FAHD1 - FAHD1
Protein obsahující doménu fumarylacetoacetát hydrolázy 1, známý také jako protein FLJ36880, je enzym že u lidí je kódován FAHD1 gen na chromozom 16.[5]
Struktura
Gen FAHD1 kóduje protein 24 kDa, který je lokalizován na mitochondrie a patří do fumarylacetoacetát hydroláza rodina proteinů.[6] Struktura FAHD1 byla vyřešena pomocí Rentgenová krystalografie při rozlišení 2,2 Å. Celková struktura je podobná C-koncové doméně bifunkčního enzymu HpcE z Escherichia coli C, fumarylacetoacetáthydrolázy z Mus musculus a YcgM (Apc5008) z E. coli 1262.[6] Řada konzervovaných aminokyselin včetně Asp-102 a Arg-106 FAHD1 se jeví jako důležitá pro svou katalytickou aktivitu.[7]
Funkce
Bylo prokázáno, že protein FAHD1 funguje jako oxaloacetát dekarboxyláza v eukaryoty.[8] Protein FAHD1 pravděpodobně funguje také jako acylpyruváza poté, co bylo prokázáno, že katalyzuje hydrolýza z acetylpyruvát a fumarylpyruvát v in vitro experimentech.[6] Mg (2+) bylo požadováno pro maximální aktivitu enzymu.[7]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000180185 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000045316 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Entrez Gene: FAHD1 fumarylacetoacetátová hydrolázová doména obsahující 1“.
- ^ A b C Manjasetty BA, Niesen FH, Delbrück H, Götz F, Sievert V, Büssow K, Behlke J, Heinemann U (2004). „Rentgenová struktura člena rodiny fumarylacetoacetáthydrolázy Homo sapiens FLJ36880“. Biol. Chem. 385 (10): 935–42. doi:10.1515 / BC.2004.122. PMID 15551868. S2CID 16759973.
- ^ A b Pircher H, Straganz GD, Ehehalt D, Morrow G, Tanguay RM, Jansen-Dürr P (2011). „Identifikace lidského proteinu 1 (FAHD1) obsahujícího doménu fumarylacetoacetátu hydrolázy jako nové mitochondriální acylpyruvázy“. J. Biol. Chem. 286 (42): 36500–8. doi:10,1074 / jbc.M111.264770. PMC 3196145. PMID 21878618.
- ^ Pircher H, von Grafenstein S, Diener T, Metzger C, Albertini E, Taferner A, Unterluggauer H, Kramer C, Liedl KR, Jansen-Dürr P (2015). „Identifikace proteinu 1 (FAHD1) obsahujícího doménu FAH jako oxaloacetát dekarboxylázy“. J. Biol. Chem. 290 (11): 6755–62. doi:10,1074 / jbc.M114,609305. PMC 4358102. PMID 25575590.
Další čtení
- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
- Daniels RJ, Peden JF, Lloyd C a kol. (2001). "Sekvence, struktura a patologie plně anotovaného terminálu 2 Mb krátkého ramene lidského chromozomu 16". Hučení. Mol. Genet. 10 (4): 339–52. doi:10,1093 / hmg / 10,4,339. PMID 11157797.
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
- Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A a kol. (2001). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. EMBO Rep. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Lehner B, Sanderson CM (2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Genome Res. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
- Manjasetty BA, Niesen FH, Delbrück H a kol. (2005). „Rentgenová struktura člena rodiny fumarylacetoacetáthydrolázy Homo sapiens FLJ36880“. Biol. Chem. 385 (10): 935–42. doi:10.1515 / BC.2004.122. PMID 15551868. S2CID 16759973.
- Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I a kol. (2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
![]() | Tento článek o gen na lidský chromozom 16 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |