HIST1H4L - HIST1H4L - Wikipedia

H4C13
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4H9O, 3 WKJ, 3AYW, 3WA9, 5B0Z, 5AVB, 2CV5, 5AV5, 3AV2, 3 WTP, 3AV1, 3AZK, 3X1V, 5AV8, 1F66, 4QUU, 3CFS, 4YYK, 4QUT, 3NQJ, 3A6N, 3W99, 5AVC, 2RS9, 3F9Z, 3QZT, 3QBY, 3W97, 4M38, 4RM6, 3CFV, 4HGA, 1EQZ, 2RJE, 3QZV, 1HQ3, 4H9P, 3AZL, 3AFA, 1TZY, 3UVY, 5 CPK, 3JPX, 4U9W, 4N3W, 4YYJ, 4RR, 4H9N, 4H9R, 3AZI, 4LD9, 3UVX, 3AZH, 5BNX, 4N4F, 1U35, 4YYG, 3O36, 2ARO, 5AV9, 4H9S, 3AZF, 3W98, 4GQB, 4H9Q, 5BNV, 3WAA, 3AZG, 3AZE, 2RNY, 1 ZKK, 2QQS, 2LVM, 3X1T, 3AN2, 2 KWO, 3QZS, 3F9W, 5FFW, 5CPJ, 3F9X, 3IJ1, 4RM5, 3AZJ, 4RR6, 3AZN, 2IG0, 4YYH, 4RRR, 5CPI, 3W96, 3R45, 2 KWN, 3F9Y, 5AV6, 3AZM, 5BO0, 3X1S, 4QYD, 4KGC, 3UVW, 4YYN, 3X1U, 3UW9, 2F8N, 3NQU, 5B0Y, 4RRM, 5C3I, 4Z5T, 5B24, 5FA5, 4Z2M, 5E5A, 5FWE, 5B2I, 5B40, 5B2J, 5JA4, 5AY8, 4ZUX
Identifikátory
Aliasy	H4C13, H4.k, H4 / k, H4FK, histonová klastr 1, H4l, histonová klastr 1 H4 člen rodiny l, HIST1H4L, H4 klastrovaný histon 13, H4C5, H4C4, H4C9, H4C12, H4-16, H4C3, H4C11, H4C1, H4C14, H4C15, H4C8, H4C6, H4C2
Externí ID	OMIM: 602831 MGI: 4843992 HomoloGene: 136248 Genové karty: H4C13
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	27,873,510 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	21,832,196 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• specifické vazby na proteinovou doménu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita heterodimerizace proteinu; • Vazba DNA; • histonová vazba; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• membrána; • chromozóm; • nukleoplazma; • extracelulární oblast; • nukleární chromozom; • nukleosom; • extracelulární exosom; • buněčné jádro; • jaderný chromozom, telomerická oblast; • extracelulární matrix; • nukleární nukleosom; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• organizace telomer; • buněčný proteinový metabolický proces; • pozitivní regulace genové exprese, epigenetická; • heterotetramerizace proteinů; • negativní regulace diferenciace megakaryocytů; • Sestava nukleosomů obsahující CENP-A; • Sestavení nukleosomů závislé na replikaci DNA; • umlčování chromatinu při rDNA; • negativní regulace genové exprese, epigenetická; • Transkripce s templátem DNA, zahájení; • Sestava nukleosomů nezávislá na replikaci; • oprava dvouvláknového zlomu pomocí nehomologního spojování konců; • komplexní sestava beta-katenin-TCF; • omezení telomer; • shromáždění nukleosomů; • regulace umlčování genů miRNA; • regulace diferenciace megakaryocytů; • regulace diferenciace hematopoetických kmenových buněk;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8368
	319161
	ENSG00000275126
	ENSMUSG00000069305
	P62805
	P62806
	NM_003546
	NM_175657
NP_003537; NP_003486; NP_003535; NP_003539; NP_003531;
	NP_003536
NP_783585; NP_783588; NP_835583; NP_783583; NP_835499;
	NP_835500; NP_291074; NP_783586; NP_694813; NP_835515; NP_783587; NP_835582; NP_001182350
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Histon H4 je protein že u lidí je kódován HIST1H4L gen.^[5]^[6]^[7]^[8]

