Exozomální složka 1 - Exosome component 1

EXOSC1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2NN6
Identifikátory
Aliasy	EXOSC1, CGI-108, CSL4, Csl4p, SKI4, Ski4p, hCsl4p, p13, Exozomální složka 1
Externí ID	OMIM: 606493 MGI: 1913833 HomoloGene: 9359 Genové karty: EXOSC1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 10 (lidský)
Konec	97,446,017 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 19 (myš)
Konec	41,933,423 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita exoribonukleázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • jaderný exosom (komplex RNázy); • jádro; • exosom (komplex RNázy); • nukleoplazma; • buněčné jádro;
Biologický proces	• regulace stability mRNA; • exonukleolytický nukleární transkribovaný katabolický proces mRNA zapojený do rozpadu závislého na deadenylaci; • zpracování rRNA; • Hydrolýza RNA fosfodiesterovou vazbou, exonukleolytická; • Zpracování RNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	51013
	66583
	ENSG00000171311
	ENSMUSG00000034321
	Q9Y3B2
	Q9DAA6
NM_016046; NM_001318362; NM_001318363; NM_001318364; NM_001318365;
	NM_001318366
	NM_001164561; NM_025644; NM_001320231; NM_001320232; NM_001320233
NP_001305291; NP_001305292; NP_001305293; NP_001305294; NP_001305295;
	NP_057130
	NP_001158033; NP_001307160; NP_001307161; NP_001307162; NP_079920
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Homolog 3'-5 'exoribonukleázy CSL4 je enzym že u lidí je kódován EXOSC1 gen.^[5]^[6]^[7]

Tento gen kóduje základní složku exosomový komplex. Savčí exozom je nutný pro rychlou degradaci RNA obsahujících prvky bohaté na AU, ale ne pro zkrácení poly (A). Asociace tohoto proteinu s exozomem je zprostředkována interakcemi protein-protein s proteinem 42 zpracovávajícím ribozomální RNA a proteinem 46 zpracovávajícím ribozomální RNA.^[7]

Interakce

Ukázalo se, že složka 1 exozomu komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000171311 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034321 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b ^C Raijmakers R, Noordman YE, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (leden 2002). "Interakce protein-protein hCsl4p s jinými lidskými exosomovými podjednotkami". J Mol Biol. 315 (4): 809–18. doi:10.1006 / jmbi.2001.5265. PMID 11812149.
^ Chen CY, Gherzi R, Ong SE, Chan EL, Raijmakers R, Pruijn GJ, Stoecklin G, Moroni C, Mann M, Karin M (listopad 2001). „AU vázající proteiny rekrutují exosom k degradaci mRNA obsahujících ARE“. Buňka. 107 (4): 451–64. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00578-5. PMID 11719186. S2CID 14817671.
^ ^A ^b „Entrez Gene: EXOSC1 exosome component 1“.
^ ^A ^b ^C Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (listopad 2002). „Interakce proteinů a proteinů mezi lidskými exosomovými složkami podporují sestavování podjednotek typu RNáza PH do šestičlenného kruhu podobného PNPázě.“ J. Mol. Biol. 323 (4): 653–63. doi:10.1016 / s0022-2836 (02) 00947-6. PMID 12419256.

Další čtení

Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY a kol. (2000). „Identifikace nových lidských genů evolučně konzervovaných u Caenorhabditis elegans srovnávací proteomikou“. Genome Res. 10 (5): 703–13. doi:10,1101 / gr. 10.703. PMC 310876. PMID 10810093.
van Hoof A, Staples RR, Baker RE, Parker R (2000). „Funkce proteinů ski4p (Csl4p) a Ski7p při degradaci mRNA od 3 do 5 '“. Mol. Buňka. Biol. 20 (21): 8230–43. doi:10.1128 / MCB.20.21.8230-8243.2000. PMC 86432. PMID 11027292.
Brouwer R, Allmang C, Raijmakers R a kol. (2001). „Tři nové složky lidského exosomu“. J. Biol. Chem. 276 (9): 6177–84. doi:10,1074 / jbc.M007603200. PMID 11110791.
Brouwer R, Vree Egberts WT, Hengstman GJ a kol. (2002). „Autoprotilátky zaměřené na nové složky komplexu PM / Scl, lidský exosom“. Arthritis Res. 4 (2): 134–8. doi:10,1186 / ar389. PMC 83843. PMID 11879549.
Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2002). „Interakce proteinů a proteinů mezi lidskými exosomovými složkami podporují sestavování podjednotek typu RNáza PH do šestičlenného kruhu podobného PNPázě.“ J. Mol. Biol. 323 (4): 653–63. doi:10.1016 / S0022-2836 (02) 00947-6. PMID 12419256.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Deloukas P, Earthrowl ME, Grafham DV a kol. (2004). „Sekvence DNA a srovnávací analýza lidského chromozomu 10“. Příroda. 429 (6990): 375–81. doi:10.1038 / nature02462. PMID 15164054.
Lehner B, Sanderson CM (2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Genome Res. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK a kol. (2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.

Tento článek o gen na lidský chromozom 10 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000171311 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034321 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11812149-5] A ^b ^C Raijmakers R, Noordman YE, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (leden 2002). "Interakce protein-protein hCsl4p s jinými lidskými exosomovými podjednotkami". J Mol Biol. 315 (4): 809–18. doi:10.1006 / jmbi.2001.5265. PMID 11812149.

[pmid11719186-6] Chen CY, Gherzi R, Ong SE, Chan EL, Raijmakers R, Pruijn GJ, Stoecklin G, Moroni C, Mann M, Karin M (listopad 2001). „AU vázající proteiny rekrutují exosom k degradaci mRNA obsahujících ARE“. Buňka. 107 (4): 451–64. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00578-5. PMID 11719186. S2CID 14817671.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: EXOSC1 exosome component 1“.

[pmid12419256-8] A ^b ^C Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (listopad 2002). „Interakce proteinů a proteinů mezi lidskými exosomovými složkami podporují sestavování podjednotek typu RNáza PH do šestičlenného kruhu podobného PNPázě.“ J. Mol. Biol. 323 (4): 653–63. doi:10.1016 / s0022-2836 (02) 00947-6. PMID 12419256.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]