HIST3H2BB - HIST3H2BB

H2BU1

Protein HIST3H2BB PDB 1aoi.png

Identifikátory

H2BU1, H2Bb, histonová klastr 3, H2bb, histonová klastr 3 Člen rodiny H2B b, H2B.U histon 1, HIST3H2BB

Externí ID

OMIM: 615046 MGI: 1922442 HomoloGene: 75941 Genové karty: H2BU1

Umístění genu (člověk)

Chr.	Chromozom 1 (lidský)^[1]

Kapela	1q42.13	Start	228,458,107 bp^[1]
Kapela	1q42.13	Konec	228,460,470 bp^[1]

Umístění genu (myš)

Chr.	Chromozom 11 (myš)^[2]

Kapela	11 \| 11 B1.3	Start	58,954,048 bp^[2]
Kapela	11 \| 11 B1.3	Konec	58,954,512 bp^[2]

Exprese RNA vzor

Další údaje o referenčních výrazech

Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA • aktivita heterodimerizace proteinu • molekulární funkce
Buněčná složka	• chromozóm • nukleosom • buněčné jádro • nukleoplazma • cytosol
Biologický proces	• shromáždění nukleosomů
Zdroje:Amigo / QuickGO

Druh

Člověk

Myš


128312


382522


ENSG00000196890 ENSG00000285449


ENSMUSG00000080712


Q8N257


n / a

RefSeq (mRNA)


NM_175055


n / a

RefSeq (protein)


NP_778225


n / a

Místo (UCSC)

Chr 1: 228,46 - 228,46 Mb

Chr 11: 58,95 - 58,95 Mb

PubMed Vyhledávání

^[3]

^[4]

Zobrazit / upravit člověka

Zobrazit / upravit myš

Histon H2B typ 3-B je protein že u lidí je kódován HIST3H2BB gen.^[5]^[6]

Histony jsou základní jaderné proteiny, které jsou odpovědné za nukleosom struktura chromozomálního vlákna v eukaryoty. Nukleosomy se skládají z přibližně 146 základní páry (bp) z DNA omotal kolem a histonový oktamer složený z párů každého ze čtyř hlavních histonů (H2A, H2B, H3, a H4 ). The chromatin vlákno je dále zhutňováno interakcí histonu linkeru, H1 s DNA mezi nukleosomy za vzniku struktur chromatinu vyššího řádu. Tento gen je intronless a kóduje člena rodiny histonů H2B. Přepisy z tohoto genu obsahují palindromický terminační prvek.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000285449 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000196890, ENSG00000285449 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000080712 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Marzluff WF, Gongidi P, Woods KR, Jin J, Maltais LJ (říjen 2002). "Lidské a myší replikačně závislé histonové geny". Genomika. 80 (5): 487–98. doi:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID 12408966.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HIST3H2BB histon cluster 3, H2bb“.

