Exozomální složka 2 - Exosome component 2

EXOSC2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2NN6
Identifikátory
Aliasy	EXOSC2, RRP4, Rrp4p, hRrp4p, p7, Exosomová složka 2, SHRF
Externí ID	OMIM: 602238 MGI: 2385133 HomoloGene: 6095 Genové karty: EXOSC2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	130,704,894 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	31,681,349 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Aktivita 3'-5'-exoribonukleázy; • aktivita exoribonukleázy; • Vazba 7S RNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • exosom (komplex RNázy); • jaderný exosom (komplex RNázy); • cytoplazmatický exosom (komplex RNázy); • buněčné jádro; • nukleoplazma; • jádro;
Biologický proces	• katabolický proces nukleární polyadenylace závislý na tRNA; • katabolický proces nukleární polyadenylace závislý na rRNA; • regulace stability mRNA; • exonukleolytické trimování pro generování zralého 3'-konce 5,8S rRNA z tricistronického rRNA transkriptu (SSU-rRNA, 5,8S rRNA, LSU-rRNA); • nukleárně transkribovaný katabolický proces mRNA, exonukleolytický, 3'-5 '; • STŘIH katabolický proces; • jaderná retence pre-mRNA s aberantními 3'-konci v místě transkripce; • pozitivní regulace buněčného růstu; • exonukleolytický nukleární transkribovaný katabolický proces mRNA zapojený do rozpadu závislého na deadenylaci; • zpracování rRNA; • Zpracování 3'-konce U4 snRNA; • zpracování na 3'-konci snoRNA závislé na polyadenylaci;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	23404
	227715
	ENSG00000130713
	ENSMUSG00000039356
	Q13868
	Q8VBV3
	NM_001282708; NM_001282709; NM_014285
	NM_144886
	NP_001269637; NP_001269638; NP_055100
	NP_659135
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Exozomální složka 2, také známý jako EXOSC2, je protein který je u lidí kódován EXOSC2 gen.^[5]^[6]

Funkce

Savčí mRNA obsahovat Prvky bohaté na AU (ARE) v rámci svých tři primární nepřekládané oblasti. V droždí 3-prime-to-5-prime Degradace mRNA je zprostředkována exozom, multisubunitová částice. EXOSC2 (který je homologní s kvasinkovým proteinem Rrp4) je součástí lidského exosomu.^[7]

Interakce

Ukázalo se, že exozomová složka 2 komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000130713 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000039356 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: EXOSC2 exosome component 2“.
^ Mitchell P, Petfalski E, Shevchenko A, Mann M, Tollervey D (listopad 1997). "Exosom: konzervovaný komplex zpracování eukaryotické RNA obsahující více 3 '-> 5' exoribonukleáz". Buňka. 91 (4): 457–66. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80432-8. PMID 9390555. S2CID 16035676.
^ Chen CY, Gherzi R, Ong SE, Chan EL, Raijmakers R, Pruijn GJ, Stoecklin G, Moroni C, Mann M, Karin M (listopad 2001). „AU vázající proteiny rekrutují exosom k degradaci mRNA obsahujících ARE“. Buňka. 107 (4): 451–64. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00578-5. PMID 11719186. S2CID 14817671.
^ ^A ^b Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (listopad 2002). „Interakce proteinů a proteinů mezi lidskými exosomovými složkami podporují sestavování podjednotek typu RNáza PH do šestičlenného kruhu podobného PNPázě.“ J. Mol. Biol. 323 (4): 653–63. doi:10.1016 / s0022-2836 (02) 00947-6. PMID 12419256.

