Exozomální složka 4 - Exosome component 4

EXOSC4
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2NN6
Identifikátory
Aliasy	EXOSC4, RRP41, RRP41A, Rrp41p, SKI6, Ski6p, hRrp41p, p12A, složka Exosome 4
Externí ID	OMIM: 606491 MGI: 1923576 HomoloGene: 6017 Genové karty: EXOSC4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 8 (lidský)
Konec	144,080,648 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	76,330,677 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita exoribonukleázy; • Vazba prvků bohatých na AU; • Aktivita 3'-5'-exoribonukleázy; • Vazba RNA; • Vazba na oblast bohatou na mRNA 3'-UTR AU;
Buněčná složka	• cytoplazmatický exosom (komplex RNázy); • transkripčně aktivní chromatin; • jaderný exosom (komplex RNázy); • cytoplazma; • exosom (komplex RNázy); • jádro; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • cytosol; • cytoskelet s mezivláknem;
Biologický proces	• obranná reakce na virus; • Zpracování na 3'-konci rRNA; • katabolický proces rRNA; • zpracování na 3'-konci snoRNA závislé na polyadenylaci; • Zpracování 3'-konce U4 snRNA; • nukleárně transkribovaný katabolický proces mRNA, exonukleolytický, 3'-5 '; • pozitivní regulace buněčného růstu; • nukleárně transkribovaný katabolický proces mRNA; • Deaminace DNA; • zrání 5,8S rRNA; • regulace stability mRNA; • dozor nad jadernou mRNA; • exonukleolytický nukleární transkribovaný katabolický proces mRNA zapojený do rozpadu závislého na deadenylaci; • histonová mRNA katabolický proces; • zpracování rRNA; • Hydrolýza RNA fosfodiesterovou vazbou, exonukleolytická;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	54512
	109075
	ENSG00000178896
	ENSMUSG00000034259
	Q9NPD3
	Q921I9
	NM_019037
	NM_175399
	NP_061910
	NP_780608
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Exozomální složka 4, také známý jako EXOSC4, je člověk gen, který je součástí exosomový komplex.^[5]

Interakce

Ukázalo se, že exozomová složka 4 komunikovat s Exozomální složka 2.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000178896 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034259 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: EXOSC4 exozomální složka 4“.
^ Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2002). „Interakce proteinů a proteinů mezi lidskými exosomovými složkami podporují sestavování podjednotek typu RNáza PH do šestičlenného kruhu podobného PNPázě.“ J. Mol. Biol. 323 (4): 653–63. doi:10.1016 / S0022-2836 (02) 00947-6. PMID 12419256.

Další čtení

Allmang C, Petfalski E, Podtelejnikov A, et al. (1999). „Exosom kvasinek a lidský PM-Scl jsou příbuzné komplexy 3 '-> 5' exonukleáz.". Genes Dev. 13 (16): 2148–58. doi:10.1101 / gad.13.16.2148. PMC 316947. PMID 10465791.
Brouwer R, Allmang C, Raijmakers R a kol. (2001). „Tři nové složky lidského exosomu“. J. Biol. Chem. 276 (9): 6177–84. doi:10,1074 / jbc.M007603200. PMID 11110791.
Chen CY, Gherzi R, Ong SE a kol. (2002). „AU vázající proteiny rekrutují exosom k degradaci mRNA obsahujících ARE“. Buňka. 107 (4): 451–64. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00578-5. PMID 11719186. S2CID 14817671.
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH a kol. (2002). "Řízená proteomická analýza lidského nukleolu". Curr. Biol. 12 (1): 1–11. doi:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID 11790298. S2CID 14132033.
Raijmakers R, Noordman YE, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2002). "Interakce protein-protein hCsl4p s jinými lidskými exosomovými podjednotkami". J. Mol. Biol. 315 (4): 809–18. doi:10.1006 / jmbi.2001.5265. PMID 11812149.
Brouwer R, Vree Egberts WT, Hengstman GJ a kol. (2002). „Autoprotilátky zaměřené na nové složky komplexu PM / Scl, lidský exosom“. Arthritis Res. 4 (2): 134–8. doi:10,1186 / ar389. PMC 83843. PMID 11879549.
Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2002). „Interakce proteinů a proteinů mezi lidskými exosomovými složkami podporují sestavování podjednotek typu RNáza PH do šestičlenného kruhu podobného PNPázě.“ J. Mol. Biol. 323 (4): 653–63. doi:10.1016 / S0022-2836 (02) 00947-6. PMID 12419256.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2003). „Asociace lidského autoantigenu PM / Scl-75 s exosomem závisí na nově identifikovaném N konci“. J. Biol. Chem. 278 (33): 30698–704. doi:10,1074 / jbc.M302488200. PMID 12788944.
Lejeune F, Li X, Maquat LE (2003). „Nonsense zprostředkovaný rozpad mRNA v buňkách savců zahrnuje dekapování, deadenylaci a exonukleolytické aktivity“. Mol. Buňka. 12 (3): 675–87. doi:10.1016 / S1097-2765 (03) 00349-6. PMID 14527413.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Lehner B, Sanderson CM (2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Genome Res. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK a kol. (2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Oh JH, Yang JO, Hahn Y a kol. (2006). "Transkriptomová analýza lidské rakoviny žaludku". Mamm. Genom. 16 (12): 942–54. doi:10.1007 / s00335-005-0075-2. PMID 16341674. S2CID 69278.
van Dijk EL, Schilders G, Pruijn GJ (2007). „Růst lidských buněk vyžaduje funkční cytoplazmatický exosom, který se účastní různých cest rozpadu mRNA“. RNA. 13 (7): 1027–35. doi:10,1261 / rna.575107. PMC 1894934. PMID 17545563.

Tento článek o gen na lidský chromozom 8 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000178896 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034259 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: EXOSC4 exozomální složka 4“.

[pmid12419256-6] Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2002). „Interakce proteinů a proteinů mezi lidskými exosomovými složkami podporují sestavování podjednotek typu RNáza PH do šestičlenného kruhu podobného PNPázě.“ J. Mol. Biol. 323 (4): 653–63. doi:10.1016 / S0022-2836 (02) 00947-6. PMID 12419256.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]