HIST1H2BO - HIST1H2BO

H2BC17

Protein HIST1H2BO PDB 1aoi.png

Identifikátory

H2BC17, H2B.2, H2B / n, H2BFN, dJ193B12.2, histonová klastr 1, H2bo, histonová klastr 1 člen rodiny H2B o, HIST1H2BO, H2B klastrovaný histon 17

Externí ID

OMIM: 602808 MGI: 2448409 HomoloGene: 134442 Genové karty: H2BC17

Umístění genu (člověk)

Chr.	Chromozom 6 (lidský)^[1]

Kapela	6p22.1	Start	27,893,463 bp^[1]
Kapela	6p22.1	Konec	27,893,843 bp^[1]

Umístění genu (myš)

Chr.	Chromozom 13 (myš)^[2]

Kapela	13 \| 13 A3.1	Start	21,787,461 bp^[2]
Kapela	13 \| 13 A3.1	Konec	21,789,213 bp^[2]

Exprese RNA vzor

Další údaje o referenčních výrazech

Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA • aktivita heterodimerizace proteinu
Buněčná složka	• chromozóm • nukleosom • buněčné jádro • nukleoplazma • cytosol
Biologický proces	• shromáždění nukleosomů • ubikvitinace bílkovin
Zdroje:Amigo / QuickGO

Druh

Člověk

Myš


8348


319188


ENSG00000274641


ENSMUSG00000069308


P23527


Q8CGP2

RefSeq (mRNA)


NM_003527


NM_001290466 NM_178202

RefSeq (protein)


NP_003518


NP_001277395 NP_835509

Místo (UCSC)

Chr 6: 27,89 - 27,89 Mb

Chr 13: 21,79 - 21,79 Mb

PubMed Vyhledávání

^[3]

^[4]

Zobrazit / upravit člověka

Zobrazit / upravit myš

Histon H2B typ 1-O je protein že v lidé je kódován HIST1H2BO gen.^[5]^[6]^[7]

Histony jsou základní jaderné proteiny které jsou zodpovědné za strukturu nukleosomů chromozomálního vlákna v eukaryoty. Dvě molekuly každého ze čtyř hlavních histonů (H2A, H2B, H3, a H4 ) pro muže octamer, kolem kterého přibližně 146 bp DNA je zabalen do opakujících se jednotek, tzv nukleosomy.

The linker histon, H1, interaguje s spojovací DNA mezi nukleosomy a funkcemi při zhutňování chromatin do struktur vyššího řádu. Tento gen je intronless a kóduje člena rodiny histonů H2B. Chybí přepisy z tohoto genu polyA ocasy ale místo toho obsahují a palindromický koncový prvek. Tento gen se nachází v malém klastru genu histonu chromozóm 6p22-p21.3.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000274641 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000069308 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Dobner T, Vlk I, Mai B, Lipp M (únor 1992). "Nový divergentně transkribovaný genový pár lidského histonu H2A / H2B". DNA sekv. 1 (6): 409–13. doi:10.3109/10425179109020799. PMID 1768865.
^ Marzluff WF, Gongidi P, Woods KR, Jin J, Maltais LJ (říjen 2002). "Lidské a myší replikačně závislé histonové geny". Genomika. 80 (5): 487–98. doi:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID 12408966.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HIST1H2BO histon cluster 1, H2bo“.