Další čtení

Adams MD, Dubnick M, Kerlavage AR a kol. (1992). "Sekvenční identifikace 2 375 genů lidského mozku". Příroda. 355 (6361): 632–4. doi:10.1038 / 355632a0. PMID 1538749. S2CID 4234345.
Morris CM, Heisterkamp N, Groffen J, Fitzgerald PH (1991). „Celý gen ABL je spojen s 5'-BCR u některých pacientů s Philadelphia-pozitivní leukémií“. Krev. 78 (4): 1078–84. doi:10.1182 / krev. V78.4.1078.1078. PMID 1868241.
Zhu QS, Heisterkamp N, Groffen J (1990). "Charakterizace lidských promotorových oblastí ABL". Onkogen. 5 (6): 885–91. PMID 2163052.
Soekarman D, van Denderen J, Hoefsloot L a kol. (1990). „Nová varianta fúzního produktu bcr-abl u akutní lymfoblastické leukémie pozitivní na chromozom Philadelphia“. Leukémie. 4 (6): 397–403. PMID 2193202.
Chen SJ, Chen Z, Font MP a kol. (1989). „Strukturální změny genů BCR a ABL v Ph1 pozitivních akutních leukémiích s přesmyky v prvním intronu genu BCR: další důkazy implikující Alu sekvence v translokaci chromozomu“. Nucleic Acids Res. 17 (19): 7631–42. doi:10.1093 / nar / 17.19.7631. PMC 334872. PMID 2678002.
Heisterkamp N, Stam K, Groffen J a kol. (1985). "Strukturální organizace genu bcr a její role v Ph 'translokaci". Příroda. 315 (6022): 758–61. doi:10.1038 / 315758a0. PMID 2989703. S2CID 4343076.
Shtivelman E, Lifshitz B, Gale RP a kol. (1986). "Alternativní sestřih RNA transkribovaných z lidského genu abl a z fúzovaného genu bcr-abl". Buňka. 47 (2): 277–84. doi:10.1016/0092-8674(86)90450-2. PMID 3021337. S2CID 36324337.
Grosveld G, Verwoerd T, van Agthoven T a kol. (1987). „Chronická myelocytární buněčná linie K562 obsahuje zlom v bcr a produkuje chimérický přepis bcr / c-abl“. Mol. Buňka. Biol. 6 (2): 607–16. doi:10,1128 / mcb.6.2.607. PMC 367552. PMID 3023859.
Bernards A, Rubin CM, Westbrook CA a kol. (1987). „První intron v lidském genu c-abl je dlouhý alespoň 200 kilobáz a je cílem translokací u chronické myeloidní leukémie.“. Mol. Buňka. Biol. 7 (9): 3231–6. doi:10,1128 / mcb.7.9.3231. PMC 367959. PMID 3313010.
Groffen J, Heisterkamp N, Grosveld F a kol. (1982). "Izolace lidských onkogenních sekvencí (homolog v-fes) z kosmidové knihovny". Věda. 216 (4550): 1136–8. doi:10.1126 / science.6281890. PMID 6281890.
Heisterkamp N, Groffen J, Stephenson JR (1983). "Lidský v-abl buněčný homolog". J. Mol. Appl. Genet. 2 (1): 57–68. PMID 6302194.
Heisterkamp N, Stephenson JR, Groffen J a kol. (1984). „Lokalizace onkogenu c-ab1 sousedící s bodem zlomu translokace u chronické myelocytární leukémie“. Příroda. 306 (5940): 239–42. doi:10.1038 / 306239a0. PMID 6316147. S2CID 4258884.
Groffen J, Stephenson JR, Heisterkamp N a kol. (1984). „Hraniční body chromozomů Philadelphie jsou seskupeny v omezené oblasti, bcr, na chromozomu 22“. Buňka. 36 (1): 93–9. doi:10.1016/0092-8674(84)90077-1. PMID 6319012. S2CID 9876892.
Chissoe SL, Bodenteich A, Wang YF a kol. (1995). „Sekvence a analýza lidského genu ABL, genu BCR a oblastí zapojených do chromozomální translokace Philadelphia“. Genomika. 27 (1): 67–82. doi:10.1006 / geno.1995.1008. PMID 7665185.
Litz CE, McClure JS, Copenhaver CM, Brunning RD (1993). "Duplikace malých segmentů v rámci hlavní oblasti klastru v oblasti chronické myeloidní leukémie". Krev. 81 (6): 1567–72. doi:10,1182 / krev. V81.6.1567.1567. PMID 8453102.
Mitchell P, Petfalski E, Tollervey D (1996). „3 'konec kvasinky 5.8S rRNA je generován mechanismem zpracování exonukleázou“. Genes Dev. 10 (4): 502–13. doi:10,1101 / gad.10.4.502. PMID 8600032.
Mitchell P, Petfalski E, Shevchenko A a kol. (1997). "Exosom: konzervovaný komplex zpracování eukaryotické RNA obsahující více 3 '-> 5' exoribonukleáz". Buňka. 91 (4): 457–66. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80432-8. PMID 9390555. S2CID 16035676.
Allmang C, Petfalski E, Podtelejnikov A, et al. (1999). „Exosom kvasinek a lidský PM-Scl jsou příbuzné komplexy 3 '-> 5' exonukleáz.". Genes Dev. 13 (16): 2148–58. doi:10.1101 / gad.13.16.2148. PMC 316947. PMID 10465791.
Brouwer R, Allmang C, Raijmakers R a kol. (2001). „Tři nové složky lidského exosomu“. J. Biol. Chem. 276 (9): 6177–84. doi:10,1074 / jbc.M007603200. PMID 11110791.
Chen CY, Gherzi R, Ong SE a kol. (2002). „AU vázající proteiny rekrutují exosom k degradaci mRNA obsahujících ARE“. Buňka. 107 (4): 451–64. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00578-5. PMID 11719186. S2CID 14817671.

Tento článek o gen na lidský chromozom 9 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000130713 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000039356 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: EXOSC2 exosome component 2“.

[pmid9390555-6] Mitchell P, Petfalski E, Shevchenko A, Mann M, Tollervey D (listopad 1997). "Exosom: konzervovaný komplex zpracování eukaryotické RNA obsahující více 3 '-> 5' exoribonukleáz". Buňka. 91 (4): 457–66. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80432-8. PMID 9390555. S2CID 16035676.

[pmid11719186-7] Chen CY, Gherzi R, Ong SE, Chan EL, Raijmakers R, Pruijn GJ, Stoecklin G, Moroni C, Mann M, Karin M (listopad 2001). „AU vázající proteiny rekrutují exosom k degradaci mRNA obsahujících ARE“. Buňka. 107 (4): 451–64. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00578-5. PMID 11719186. S2CID 14817671.

[pmid12419256-8] A ^b Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (listopad 2002). „Interakce proteinů a proteinů mezi lidskými exosomovými složkami podporují sestavování podjednotek typu RNáza PH do šestičlenného kruhu podobného PNPázě.“ J. Mol. Biol. 323 (4): 653–63. doi:10.1016 / s0022-2836 (02) 00947-6. PMID 12419256.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]