Enaptin - Enaptin

SYNE1
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasySYNE1, 8B, ARCA1, C6orf98, CPG2, EDMD4, MYNE1, Nesp1, SCAR8, dJ45H2.2, spektrinová repetice obsahující protein jaderného obalu 1, KASH1, AMCM
Externí IDOMIM: 608441 MGI: 1927152 HomoloGene: 52329 Genové karty: SYNE1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 6 (lidský)
Chr.Chromozom 6 (lidský)[1]
Chromozom 6 (lidský)
Genomické umístění pro SYNE1
Genomické umístění pro SYNE1
Kapela6q25.2Start152,121,684 bp[1]
Konec152,637,801 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001079686
NM_022027
NM_153399
NM_001347711
NM_001347732

RefSeq (protein)

NP_001334630
NP_001334631
NP_149062
NP_892006

NP_001073154
NP_001334640
NP_001334661
NP_071310
NP_700448

Místo (UCSC)Chr 6: 152,12 - 152,64 MbChr 10: 5,02 - 5,55 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Enaptin také známý jako nesprin-1 nebo synaptický protein jaderného obalu 1 (syne-1) váže aktin protein že u lidí, který je kódován pomocí SYNE1 gen.[5]

Funkce

Tento gen kóduje spektrinovou repetici obsahující protein exprimovaný v kosterním a hladkém svalstvu a periferní krvi lymfocyty, který se lokalizuje na jaderné membráně.[5]

Enaptin je a jaderný obal protein nalezen v člověk myocyty a synapse, který se skládá z 8 797 aminokyseliny. Enaptin se podílí na údržbě jaderný organizace a strukturální integrita, přivázání buněčného jádra k cytoskelet interakcí s jaderným obalem as F-aktin v cytoplazma.

Struktura

Enaptin obsahuje stočenou alfa-helikální oblast a velkou oblast beta-listu v horní části a alespoň čtyři alfa-helixy spojené dohromady, což naznačuje podobnost s kolagen. Protein se skládá ze tří hlavních částí, jak je vidět na obrázku: cytoplazmatický (1-8746), kotva pro typ IV membránový protein (8747-8767) a sekvence pro perinukleární prostor (8768-8797). Oblast v perinukleárním prostoru obsahuje a KASH doména.

The molekulární váha zralého proteinu je přibližně 1011 kDa a má to teoretické pI z 5,38.[6] Proteiny chemický vzorec je C.44189H71252N12428Ó14007S321. Má to teoretické Index nestability (II) z 51,63, což naznačuje, že by byl nestabilní v a zkumavka. Proteiny in vivo poločas rozpadu, Předpokládá se, že doba potřebná k tomu, aby polovina množství proteinu v buňce zmizela po jeho syntéze v buňce, bude přibližně 30 hodin (v savčí retikulocyty ).[7]

Klinický význam

Mutace v tomto genu byly spojeny s autozomálně recesivními spinocerebelární ataxie 8, označovaný také jako autosomálně recesivní cerebelární ataxie typu 1 nebo recesivní ataxie Beauce.[5]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000131018 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000096054 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ A b C "Entrez Gene: Spektrin obsahující opakování, jaderný obal 1".
  6. ^ „Compute pI / Mw for SYNE1_HUMAN (Q8NF91)“. EXPASY. Švýcarský institut pro bioinformatiku.
  7. ^ „ProtParam pro SYNE1_HUMAN (Q8NF91)“. EXPASY. Švýcarský institut pro bioinformatiku.

Další čtení

externí odkazy


Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.