Endoribonukleáza XendoU - Endoribonuclease XendoU
| XendoU | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 struktura xendou: sestřih nezávislého snorna zpracovávajícího endoribonukleázu | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | XendoU | ||||||||
| Pfam | PF09412 | ||||||||
| InterPro | IPR018998 | ||||||||
| |||||||||
V molekulární biologii Endoribonukleáza XendoU označuje a proteinová doména. Tato konkrétní položka představuje endoribonukleázy podílí se na RNA biosyntéza který byl pojmenován XendoU v Xenopus laevis (Africká drápá žába). Tato proteinová doména patří do a rodina evolučně příbuzných proteinů. XendoU je U-specifický kov závislý enzym který produkuje produkty s 2 '-3' cyklický fosfát konce.
Funkce
The endonukleáza, XendoU, je velmi zapojen do biosyntéza konkrétní podtřídy Xenopus laevis kódovaný malé nukleolární RNA (snoRNA), které jsou velkou rodinou nekódující RNA se základními rolemi v ribozom biogeneze. Většina snoRNA je kódována v intronech a je uvolňována prostřednictvím sestřihová reakce. Jiní místo toho produkují alternativní cestu skládající se z endonukleolytický zpracování pre-mRNA. XendoU je endoribonukleáza odpovědná za tuto aktivitu.[1]
Komplex XendoU-RNA je mangan (Mn2+)-nezávislý. Z toho vyplývá, že aktivity vázání a zpracování RNA lze funkčně oddělit, protože ionty jsou nezbytné pro štěpení.[2]
Struktura
XendoU je protein s jednou doménou, který má zhruba kulovitý tvar. Obsahuje devět alfa helixy a tři antiparalelní beta listy; druhé jsou seskupeny na jedné straně proteinu.[1]
Homologie
XendoU nemá žádné homologie na jakoukoli známou buňku RNáza. Má však sekvenční podobnost s proteiny předběžně anotovanými jako serin proteázy.[2]
Reference
- ^ A b Renzi F, Caffarelli E, Laneve P, Bozzoni I, Brunori M, Vallone B (2006). "Struktura endoribonukleázy XendoU: Od zpracování malé nukleolární RNA po těžký akutní respirační syndrom replikace koronaviru". Proc Natl Acad Sci U S A. 103 (33): 12365–70. Bibcode:2006PNAS..10312365R. doi:10.1073 / pnas.0602426103. PMC 1567885. PMID 16895992.
- ^ A b Gioia U, Laneve P, Dlakic M, Arceci M, Bozzoni I, Caffarelli E (2005). „Funkční charakterizace XendoU, endoribonukleázy zapojené do biosyntézy malé nukleolární RNA“. J Biol Chem. 280 (19): 18996–9002. doi:10,1074 / jbc.M501160200. PMID 15755742.