho opětovné použití pod CC BY-SA 3.0 a GFDL. Je třeba dodržovat všechny příslušné podmínky. Původní text byl v "1.E.1 Rodina P21 Holin S (P21 Holin)"