Rodina HP1 holin - HP1 holin family

The Rodina HP1 Holin (HP1 Holin) (TC # 1.E.7 ) je členem Holinova nadčeleď II.[1] Proteiny v této rodině typicky obsahují dva transmembránové segmenty (TMS) a jejich délka je mezi 70 a 80 aminoacylovými zbytky (aas). Reprezentativní seznam proteinů patřících do rodiny HP1 holinů je uveden v Databáze klasifikace transportérů.

NucE protein (TC # 1.E.25.2.1 ) v Serratia marcescens ukazuje homologii k fágovým holinovým proteinům zapojeným do uvolňování lysozymu na peptidoglykan z Gramnegativní bakterie. Protein obsahuje dva charakteristické transmembránové segmenty (TMS) s pozitivně nabitým C-koncem. Když je operátor nucC nesoucí geny nucEDC umístěn do Escherichia coli chromozom, NucE funguje jako holin. NucE může navíc doplňovat lyzně defektní mutanty bakteriofága, aby umožnil tvorbu plaků a uvolňování fága. Ačkoli NucE může fungovat jako holin, není zapojen do transportu nukleázy, extracelulárního proteinu kódovaného genem nucA.[2][3][4]

Viz také

Reference

  1. ^ Reddy, Bhaskara L .; Saier, Milton H. (01.11.2013). „Topologické a fylogenetické analýzy bakteriálních rodin holinů a superrodin“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - biomembrány. 1828 (11): 2654–2671. doi:10.1016 / j.bbemem.2013.07.004. ISSN  0006-3002. PMC  3788059. PMID  23856191.
  2. ^ Berkmen, M .; Benedik, M. J .; Bläsi, U. (1997-10-01). „Protein NucE Serratia marcescens funguje jako holín v Escherichia coli“. Journal of Bacteriology. 179 (20): 6522–6524. doi:10.1128 / jb.179.20.6522-6524.1997. ISSN  0021-9193. PMC  179574. PMID  9335307.
  3. ^ Jin, S .; Chen, Y .; Christie, G. E .; Benedik, M. J. (1996-02-23). "Regulace extracelulární nukleázy Serratia marcescens: pozitivní kontrola homologem P2 Ogr kódovaného kryptickým profágem". Journal of Molecular Biology. 256 (2): 264–278. doi:10.1006 / jmbi.1996.0084. ISSN  0022-2836. PMID  8594195.
  4. ^ Strych, U .; Dai, W .; Benedik, M. J. (01.05.1999). „Lyzační proteiny NucE a NucD nejsou nezbytné pro sekreci extracelulární nukleázy Serratia marcescens“. Mikrobiologie. 145 (Pt 5) (5): 1209–1216. doi:10.1099/13500872-145-5-1209. ISSN  1350-0872. PMID  10376837.

Od 10. března 2016 je tento článek zcela nebo zčásti odvozen od Databáze klasifikace transportérů (TCDB). Držitel autorských práv licencoval obsah způsobem, který umožňuje jeho opětovné použití pod CC BY-SA 3.0 a GFDL. Je třeba dodržovat všechny příslušné podmínky. Původní text byl v „1.E.7 Rodina HP1 Holin (HP1 Holin)“