Exozomální složka 5 - Exosome component 5

EXOSC5
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2NN6
Identifikátory
Aliasy	EXOSC5, RRP41B, RRP46, Rrp46p, hRrp46p, p12B, exozomální složka 5
Externí ID	OMIM: 606492 MGI: 107889 HomoloGene: 5981 Genové karty: EXOSC5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	41,397,359 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	25,671,368 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Aktivita 3'-5'-exoribonukleázy; • aktivita exoribonukleázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • exosom (komplex RNázy); • jaderný exosom (komplex RNázy); • cytoplazmatický exosom (komplex RNázy); • jádro; • transkripčně aktivní chromatin; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• regulace stability mRNA; • nukleárně transkribovaný katabolický proces mRNA, exonukleolytický, 3'-5 '; • Zpracování na 3'-konci rRNA; • katabolický proces rRNA; • Deaminace DNA; • dozor nad jadernou mRNA; • obranná reakce na virus; • exonukleolytický nukleární transkribovaný katabolický proces mRNA zapojený do rozpadu závislého na deadenylaci; • Zpracování 3'-konce U4 snRNA; • zpracování na 3'-konci snoRNA závislé na polyadenylaci; • RNA katabolický proces; • zpracování rRNA; • Hydrolýza RNA fosfodiesterovou vazbou, exonukleolytická;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	56915
	27998
	ENSG00000077348
	ENSMUSG00000061286
	Q9NQT4
	Q9CRA8
	NM_020158
	NM_138586
	NP_064543
	NP_613052
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Exozomální složka 5, také známý jako EXOSC5, je člověk gen, který je součástí exosomový komplex.^[5]

Interakce

Ukázalo se, že exozomová složka 5 komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000077348 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000061286 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: EXOSC5 exozomální složka 5“.
^ ^A ^b Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (listopad 2002). „Interakce proteinů a proteinů mezi lidskými exosomovými složkami podporují sestavování podjednotek typu RNáza PH do šestičlenného kruhu podobného PNPázě.“ J. Mol. Biol. 323 (4): 653–63. doi:10.1016 / s0022-2836 (02) 00947-6. PMID 12419256.
^ Raijmakers R, Noordman YE, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (leden 2002). "Interakce protein-protein hCsl4p s jinými lidskými exosomovými podjednotkami". J. Mol. Biol. 315 (4): 809–18. doi:10.1006 / jmbi.2001.5265. PMID 11812149.

Další čtení

Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Allmang C, Petfalski E, Podtelejnikov A, et al. (1999). „Exosom kvasinek a lidský PM-Scl jsou příbuzné komplexy 3 '-> 5' exonukleáz.". Genes Dev. 13 (16): 2148–58. doi:10.1101 / gad.13.16.2148. PMC 316947. PMID 10465791.
Brouwer R, Allmang C, Raijmakers R a kol. (2001). „Tři nové složky lidského exosomu“. J. Biol. Chem. 276 (9): 6177–84. doi:10,1074 / jbc.M007603200. PMID 11110791.
Chen CY, Gherzi R, Ong SE a kol. (2002). „AU vázající proteiny rekrutují exosom k degradaci mRNA obsahujících ARE“. Buňka. 107 (4): 451–64. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00578-5. PMID 11719186. S2CID 14817671.
Raijmakers R, Noordman YE, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2002). "Interakce protein-protein hCsl4p s jinými lidskými exosomovými podjednotkami". J. Mol. Biol. 315 (4): 809–18. doi:10.1006 / jmbi.2001.5265. PMID 11812149.
Brouwer R, Vree Egberts WT, Hengstman GJ a kol. (2002). „Autoprotilátky zaměřené na nové složky komplexu PM / Scl, lidský exosom“. Arthritis Res. 4 (2): 134–8. doi:10,1186 / ar389. PMC 83843. PMID 11879549.
Yang XF, Wu CJ, Chen L a kol. (2002). „CML28 je široce imunogenní antigen, který je v nádorových buňkách nadměrně exprimován“. Cancer Res. 62 (19): 5517–22. PMC 4762257. PMID 12359762.
Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2002). „Interakce proteinů a proteinů mezi lidskými exosomovými složkami podporují sestavování podjednotek typu RNáza PH do šestičlenného kruhu podobného PNPázě.“ J. Mol. Biol. 323 (4): 653–63. doi:10.1016 / S0022-2836 (02) 00947-6. PMID 12419256.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Lehner B, Sanderson CM (2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Genome Res. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK a kol. (2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Zhou H, Zhang D, Wang Y a kol. (2006). „Indukce CML28-specifických cytotoxických T-buněčných odpovědí pomocí kotransfekovaných dendritických buněk s CML28 DNA vakcínou a SOCS1 malým interferujícím RNA expresním vektorem“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 347 (1): 200–7. doi:10.1016 / j.bbrc.2006.06.093. PMID 16815301.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000077348 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000061286 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: EXOSC5 exozomální složka 5“.

[pmid12419256-6] A ^b Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (listopad 2002). „Interakce proteinů a proteinů mezi lidskými exosomovými složkami podporují sestavování podjednotek typu RNáza PH do šestičlenného kruhu podobného PNPázě.“ J. Mol. Biol. 323 (4): 653–63. doi:10.1016 / s0022-2836 (02) 00947-6. PMID 12419256.

[pmid11812149-7] Raijmakers R, Noordman YE, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (leden 2002). "Interakce protein-protein hCsl4p s jinými lidskými exosomovými podjednotkami". J. Mol. Biol. 315 (4): 809–18. doi:10.1006 / jmbi.2001.5265. PMID 11812149.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]