Funkce

Histony jsou základní jaderné proteiny které jsou odpovědné za nukleosom struktura chromozomální vlákno dovnitř eukaryoty. Dvě molekuly každého ze čtyř hlavních histonů (H2A, H2B, H3, a H4 ) tvoří oktamer, kolem kterého je přibližně 146 bp DNA je zabalen do opakujících se jednotek, tzv nukleosomy. Linkonový histon, H1, interaguje s linkerovou DNA mezi nukleosomy a funguje při zhutňování chromatinu do struktur vyššího řádu. Tento gen je intronless a kóduje člena rodiny histonů H4. Chybí přepisy z tohoto genu polyA ocasy, ale místo toho obsahují palindromický ukončovací prvek. Tento gen se nachází v malém klastru histonového genu na chromozomu 6p22-p21.3.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000275126 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000069305 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Albig W, Meergans T, Doenecke D (březen 1997). "Charakterizace genu H1.5 doplňuje soubor lidských genů podtypu H1". Gen. 184 (2): 141–8. doi:10.1016 / S0378-1119 (96) 00582-3. PMID 9031620.
^ Albig W, Doenecke D (únor 1998). "Lidský histonový genový klastr na lokusu D6S105". Hum Genet. 101 (3): 284–94. doi:10,1007 / s004390050630. PMID 9439656. S2CID 38539096.
^ Marzluff WF, Gongidi P, Woods KR, Jin J, Maltais LJ (říjen 2002). "Lidské a myší replikačně závislé histonové geny". Genomika. 80 (5): 487–98. doi:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID 12408966.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HIST1H4L histonová klastr 1, H4l“.

Další čtení

Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (2004). „Regulace exprese genu HIV-1 acetylací histonu a nábor faktorů u promotoru LTR“. EMBO J.. 22 (24): 6550–61. doi:10.1093 / emboj / cdg631. PMC 291826. PMID 14657027.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Deng L, Wang D, de la Fuente C a kol. (2001). "Zlepšení aktivity p300 HAT pomocí HIV-1 Tat na chromatinové DNA". Virologie. 289 (2): 312–26. doi:10.1006 / viro.2001.1129. PMID 11689053.
Deng L, de la Fuente C, Fu P a kol. (2001). „Acetylace HIV-1 Tat pomocí CBP / P300 zvyšuje transkripci integrovaného genomu HIV-1 a zvyšuje vazbu na hlavní histony“. Virologie. 277 (2): 278–95. doi:10.1006 / viro.2000.0593. PMID 11080476.
El Kharroubi A, Piras G, Zensen R, Martin MA (1998). „Transkripční aktivace integrovaného promotoru viru lidské imunodeficience typu 1 spojeného s chromatinem“. Mol. Buňka. Biol. 18 (5): 2535–44. doi:10,1128 / mcb.18.5.2535. PMC 110633. PMID 9566873.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000275126 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000069305 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9031620-5] Albig W, Meergans T, Doenecke D (březen 1997). "Charakterizace genu H1.5 doplňuje soubor lidských genů podtypu H1". Gen. 184 (2): 141–8. doi:10.1016 / S0378-1119 (96) 00582-3. PMID 9031620.

[pmid9439656-6] Albig W, Doenecke D (únor 1998). "Lidský histonový genový klastr na lokusu D6S105". Hum Genet. 101 (3): 284–94. doi:10,1007 / s004390050630. PMID 9439656. S2CID 38539096.

[pmid12408966-7] Marzluff WF, Gongidi P, Woods KR, Jin J, Maltais LJ (říjen 2002). "Lidské a myší replikačně závislé histonové geny". Genomika. 80 (5): 487–98. doi:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID 12408966.

[entrez-8] A ^b „Entrez Gene: HIST1H4L histonová klastr 1, H4l“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]