Exozomální složka 6 - Exosome component 6

EXOSC6
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2NN6
Identifikátory
Aliasy	EXOSC6, EAP4, MTR3, Mtr3p, hMtr3p, p11, komponenta exozomu 6
Externí ID	OMIM: 606490 MGI: 1919794 HomoloGene: 12469 Genové karty: EXOSC6
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 16 (lidský)
Konec	70,251,940 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	111,057,664 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita exoribonukleázy; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • exosom (komplex RNázy); • jaderný exosom (komplex RNázy); • cytoplazmatický exosom (komplex RNázy); • jádro; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• regulace stability mRNA; • nukleárně transkribovaný katabolický proces mRNA, exonukleolytický, 3'-5 '; • Zpracování na 3'-konci rRNA; • katabolický proces rRNA; • Deaminace DNA; • dozor nad jadernou mRNA; • exonukleolytický nukleární transkribovaný katabolický proces mRNA zapojený do rozpadu závislého na deadenylaci; • Zpracování 3'-konce U4 snRNA; • zpracování na 3'-konci snoRNA závislé na polyadenylaci; • zpracování rRNA; • pozitivní regulace přepínání izotypů; • přepínání izotypů; • Hydrolýza RNA fosfodiesterovou vazbou, exonukleolytická;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	118460
	72544
	ENSG00000223496
	ENSMUSG00000109941
	Q5RKV6
	Q8BTW3
	NM_058219
	NM_028274
	NP_478126
	NP_082550
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Exozomální komplexní exonukleáza MTR3 je enzym že u lidí je kódován EXOSC6 gen.^[5]^[6]^[7]

Tento genový produkt tvoří jednu z podjednotek vícepodjednotkové částice zvané exosomový komplex, který zprostředkovává degradaci mRNA. Složení lidského exosomu je podobné jeho kvasinkovému protějšku. Tento protein je homologní s kvasinkovým proteinem Mtr3. Jeho přesná funkce není známa, nicméně pomocí bezbuněčného systému rozpadu RNA bylo prokázáno, že exosom je nutný pro rychlou degradaci nestabilních mRNA obsahujících prvky bohaté na AU (ARE), ale ne pro zkrácení poly (A). Exosom sám o sobě nerozpoznává mRNA obsahující ARE, ale vyžaduje proteiny vázající ARE, které by mohly interagovat s exosomem a rekrutovat jej do nestabilních mRNA, čímž podporuje jejich rychlou degradaci.^[7]

Interakce

Ukázalo se, že exozomová složka 6 komunikovat s Exozomální složka 7,^[6]Exozomální složka 8^[6] a Exozomální složka 1.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000223496 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000109941 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Chen CY, Gherzi R, Ong SE, Chan EL, Raijmakers R, Pruijn GJ, Stoecklin G, Moroni C, Mann M, Karin M (listopad 2001). „AU vázající proteiny rekrutují exosom k degradaci mRNA obsahujících ARE“. Buňka. 107 (4): 451–64. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00578-5. PMID 11719186. S2CID 14817671.
^ ^A ^b ^C ^d Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (listopad 2002). „Interakce proteinů a proteinů mezi lidskými exosomovými složkami podporují sestavování podjednotek typu RNáza PH do šestičlenného kruhu podobného PNPázě.“ J Mol Biol. 323 (4): 653–63. doi:10.1016 / S0022-2836 (02) 00947-6. PMID 12419256.
^ ^A ^b „Entrez Gene: EXOSC6 exozomální složka 6“.

Další čtení

Lehner B, Sanderson CM (2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Genome Res. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
van Hoof A, Parker R (2002). "Messenger degradace RNA: začátek na konci". Curr. Biol. 12 (8): R285–7. doi:10.1016 / S0960-9822 (02) 00802-3. PMID 11967169. S2CID 17142692.
Raijmakers R, Noordman YE, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2002). "Interakce protein-protein hCsl4p s jinými lidskými exosomovými podjednotkami". J. Mol. Biol. 315 (4): 809–18. doi:10.1006 / jmbi.2001.5265. PMID 11812149.
Brouwer R, Allmang C, Raijmakers R a kol. (2001). „Tři nové složky lidského exosomu“. J. Biol. Chem. 276 (9): 6177–84. doi:10,1074 / jbc.M007603200. PMID 11110791.

Tento článek o gen na lidský chromozom 16 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000223496 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000109941 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11719186-5] Chen CY, Gherzi R, Ong SE, Chan EL, Raijmakers R, Pruijn GJ, Stoecklin G, Moroni C, Mann M, Karin M (listopad 2001). „AU vázající proteiny rekrutují exosom k degradaci mRNA obsahujících ARE“. Buňka. 107 (4): 451–64. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00578-5. PMID 11719186. S2CID 14817671.

[pmid12419256-6] A ^b ^C ^d Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (listopad 2002). „Interakce proteinů a proteinů mezi lidskými exosomovými složkami podporují sestavování podjednotek typu RNáza PH do šestičlenného kruhu podobného PNPázě.“ J Mol Biol. 323 (4): 653–63. doi:10.1016 / S0022-2836 (02) 00947-6. PMID 12419256.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: EXOSC6 exozomální složka 6“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]