Exozomální složka 7 - Exosome component 7

EXOSC7
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2NN6
Identifikátory
Aliasy	EXOSC7, EAP1, RRP42, Rrp42p, hRrp42p, p8, složka Exosome 7
Externí ID	OMIM: 606488 MGI: 1913696 HomoloGene: 8994 Genové karty: EXOSC7
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	45,036,066 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 9 (myš)
Konec	123,136,129 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Aktivita 3'-5'-exoribonukleázy; • aktivita exoribonukleázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA; • Vazba prvků bohatých na AU;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • exosom (komplex RNázy); • jádro; • nukleoplazma; • buněčné jádro; • jaderný exosom (komplex RNázy); • cytoplazmatický exosom (komplex RNázy);
Biologický proces	• regulace stability mRNA; • RNA katabolický proces; • zpracování rRNA; • exonukleolytické trimování pro generování zralého 3'-konce 5,8S rRNA z tricistronického rRNA transkriptu (SSU-rRNA, 5,8S rRNA, LSU-rRNA); • nukleárně transkribovaný katabolický proces mRNA, exonukleolytický, 3'-5 '; • Zpracování 3'-konce U1 snRNA; • Zpracování 3'-konce U4 snRNA; • Zpracování 3'-konce U5 snRNA; • exonukleolytický nukleární transkribovaný katabolický proces mRNA zapojený do rozpadu závislého na deadenylaci; • dozor nad jadernou mRNA; • katabolický proces nukleární polyadenylace závislý na rRNA; • katabolický proces nukleární polyadenylace závislý na tRNA; • katabolický proces nukleární polyadenylace závislý na mRNA; • katabolický proces rRNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	23016
	66446
	ENSG00000075914
	ENSMUSG00000025785
	Q15024
	Q9D0M0
	NM_015004
	NM_001081188
	NP_055819
	NP_001074657
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Exozomální složka 7, také známý jako EXOSC7, je člověk gen, jehož proteinový produkt je součástí exosomový komplex.^[5]

Interakce

Ukázalo se, že exozomová složka 7 komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000075914 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025785 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ "Entrez Gene: EXOSC7 exosomová složka 7".
^ ^A ^b ^C Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (listopad 2002). „Interakce proteinů a proteinů mezi lidskými exosomovými složkami podporují sestavování podjednotek typu RNáza PH do šestičlenného kruhu podobného PNPázě.“ J. Mol. Biol. 323 (4): 653–63. doi:10.1016 / s0022-2836 (02) 00947-6. PMID 12419256.
^ Raijmakers R, Noordman YE, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (leden 2002). "Interakce protein-protein hCsl4p s jinými lidskými exosomovými podjednotkami". J. Mol. Biol. 315 (4): 809–18. doi:10.1006 / jmbi.2001.5265. PMID 11812149.

Další čtení

Butler JS (2002). "Jin a jang exosomu". Trends Cell Biol. 12 (2): 90–6. doi:10.1016 / S0962-8924 (01) 02225-5. PMID 11849973.
Nagase T, Miyajima N, Tanaka A a kol. (1995). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. III. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0081-KIAA0120) odvozené analýzou klonů cDNA z lidské buněčné linie KG-1“. DNA Res. 2 (1): 37–43. doi:10.1093 / dnares / 2.1.37. PMID 7788527.
Brouwer R, Allmang C, Raijmakers R a kol. (2001). „Tři nové složky lidského exosomu“. J. Biol. Chem. 276 (9): 6177–84. doi:10,1074 / jbc.M007603200. PMID 11110791.
Chen CY, Gherzi R, Ong SE a kol. (2002). „AU vázající proteiny rekrutují exosom k degradaci mRNA obsahujících ARE“. Buňka. 107 (4): 451–64. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00578-5. PMID 11719186. S2CID 14817671.
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH a kol. (2002). "Řízená proteomická analýza lidského nukleolu". Curr. Biol. 12 (1): 1–11. doi:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID 11790298. S2CID 14132033.
Raijmakers R, Noordman YE, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2002). "Interakce protein-protein hCsl4p s jinými lidskými exosomovými podjednotkami". J. Mol. Biol. 315 (4): 809–18. doi:10.1006 / jmbi.2001.5265. PMID 11812149.
Brouwer R, Vree Egberts WT, Hengstman GJ a kol. (2002). „Autoprotilátky zaměřené na nové složky komplexu PM / Scl, lidský exosom“. Arthritis Res. 4 (2): 134–8. doi:10,1186 / ar389. PMC 83843. PMID 11879549.
Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2002). „Interakce proteinů a proteinů mezi lidskými exosomovými složkami podporují sestavování podjednotek typu RNáza PH do šestičlenného kruhu podobného PNPázě.“ J. Mol. Biol. 323 (4): 653–63. doi:10.1016 / S0022-2836 (02) 00947-6. PMID 12419256.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Lehner B, Sanderson CM (2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Genome Res. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK a kol. (2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000075914 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025785 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] "Entrez Gene: EXOSC7 exosomová složka 7".

[pmid12419256-6] A ^b ^C Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (listopad 2002). „Interakce proteinů a proteinů mezi lidskými exosomovými složkami podporují sestavování podjednotek typu RNáza PH do šestičlenného kruhu podobného PNPázě.“ J. Mol. Biol. 323 (4): 653–63. doi:10.1016 / s0022-2836 (02) 00947-6. PMID 12419256.

[pmid11812149-7] Raijmakers R, Noordman YE, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (leden 2002). "Interakce protein-protein hCsl4p s jinými lidskými exosomovými podjednotkami". J. Mol. Biol. 315 (4): 809–18. doi:10.1006 / jmbi.2001.5265. PMID 11812149.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]