Pseudomonas fág F116 holin - Pseudomonas phage F116 holin

The Pseudomonas fág F116 holin je necharinovaný holin, který je homologní k jednomu in Neisseria gonorrheae který byl charakterizován.[1] Tento protein je prototypem Pseudomonas rodina fágů F116 holin (F116 Holin) (TC # 1.E.25 ), který je členem Holinova nadčeleď II.[2] Bioinformatická analýza genomové sekvence N. gonorrhoeae odhalila přítomnost devíti pravděpodobných prorockých ostrovů. Genomická sekvence FA1090 identifikovala pět genomových oblastí (NgoPhi1 - 5), které souvisejí s lysogenním fágem dsDNA. Sekvence DNA z NgoPhi1, NgoPhi2 a NgoPhi3 obsahovaly oblasti identity. Oblast NgoPhi2 vykazovala vysokou podobnost s Pseudomonas aeruginosa generalizovaný transdukční fág F116. NgoPhi1 a NgoPhi2 kódují funkčně aktivní fágy. Holinový gen NgoPhi1 (identický s genem kódovaným NgoPhi2), pokud je exprimován v E-coli, mohl nahradit gen fágové lambda S.[1]

Viz také

Reference

  1. ^ A b Piekarowicz, Andrzej; Kyz, Aneta; Majchrzak, Michał; Adamczyk-Popławska, Monika; Maugel, Timothy K .; Stein, Daniel C. (1. ledna 2007). „Charakterizace profágových sekvencí dsDNA v genomu Neisseria gonorrhoeae a vizualizace produktivního bakteriofága“. Mikrobiologie BMC. 7: 66. doi:10.1186/1471-2180-7-66. ISSN  1471-2180. PMC  1931599. PMID  17615066.
  2. ^ Reddy, Bhaskara L .; Saier, Milton H. (1. listopadu 2013). „Topologické a fylogenetické analýzy bakteriálních rodin holinů a superrodin“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - biomembrány. 1828 (11): 2654–2671. doi:10.1016 / j.bbemem.2013.07.004. ISSN  0006-3002. PMC  3788059. PMID  23856191.

Od 10. března 2016 je tento článek zcela nebo zčásti odvozen od Databáze klasifikace transportérů (TCDB). Držitel autorských práv licencoval obsah způsobem, který umožňuje jeho opětovné použití pod CC BY-SA 3.0 a GFDL. Je třeba dodržovat všechny příslušné podmínky. Původní text byl v „1.E.25 Rodina fágů Pseudomonas F116 Holin (F116 Holin) Rodina“