Halomonas meridiana - Halomonas meridiana - Wikipedia

Halomonas meridiana
Vědecká klasifikace
Království:
Bakterie
Kmen:
Proteobakterie
Třída:
Gammaproteobakterie
Objednat:
Oceanospirillales
Rodina:
Halomonadaceae
Rod:
Halomonas
Druh:
H. meridiana
Binomické jméno
Halomonas meridiana
James a kol. 1990[1]

Halomonas meridiana je bakteriální druh objevený v roce 1990 v hypersalinních jezerech Vestfold Hills v Antarktidě.[2]

Taxonomie

Halomonas meridiana je Gramnegativní mikroorganismus rodiny Halomonadaceae.[2] Existuje několik známých kmenů tohoto mikroba, včetně DSM 5425, ACAM 246, ATCC 49692 a CIP 104043.[3] Sdílí mnoho charakteristik s jinými druhy ve stejném rodu. H. meridiana byl umístěn do tohoto rodu kvůli jeho halophillic příroda a také její blízký genomický vztah k ostatním ve stejných taxonech.[2] Tento druh má blízký vztah se známým druhem Halomonas se prodlužuje, Halomonas halmophila, a Halomonas subglaciescola[2].

Vlastnosti / morfologie

Halomonas meridiana je gramnegativní halofilní organismus nalezený v jezerech Antarktidy.[4] Je to ve tvaru tyče buňka se zaoblenými konci a má peritrichous po celém povrchu, bičíky. Má délku mezi 2 a 3 mikrometry a šířku 1 mikrometr.[2][5] Tento organismus má průměrný genom v současné době o velikosti 3,8 mega párů bází (Mbp) obsahující 56,96% GC, nebo guanin a cytosin obsah.[6] Má 3 864 genů, z nichž 3 696 těchto genů kóduje proteiny.[7] H. meridiana je komenzální mořské bakterie, které se vyskytují na útesových korálech jako součást jejich povrchového mikrobiomu.[3] Není známo, že je patogenní. Halomonas meridiana je heterotrofní organismus schopný anaerobní růst pomocí glukózy, pokud není přítomen dusík.[4]

Objev

V roce 1997 James a kol. publikoval článek popisující organismus, který objevili. Bylo nalezeno v Vestfold Hills Antarktická solná jezera, která obsahovala mnoho nepopsaných mikrobů včetně tohoto organismu.[2] Voda z jezera byla umístěna na agarové desky a inkubována.[2] Po ponechání času na růst byly jednotlivé buňky odebrány z kolonií a pěstovány na nových agarových místech.[2] Po 2–4 týdnech inkubace byly kolonie přeneseny do bazálního média určeného k simulaci organického jezera.[2] Mnoho druhů mikroorganismů a několik kmenů toho, co by později bylo identifikováno jako Halomonas meridiana byly nalezeny a testovány na fyzikální a chemické vlastnosti pomocí kvantitativních fylogenetických technik.[2] James a kol. zmapoval výsledky složení DNA báze, snášenlivosti solí a teplotně tolerančních testů proti ostatním známým organismům ze stejné rodiny.[2] Po pečlivém studiu zjistili, že organismus, který našli, se liší od zbytku.[2] Umístili organismus do rodu Halomonas.[2] Kromě Antarktidy Halomonas meridiana byl také izolován z hostitele organismů nalezených v korálech a na nich, Acropora, po celém světě.[7] Nalezený organismus byl identifikován jako Halomonas meridiana použitím sekvencí částí 16S rRNA genu.[7] Slovo Halomonas pochází z řeckého slova halos ve smyslu „sůl“ a monas ve smyslu „jednotka“ a Slovo meridiana pochází ze slova meridián ve smyslu „na jih“.[2]

Důležitost

Tento druh pomáhá rozšiřovat naše znalosti o důležitosti heterotrofní bakterie, které žijí v symbiotickém vztahu s jinými organismy. Tento organismus je a symbiont který žije na povrchu korálových útesů.[7] Halomonas meridiana byl objeven žijící na povrchu druhu Acropora, což jsou korálové útesy.[7] Halomonas meridiana také vyrábí proteázy.[7] Tyto metaloproteázy specifické pro mořské bakterie jsou důležité pro štěpení pojivových tkání, stejně jako adhezi oddělení k hlenu.[7] Alkalické proteázy jsou důležitými aspekty procesů zahrnujících detergenty, kůži, potraviny a hedvábí pro spotřebitelskou spotřebu.[7]

H. meridiana byl důležitý organismus používaný při definování nového termínu, haloversatile.[2] H. meridiana vykazuje vlastnosti halotolerantních i mírně halofilních bakterií a ve výsledku nový termín, haloversatilní, popisuje toleranci slanosti tohoto organismu lépe než tradiční termíny.[2] Halotolerantní a halofilní bakterie H. meridiana může také poskytnout cenné informace o druzích, které byly přizpůsobeny solným jezerům za nízkých teplot, a také zachovat schopnost žít v symbióze s jinými organismy.[2]

Reference

  1. ^ Parte, A.C. "Halomonas". LPSN.
  2. ^ A b C d E F G h i j k l m n Ó p q James, S.R. (1990). „Halomonas meridiana, nový druh extrémně halotolerantních bakterií izolovaných z antarktických slaných jezer“. Systematická a aplikovaná mikrobiologie. 13 (3): 270–278. doi:10.1016 / S0723-2020 (11) 80198-0.
  3. ^ A b Meyer, Julie L (2015). „Návrh sekvence genomu Halomonas Meridiana R1t3 izolovaný z povrchové mikrobioty Karibiku Elkhorn Coral Acropora Palmata“. Standardy v genomických vědách. 10: 75. doi:10.1186 / s40793-015-0069-r. PMC  4597393. PMID  26451236.
  4. ^ A b Ventosa, A .; Nieto, J. J .; Oren, A. (01.06.1998). "Biologie mírně halofilních aerobních bakterií". Recenze mikrobiologie a molekulární biologie. 62 (2): 504–544. ISSN  1092-2172. PMC  98923. PMID  9618450.
  5. ^ Sánchez-Román, Mónica; Vasconcelos, Crisógono; Schmid, Thomas; Dittrich, Maria; McKenzie, Judith A .; Zenobi, Renato; Rivadeneyra, Maria A. (2008). „Aerobní mikrobiální dolomit v měřítku nanometrů: důsledky pro geologický záznam“. Geologie. 36 (11): 879. doi:10.1130 / g25013a.1.
  6. ^ „IMG / M: Integrated Microbial Genomes & Microbiomes“. Integrované mikrobiální geny a mikrobiomy JGI IMG. 2017. Citováno 20. února 2017.
  7. ^ A b C d E F G h Anithajothi, R. (2014). "Screening, izolace a charakterizace proteázy produkující mírně halofilní mikroorganismus Halomonas Meridiana asociovaný s korálovým hlenem". Toxikologická a environmentální chemie. 92 (2): 296–306. doi:10.1080/02772248.2014.925182.

externí odkazy