Exozomální složka 8 - Exosome component 8

EXOSC8
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2NN6
Identifikátory
Aliasy	EXOSC8, CIP3, EAP2, OIP2, RRP43, Rrp43p, bA421P11.3, p9, PCH1C, komponenta exosomu 8
Externí ID	OMIM: 606019 MGI: 1916889 HomoloGene: 12323 Genové karty: EXOSC8
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 13 (lidský)
Konec	37,009,614 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	54,735,393 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita exoribonukleázy; • Vazba prvků bohatých na AU; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA; • identická vazba na protein; • Vazba na oblast bohatou na mRNA 3'-UTR AU;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • exosom (komplex RNázy); • jádro; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • jaderný exosom (komplex RNázy); • cytoplazmatický exosom (komplex RNázy);
Biologický proces	• regulace stability mRNA; • Zpracování RNA; • RNA katabolický proces; • zpracování rRNA; • exonukleolytické trimování pro generování zralého 3'-konce 5,8S rRNA z tricistronického rRNA transkriptu (SSU-rRNA, 5,8S rRNA, LSU-rRNA); • nukleárně transkribovaný katabolický proces mRNA, exonukleolytický, 3'-5 '; • Zpracování 3'-konce U1 snRNA; • Zpracování 3'-konce U4 snRNA; • Zpracování 3'-konce U5 snRNA; • exonukleolytický nukleární transkribovaný katabolický proces mRNA zapojený do rozpadu závislého na deadenylaci; • dozor nad jadernou mRNA; • katabolický proces nukleární polyadenylace závislý na rRNA; • katabolický proces nukleární polyadenylace závislý na tRNA; • katabolický proces nukleární polyadenylace závislý na mRNA; • biologický proces; • katabolický proces rRNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	11340
	69639
	ENSG00000120699
	ENSMUSG00000027752
	Q96B26
	Q9D753
	NM_181503
	NM_001163570; NM_027148
	NP_852480
	NP_001157042; NP_081424
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Exozomální složka 8, také známý jako EXOSC8, je člověk gen, protein jehož výrobek je součástí exosomový komplex.^[5]

Interakce

Ukázalo se, že komponenta exozomu 8 komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000120699 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027752 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ "Entrez Gene: EXOSC8 exosomová složka 8".
^ ^A ^b Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (listopad 2002). „Interakce proteinů a proteinů mezi lidskými exosomovými složkami podporují sestavování podjednotek typu RNáza PH do šestičlenného kruhu podobného PNPázě.“ J. Mol. Biol. 323 (4): 653–63. doi:10.1016 / s0022-2836 (02) 00947-6. PMID 12419256.

Další čtení

Andersen JS, Lam YW, Leung AK a kol. (2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Lehner B, Sanderson CM (2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Genome Res. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2002). „Interakce proteinů a proteinů mezi lidskými exosomovými složkami podporují sestavování podjednotek typu RNáza PH do šestičlenného kruhu podobného PNPázě.“ J. Mol. Biol. 323 (4): 653–63. doi:10.1016 / S0022-2836 (02) 00947-6. PMID 12419256.
Jiang T, Altman S (2002). „Proteinová podjednotka lidské RNázy P, Rpp14 a její interagující partner, OIP2, mají 3 ′ → 5 ′ aktivitu exoribonukleázy“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (8): 5295–300. doi:10.1073 / pnas.072083699. PMC 122763. PMID 11929972.
Raijmakers R, Noordman YE, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2002). "Interakce protein-protein hCsl4p s jinými lidskými exosomovými podjednotkami". J. Mol. Biol. 315 (4): 809–18. doi:10.1006 / jmbi.2001.5265. PMID 11812149.
Chen CY, Gherzi R, Ong SE a kol. (2002). „AU vázající proteiny rekrutují exosom k degradaci mRNA obsahujících ARE“. Buňka. 107 (4): 451–64. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00578-5. PMID 11719186.
Jiang T, Altman S (2001). "Interakce protein - protein s podjednotkami lidské nukleární RNázy P". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 98 (3): 920–5. doi:10.1073 / pnas.021561498. PMC 14685. PMID 11158571.
Brouwer R, Allmang C, Raijmakers R a kol. (2001). „Tři nové složky lidského exosomu“. J. Biol. Chem. 276 (9): 6177–84. doi:10,1074 / jbc.M007603200. PMID 11110791.
Williams JM, Chen GC, Zhu L, Rest RF (1998). „Použití kvasinkového dvouhybridního systému k identifikaci proteinů lidských epiteliálních buněk, které vážou gonokokové proteiny Opa: intracelulární gonokoky váží pyruvátkinázu prostřednictvím svých proteinů Opa a pro růst vyžadují hostitelský pyruvát.“ Mol. Microbiol. 27 (1): 171–86. doi:10.1046 / j.1365-2958.1998.00670.x. PMID 9466265.

Tento článek o gen na lidský chromozom 13 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000120699 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027752 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] "Entrez Gene: EXOSC8 exosomová složka 8".

[pmid12419256-6] A ^b Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (listopad 2002). „Interakce proteinů a proteinů mezi lidskými exosomovými složkami podporují sestavování podjednotek typu RNáza PH do šestičlenného kruhu podobného PNPázě.“ J. Mol. Biol. 323 (4): 653–63. doi:10.1016 / s0022-2836 (02) 00947-6. PMID 12419256.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]