Rodina holinů BP - BP holin family - Wikipedia
The Rodina β-proteobakteriálních holinů (BP-Hol) (TC # 1.E.50 ) je malá rodina, která zahrnuje členy odvozené z řady Burkholderia fág stejně jako a Poloromonas druh. Ke dni 3. dubna 2016 patří tato rodina do skupiny Holin nadčeleď II. Členové Saier Bioinformatics Lab na University of California, San Diego zjistil, že rodina BP-Hol je nejtěsněji příbuzná s Rodina T7 Holin (TC # 1.E.6 ).[1] Tyto proteiny mají délku 60 až 110 aminoacylových zbytků (aas) a vykazují 1 nebo 2 transmembránové segmenty (TMS). Některé jsou anotovány jako holiny typu II a mohou souviset s členy rodiny T7 Holin (TC # 1.E.6 ), ačkoli proteiny BP-Hol zůstávají funkčně necharakterizované. Reprezentativní seznam proteinů patřících do rodiny BP-Hol lze nalézt v Databáze klasifikace transportérů.[2]
Viz také
Další čtení
- "BcepMigl_gp72 - Holin - Burkholderia phage BcepMigl - BcepMigl_gp72 gen a protein".www.uniprot.org. Citováno 2016-03-29.
- Gründling, Angelika; Manson, Michael D .; Young, Ry (2001-07-31). „Holíni zabíjejí bez varování“.Sborník Národní akademie věd 98 (16): 9348–9352. doi:10.1073 / pnas.151247598. ISSN 0027-8424. PMC 55423. PMID 11459934.
- Preston, Gail M .; Studholme, David J .; Caldelari, Isabelle (01.04.2005). "Profilování sekretomů rostlinných patogenních proteobakterií". Recenze mikrobiologie FEMS 29 (2): 331–360. doi:10.1016 / j.fmrre.2005.01.001. ISSN 1574-6976. PMID 15808747.
- Reddy, Bhaskara L .; Saier Jr., Milton H. (01.11.2013). „Topologické a fylogenetické analýzy bakteriálních rodin holinů a superrodin“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembrány 1828 (11): 2654–2671.doi:10.1016 / j.bbemem.2013.07.004. PMC 3788059. PMID 23856191.
- Saier, Milton H .; Reddy, Bhaskara L. (01.01.2015). „Holins in Bacteria, Eukaryotes, and Archaea: Multifunctional Xenologues with Potential Biotechnological and Biomedical Applications“. Journal of Bacteriology 197(1): 7–17. doi:10.1128 / JB.02046-14. ISSN 0021-9193. PMC 4288690. PMID 25157079.
- Wang, I.N .; Smith, D.L .; Young, R. (01.01.2000). „Holiny: proteinové hodiny bakteriofágových infekcí“. Výroční přehled mikrobiologie 54: 799–825. doi:10,1146 / annurev.micro. 54.1.799. ISSN 0066-4227.PMID 11018145.
Reference
- ^ „Holin Superfamily II“. TCDB. Citováno 2016-04-04.
- ^ „1.E.50. Rodina β-proteobakteriálních holinů (BP-Hol)“. TCDB. Citováno 2016-03-29.
Do tato úprava, tento článek používá obsah z „1.E.50. Rodina β-proteobakteriálních holinů (BP-Hol)“, který je licencován způsobem, který umožňuje opětovné použití v rámci Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License, ale ne pod GFDL. Je třeba dodržovat všechny příslušné podmínky.