Halorhodospira halophila - Halorhodospira halophila

Halorhodospira halophila
Vědecká klasifikace
Doména:
Bakterie
Kmen:
Proteobakterie
Třída:
Gammaproteobakterie
Objednat:
Chromatiales
Rodina:
Ectothiorhodospiraceae
Rod:
Halorhodospira
Druh:
H. halophila
Binomické jméno
Halorhodospira halophila
(Raymond a Sistrom 1969) Imhoff a Süling 1997[1]

Halorhodospira halophila je druh Halorhodospira, který se vyznačuje svou schopností optimálně růst v prostředí 15–20% slanosti. Dříve se tomu říkalo Ectothiorhodospira halophila. Je to anaerobní gramnegativní bakterie ve tvaru tyčinky. H. halophila má bičík.

Obecné rysy

H. halophila patří mezi nejvíce halofilní známé organismy. Je to povinně fotosyntetický a anaerobní fialová bakterie síry se spirálovou morfologií. H. halophila vykazuje autotrofní růst v nasycených koncentracích NaCl. H. halophila je gramnegativní bakterie v gama dělení kmenů Proteobacteria a je známo, že je fototrofní (Třída: Gammaproteobacteria). H. halophila byla první fototrofní extrémní halofil, který má sekvenován genom. Genom se skládá z 2 678 452 bp, kódujících 2 493 predikovaných genů, jak je stanoveno automatizovanou anotací genomu. Z tohoto genomu je předpovězeno 2 407 proteinů a 1 905 bylo přiřazeno domnělá funkce.[2]H. halophila vyrábí organické látky jako glycin, betain a ektoin, k vyrovnání osmotického tlaku. Každá bakterie má a bičík.[3] Růst byl prokázán v hypersalinních prostředích, jako je krystalizační rybníky, které mají slanost nejméně 25%.[4]

Metabolismus

H. halophila oxiduje sulfid na síra, který je uložen mimo buňku a dále oxidován na síran.

H. halophila obsahuje velké množství metabolických cest, jako je glykolýza, citrátový cyklus a metabolismus aminokyselin. Jeho schopnost pro fotoautotrofní růst za extrémních podmínek a vyznačuje se charakteristickým metabolizmem síry. Proteom z H. halophila je vysoce kyselý. Bakterie má nízký cytoplazmatický obsah draslíku, i když je pěstována v médiu s vysokým obsahem KCl koncentrace, jak bylo stanoveno rentgenovou mikroanalýzou a plazmovou emisní spektrometrií.[5] H. halophila nezpůsobuje žádné známé nemoci.

Aplikace

H. halophila může hrát při výrobě vodíku silnou roli, protože plynný vodík je vedlejším produktem fixace dusíkem katalyzovaný svou dusíkatou látkou. H. halophila také slouží při výrobě organických látek, jako je glycin, betain, ektoin a trehalóza.

Fotoaktivní žlutý protein „PYP“ je senzor modrého světla z bakterie H. halophila.[6] Fotoaktivní proteiny, jako je PYP, jsou obecně přijímány jako modelové systémy pro studium formování stavu proteinového signálu.

Reference

  1. ^ Parte, A.C. „Halorhodospira“. LPSN.
  2. ^ Challacombe, Jean F .; Majid, Sophia; Deole, Ratnakar; Brettin, Thomas S .; Bruce, David; Delano, Susana F .; Detter, John C .; Gleasner, Cheryl D .; Han, Cliff S .; Misra, Monica; Reitenga, Krista G .; Mikhailova, Natalia; Woyke, Tanja; Pitluck, Sam; Nolan, Matt; Land, Miriam L .; Saunders, Elizabeth; Tapia, Roxanne; Lapidus, Alla; Ivanova, Natalia; Hoff, Wouter D. (2013). „Complete genome sequence of Halorhodospira halophila SL1“. Standardy v genomických vědách. 8 (2): 206–214. doi:10,4056 / sigs.3677284. PMC  3746430. PMID  23991253.
  3. ^ „HAMAP: Halorhodospira halophila (kmen DSM 244 / SL1) (Ectothiorhodospira halophila (kmen DSM 244 / SL1)) kompletní proteom ExPASy Proteomics Server. Švýcarský institut pro bioinformatiku[trvalý mrtvý odkaz ] http://hamap.expasy.org/proteomes/HALHL.html
  4. ^ Antón, J; Rosselló-Mora, R; Rodríguez-Valera, F; Amann, R (2000). „Extrémně halofilní bakterie v krystalizačních rybnících ze solárních soláren“. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 66 (7): 3052–3057. doi:10.1128 / aem.66.7.3052-3057.2000. PMC  92110. PMID  10877805.
  5. ^ Ratnakar; Challacombe, Jean; Raiford, Douglas W .; Hoff, Wouter D. (2013). „Extrémně halofilní protein kombinuje vysoce kyselý protein s nízkým obsahem cytoplazmy draslíku“. The Journal of Biological Chemistry. 288 (1): 581–588. doi:10,1074 / jbc.M112.420505. PMC  3537055. PMID  23144460.
  6. ^ van Wilderen, LJ; van der Horst, MA; van Stokkum, IH; Hellingwerf, KJ; van Grondelle, R; Groot, ML (2006). „Ultrarychlá infračervená spektroskopie odhaluje klíčový krok pro úspěšný vstup do fotocyklu pro fotoaktivní žlutý protein“. Sborník Národní akademie věd. 103 (41): 15050–15055. Bibcode:2006PNAS..10315050V. doi:10.1073 / pnas.0603476103. PMC  1940041. PMID  17015839.

externí odkazy