Další čtení

Albig W, Doenecke D (1998). "Lidský histonový genový klastr na lokusu D6S105". Hučení. Genet. 101 (3): 284–94. doi:10,1007 / s004390050630. PMID 9439656. S2CID 38539096.
El Kharroubi A, Piras G, Zensen R, Martin MA (1998). „Transkripční aktivace integrovaného promotoru viru lidské imunodeficience typu 1 spojeného s chromatinem“. Mol. Buňka. Biol. 18 (5): 2535–44. doi:10,1128 / mcb.18.5.2535. PMC 110633. PMID 9566873.
Deng L, de la Fuente C, Fu P a kol. (2001). „Acetylace HIV-1 Tat pomocí CBP / P300 zvyšuje transkripci integrovaného genomu HIV-1 a zvyšuje vazbu na hlavní histony“. Virologie. 277 (2): 278–95. doi:10.1006 / viro.2000.0593. PMID 11080476.
Deng L, Wang D, de la Fuente C a kol. (2001). "Zlepšení aktivity p300 HAT pomocí HIV-1 Tat na chromatinové DNA". Virologie. 289 (2): 312–26. doi:10.1006 / viro.2001.1129. PMID 11689053.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Cheung WL, Ajiro K, Samejima K a kol. (2003). „Apoptotická fosforylace histonu H2B je zprostředkována sterilní dvacetinovou kinázou savců“. Buňka. 113 (4): 507–17. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00355-6. PMID 12757711. S2CID 21854.
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK a kol. (2003). „Sekvence DNA a analýza lidského chromozomu 6“. Příroda. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003 Natur.425..805M. doi:10.1038 / nature02055. PMID 14574404.
Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (2004). „Regulace exprese genu HIV-1 acetylací histonu a nábor faktorů u promotoru LTR“. EMBO J.. 22 (24): 6550–61. doi:10.1093 / emboj / cdg631. PMC 291826. PMID 14657027.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK a kol. (2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. Bibcode:2005 Natur.433 ... 77A. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Golebiowski F, Kasprzak KS (2007). „Inhibice acetylace jádrových histonů karcinogenním niklem (II)“. Mol. Buňka. Biochem. 279 (1–2): 133–9. doi:10.1007 / s11010-005-8285-1. PMID 16283522. S2CID 25071586.
Zhu B, Zheng Y, Pham AD a kol. (2006). „Monoubikvitinace lidského histonu H2B: zúčastněné faktory a jejich role v regulaci genu HOX“. Mol. Buňka. 20 (4): 601–11. doi:10.1016 / j.molcel.2005.09.025. PMID 16307923.
Bonenfant D, Coulot M, Towbin H a kol. (2006). „Charakterizace variant histonu H2A a H2B a jejich posttranslační úpravy hmotnostní spektrometrií“. Mol. Buňka. Proteomika. 5 (3): 541–52. doi:10,1074 / mcp.M500288-MCP200. PMID 16319397.
Beck HC, Nielsen EC, Matthiesen R a kol. (2006). „Kvantitativní proteomická analýza posttranslačních modifikací lidských histonů“. Mol. Buňka. Proteomika. 5 (7): 1314–25. doi:10,1074 / mcp.M600007-MCP200. PMID 16627869.
Pavri R, Zhu B, Li G a kol. (2006). „Histon H2B monoubikvitinace funguje kooperativně s FACT k regulaci prodloužení pomocí RNA polymerázy II“. Buňka. 125 (4): 703–17. doi:10.1016 / j.cell.2006.04.029. PMID 16713563. S2CID 2614680.
Kim SC, Sprung R, Chen Y a kol. (2006). „Substrátová a funkční rozmanitost acetylace lysinu odhalena proteomickým průzkumem“. Mol. Buňka. 23 (4): 607–18. doi:10.1016 / j.molcel.2006.06.026. PMID 16916647.

Galerie PDB

1aoi: KOMPLEXNÍ MEZI JADERNÝMI ČÁSTIKY NUCLEOSOMŮ (H3, H4, H2A, H2B) A DLOUHÝM Fragmentem DNA o 146 BP
1 ekv: X-RAY STRUKTURA JADERNÉ ČÁSTI NUCLEOSOMU V ROZLIŠENÍ 2,5 A
1f66: 2.6 KRYSTÁLOVÁ STRUKTURA JADERNÉ JADERNÉ ČÁSTI OBSAHUJÍCÍ VARIANTNÍ HISTON H2A.Z
1hq3: KRYSTÁLOVÁ STRUKTURA HISTON-JADEROVÉHO OCTAMERU V KCL / FOSFÁTU
1kx3: X-Ray Structure of the Nucleosome Core Particle, NCP146, at 2.0 A Resolution
1kx4: X-Ray Structure of the Nucleosome Core Particle, NCP146b, at 2.6 A Resolution
1kx5: X-Ray Structure of the Nucleosome Core Particle, NCP147, at 1.9 A Resolution
1m18: LIGAND BINDING ALTERS THE STRUCTURE AND DYNAMICS of NUCLEOSOMAL DNA
1m19: LIGAND BINDING ALTERS THE STRUCTURE AND DYNAMICS of NUCLEOSOMAL DNA
1m1a: LIGAND BINDING ALTERS THE STRUCTURE AND DYNAMICS of NUCLEOSOMAL DNA
1p34: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1p3a: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3b: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1p3f: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3g: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1p3i: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3k: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3l: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3o: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3p: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1s32: Molekulární rozpoznávání nukleosomální „supergroove“
1tzy: Krystalová struktura oktameru jádro-histon na rozlišení 1,90 angstromu
1u35: Krystalová struktura částice jádra nukleosomu obsahující histonovou doménu makroH2A
1zbb: Struktura tetranukleosomu 4_601_167
1zla: X-ray Structure of a Kaposi's sarkom herpesvirus LANA peptide bound to the nucleosomal core
2aro: Krystalová struktura nativního histonového oktameru na rozlišení 2,1 angstromu, krystalizovaná za přítomnosti S-nitrosoglutathionu
2cv5: Krystalová struktura jádra částice lidského nukleosomu
2f8n: 2.9 Angstromová rentgenová struktura hybridních nukleosomů makroH2A
2fj7: Krystalová struktura částice jádra nukleosomu obsahující prvek sekvence Poly (dA.dT)
2hio: HISTONOVÝ OCTAMER (KUŘECÍ), CHROMOSOMÁLNÍ PROTEIN
2nzd: Částice jádra nukleosomu obsahující 145 bp DNA

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.