GTF2A1L - GTF2A1L

GTF2A1L
Identifikátory
Aliasy	GTF2A1L, ALF, obecná transkripční faktor IIA podjednotka 1 jako
Externí ID	OMIM: 605358 MGI: 1919078 HomoloGene: 86732 Genové karty: GTF2A1L
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	48,733,148 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	88,715,152 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: Aktivita transkripčního koaktivátoru 0001105; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• transkripční faktor TFIIA komplex; • buněčné jádro; • cytoplazma;
Biologický proces	• iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • poznání; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace transkripce templátované nukleovou kyselinou;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	11036
	71828
	ENSG00000242441
	ENSMUSG00000024154
	Q9UNN4
	Q8R4I4
	NM_172196; NM_001193487; NM_006872
	NM_023630
	NP_001180416; NP_006863
	NP_076119
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Faktor TFIIA-alfa a beta je protein že u lidí je kódován GTF2A1L gen.^[5]^[6]^[7]^[8]

Sestavení a stabilita RNA polymeráza II pre-iniciační komplex transkripce na a eukaryotický základní promotor zahrnuje účinky TFIIA o interakci mezi Protein vázající TATA (TBP) a DNA.

Tento gen kóduje protějšek specifické pro zárodečné buňky velké (alfa / beta) podjednotky obecného transkripčního faktoru TFIIA, který je schopen stabilizovat vazbu TBP na DNA a může být jedinečně důležitý pro varle biologie. Bylo pozorováno alternativní sestřih pro toto místo a dvě varianty, kódující odlišně izoformy, byl identifikován.

Společná transkripce tohoto genu a sousedního upstream genu generuje vzácný transkript (SALF), který kóduje fúzní protein spočívající v identitě sdílení sekvencí s každým jednotlivým genovým produktem.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000242441 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024154 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Upadhyaya AB, Lee SH, DeJong J (červenec 1999). "Identifikace obecného transkripčního faktoru TFIIAalpha / beta homolog selektivně vyjádřený ve varlete". J Biol Chem. 274 (25): 18040–8. doi:10.1074 / jbc.274.25.18040. PMID 10364255.
^ Xie W, Han S, Khan M, DeJong J (květen 2002). „Regulace genové exprese ALF ve somatických a mužských zárodečných liniích zahrnuje částečné a místně specifické vzorce methylace“. J Biol Chem. 277 (20): 17765–74. doi:10,1074 / jbc.M200954200. PMID 11889132.
^ Huang M, Wang H, Li J, Zhou Z, Du Y, Lin M, Sha J (březen 2006). „Podíl ALF na lidské spermatogenezi a mužské neplodnosti“. Int J Mol Med. 17 (4): 599–604. doi:10,3892 / ijmm.17.4.599. PMID 16525715.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ALF TFIIA-alpha / beta-like factor“.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Loveys DA, Streiff MB, Kato GJ (1996). „Transkripční faktory E2A basic-helix-loop-helix jsou negativně regulovány růstovými faktory séra a proteinem Id3“. Nucleic Acids Res. 24 (14): 2813–20. doi:10.1093 / nar / 24.14.2813. PMC 145994. PMID 8759016.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Malik S, Guermah M, Roeder RG (1998). „Dynamický model pro funkci koaktivátoru PC4 v transkripci RNA polymerázy II“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (5): 2192–7. doi:10.1073 / pnas.95.5.2192. PMC 19292. PMID 9482861.
Han SY, Zhou L, Upadhyaya A a kol. (2001). „Faktor TFIIAalfa / beta je kódován genem specifickým pro zárodečné buňky, jehož exprese je během spermatogeneze u myši up-regulována jinými obecnými transkripčními faktory“. Biol. Reprod. 64 (2): 507–17. doi:10.1095 / biolreprod64.2.507. PMID 11159353.
Yoshida S, Ohbo K, Takakura A a kol. (2002). „Sgn1, základní transkripční faktor helix-loop-helix definuje buněčnou linii kanálků slinných žláz u myší“. Dev. Biol. 240 (2): 517–30. doi:10.1006 / dbio.2001.0473. PMID 11784080.
Upadhyaya AB, Khan M, Mou TC a kol. (2002). „Specifický transkripční faktor zárodečných buněk ALF. Strukturální vlastnosti a stabilizace komplexu TATA-vázající protein (TBP) -DNA“. J. Biol. Chem. 277 (37): 34208–16. doi:10,1074 / jbc.M204808200. PMID 12107178.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Howe ML, Mehmud ZF, Saha S a kol. (2006). „Transkripční faktor IIA tau je spojen s nediferencovanými buňkami a jeho genová exprese je potlačována v primárních neuronech na úrovni chromatinu in vivo.“ Kmenové buňky Dev. 15 (2): 175–90. doi:10.1089 / scd.2006.15.175. PMID 16646664.
Kim M, Li D, Cui Y a kol. (2006). "Interakce regulačních faktorů a somatické umlčení genu ALF specifického pro zárodečné buňky". J. Biol. Chem. 281 (45): 34288–98. doi:10,1074 / jbc.M607168200. PMID 16966320.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000242441 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024154 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10364255-5] Upadhyaya AB, Lee SH, DeJong J (červenec 1999). "Identifikace obecného transkripčního faktoru TFIIAalpha / beta homolog selektivně vyjádřený ve varlete". J Biol Chem. 274 (25): 18040–8. doi:10.1074 / jbc.274.25.18040. PMID 10364255.

[pmid11889132-6] Xie W, Han S, Khan M, DeJong J (květen 2002). „Regulace genové exprese ALF ve somatických a mužských zárodečných liniích zahrnuje částečné a místně specifické vzorce methylace“. J Biol Chem. 277 (20): 17765–74. doi:10,1074 / jbc.M200954200. PMID 11889132.

[pmid16525715-7] Huang M, Wang H, Li J, Zhou Z, Du Y, Lin M, Sha J (březen 2006). „Podíl ALF na lidské spermatogenezi a mužské neplodnosti“. Int J Mol Med. 17 (4): 599–604. doi:10,3892 / ijmm.17.4.599. PMID 16525715.

[entrez-8] A ^b „Entrez Gene: ALF TFIIA-alpha / beta-like factor“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]