Další čtení

Borowski P, Heiland M, Oehlmann K, et al. (1996). „Nestrukturální protein 3 viru hepatitidy C inhibuje fosforylaci zprostředkovanou proteinkinázou závislou na cAMP“. Eur. J. Biochem. 237 (3): 611–8. doi:10.1111 / j.1432-1033.1996.0611p.x. PMID 8647104.
El Kharroubi A, Piras G, Zensen R, Martin MA (1998). „Transkripční aktivace integrovaného promotoru viru lidské imunodeficience typu 1 spojeného s chromatinem“. Mol. Buňka. Biol. 18 (5): 2535–44. doi:10,1128 / mcb.18.5.2535. PMC 110633. PMID 9566873.
Borowski P, Kühl R, Laufs R a kol. (1999). "Identifikace a charakterizace histonového vazebného místa nestrukturního proteinu 3 viru hepatitidy C". J. Clin. Virol. 13 (1–2): 61–9. doi:10.1016 / S1386-6532 (99) 00007-4. PMID 10405893.
Thomson S, Clayton AL, Hazzalin CA a kol. (1999). „Nukleosomální odpověď spojená s okamžitou časnou genovou indukcí je zprostředkována alternativními MAP kinázovými kaskádami: MSK1 jako potenciální histonová H3 / HMG-14 kináza“. EMBO J.. 18 (17): 4779–93. doi:10.1093 / emboj / 18.17.4779. PMC 1171550. PMID 10469656.
Deng L, de la Fuente C, Fu P a kol. (2001). „Acetylace HIV-1 Tat pomocí CBP / P300 zvyšuje transkripci integrovaného genomu HIV-1 a zvyšuje vazbu na hlavní histony“. Virologie. 277 (2): 278–95. doi:10.1006 / viro.2000.0593. PMID 11080476.
Deng L, Wang D, de la Fuente C a kol. (2001). "Zlepšení aktivity p300 HAT pomocí HIV-1 Tat na chromatinové DNA". Virologie. 289 (2): 312–26. doi:10.1006 / viro.2001.1129. PMID 11689053.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Cheung WL, Ajiro K, Samejima K a kol. (2003). „Apoptotická fosforylace histonu H2B je zprostředkována sterilní dvacetinovou kinázou savců“. Buňka. 113 (4): 507–17. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00355-6. PMID 12757711.
Coleman MA, Miller KA, Beernink PT a kol. (2004). "Identifikace proteinových interakcí souvisejících s chromatinem pomocí proteinových čipů". Proteomika. 3 (11): 2101–7. doi:10.1002 / pmic.200300593. PMID 14595808.
Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (2004). „Regulace exprese genu HIV-1 acetylací histonu a nábor faktorů u promotoru LTR“. EMBO J.. 22 (24): 6550–61. doi:10.1093 / emboj / cdg631. PMC 291826. PMID 14657027.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Kanno T, Kanno Y, Siegel RM a kol. (2004). "Selektivní rozpoznávání acetylovaných histonů proteiny bromodomény vizualizované v živých buňkách". Mol. Buňka. 13 (1): 33–43. doi:10.1016 / S1097-2765 (03) 00482-9. PMID 14731392.
Zhang Y, Griffin K, Mondal N, Parvin JD (2004). „Fosforylace histonu H2A inhibuje transkripci na šablonách chromatinu“. J. Biol. Chem. 279 (21): 21866–72. doi:10,1074 / jbc.M400099200. PMID 15010469.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Golebiowski F, Kasprzak KS (2007). „Inhibice acetylace jádrových histonů karcinogenním niklem (II)“. Mol. Buňka. Biochem. 279 (1–2): 133–9. doi:10.1007 / s11010-005-8285-1. PMID 16283522.
Zhu B, Zheng Y, Pham AD a kol. (2006). „Monoubikvitinace lidského histonu H2B: zúčastněné faktory a jejich role v regulaci genu HOX“. Mol. Buňka. 20 (4): 601–11. doi:10.1016 / j.molcel.2005.09.025. PMID 16307923.
Bonenfant D, Coulot M, Towbin H a kol. (2006). „Charakterizace variant histonu H2A a H2B a jejich posttranslační úpravy hmotnostní spektrometrií“. Mol. Buňka. Proteomika. 5 (3): 541–52. doi:10,1074 / mcp.M500288-MCP200. PMID 16319397.
Beck HC, Nielsen EC, Matthiesen R a kol. (2006). „Kvantitativní proteomická analýza posttranslačních modifikací lidských histonů“. Mol. Buňka. Proteomika. 5 (7): 1314–25. doi:10,1074 / mcp.M600007-MCP200. PMID 16627869.
Gregory SG, Barlow KF, McLay KE a kol. (2006). „Sekvence DNA a biologická anotace lidského chromozomu 1“. Příroda. 441 (7091): 315–21. doi:10.1038 / nature04727. PMID 16710414.

Galerie PDB

1aoi: KOMPLEXNÍ MEZI JADERNÝMI ČÁSTIKY NUCLEOSOMŮ (H3, H4, H2A, H2B) A DLOUHÝM Fragmentem DNA o 146 BP
1 ekv: X-RAY STRUKTURA JADERNÉ ČÁSTI NUCLEOSOMU V ROZLIŠENÍ 2,5 A
1f66: 2.6 KRYSTÁLOVÁ STRUKTURA JADERNÉ JADERNÉ ČÁSTI OBSAHUJÍCÍ VARIANTNÍ HISTON H2A.Z
1hq3: KRYSTÁLOVÁ STRUKTURA HISTON-JADEROVÉHO OCTAMERU V KCL / FOSFÁTU
1kx3: X-Ray Structure of the Nucleosome Core Particle, NCP146, at 2.0 A Resolution
1kx4: X-Ray Structure of the Nucleosome Core Particle, NCP146b, at 2.6 A Resolution
1kx5: X-Ray Structure of the Nucleosome Core Particle, NCP147, at 1.9 A Resolution
1m18: LIGAND BINDING ALTERS THE STRUCTURE AND DYNAMICS of NUCLEOSOMAL DNA
1m19: LIGAND BINDING ALTERS THE STRUCTURE AND DYNAMICS of NUCLEOSOMAL DNA
1m1a: LIGAND BINDING ALTERS THE STRUCTURE AND DYNAMICS of NUCLEOSOMAL DNA
1p34: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1p3a: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3b: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1p3f: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3g: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1p3i: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3k: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3l: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3o: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3p: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1s32: Molekulární rozpoznávání nukleosomální „supergroove“
1tzy: Krystalová struktura oktameru jádro-histon na rozlišení 1,90 angstromu
1u35: Krystalová struktura částice jádra nukleosomu obsahující histonovou doménu makroH2A
1zbb: Struktura tetranukleosomu 4_601_167
1zla: X-ray Structure of a Kaposi's sarkom herpesvirus LANA peptide bound to the nucleosomal core
2aro: Krystalová struktura nativního histonového oktameru na rozlišení 2,1 angstromu, krystalizovaná za přítomnosti S-nitrosoglutathionu
2cv5: Krystalová struktura jádra částice lidského nukleosomu
2f8n: 2.9 Angstromová rentgenová struktura hybridních nukleosomů makroH2A
2fj7: Krystalová struktura částice jádra nukleosomu obsahující prvek sekvence Poly (dA.dT)
2hio: HISTONOVÝ OCTAMER (KUŘECÍ), CHROMOSOMÁLNÍ PROTEIN
2nzd: Částice jádra nukleosomu obsahující 145 bp DNA

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.