RNA Drosophila roX - Drosophila roX RNA

Drosophila roX1 ncRNA
Rox1 SS.png
Konzervované sekundární struktura roX1 RNA
Identifikátory
SymbolroX1
RfamRF01667
Další údaje
RNA typCis-regulační prvek
DoményDrosophila
PDB strukturPDBe

RoX RNA je nekódující RNA (ncRNA) přítomná v mužově specifickém letálním (MSL) komplexu a je vyžadována pro sex kompenzace dávky v Drosophila. Protože muži obsahují pouze jeden X chromozom, dávka mušek kompenzuje chromozom X hyper-transkripcí chromozomu X. Toho je dosaženo vazbou komplexu MSL na chromozom X a indukcí histon H4 lysin 16 acetylace a umožňuje vznik euchromatin.[1][2] Tyto ncRNA byly poprvé objeveny v RNA extrahované z neuronálních buněk.[3][4]

V komplexu MSL byly identifikovány dvě RNA roX Drosophila melanogaster a bylo prokázáno, že jsou konzervovány u různých druhů drosophila. Ukázalo se, že dvě RNA roX, známé jako roX1 a roX2, se liší v primární sekvenci a délce sekvence, ale navzdory těmto rozdílům obsahují oba MSL vazebné místo a jsou funkčně redundantní.[5][6] Klonování geny roX a následující zarovnání sekvence z řady různých druhů drosophila identifikoval několik konzervované regiony a bylo také zjištěno, že roX RNA je přítomna pouze u mužských mušek.[7]

Sekundární struktura předpovědi předpovídaly a stonková smyčka být přítomen na 3' konec transkriptů roX RNA. Mutageneze v této oblasti, která buď pozměnila sekvenci, nebo zabránila tvorbě kmenové smyčky, se ukázalo, že je smrtelná u mužských mušek, protože nebyli schopni kompenzovat dávku, protože tyto mutace zabraňovaly vazbě MSL na X chromozom. Bylo také prokázáno, že v přítomnosti mutant roX RNA nebyl komplex MSL schopen lokalizovat na X chromozomu a nesprávně lokalizovat do heterochromatického chromocentru. To naznačuje, že roX RNA hraje roli při směrování MSL komplexu do X chromozomu.[7] Sekvenční zarovnání roX2 identifikovalo několik regionů zachování sekvence známé jako oblasti Gub a v roX1 chybí. Mnoho z těchto oblastí Gub je považováno za nadbytečné, protože mutace nemá žádný účinek, nicméně Gub1, který je přítomen v oblasti 3 'kmenové smyčky, se považuje za klíčový motiv požadovaný pro roX2, protože mutace Gub1 byly letální. Tyto studie ukazují, že RNA roX je nezbytná pro kompenzaci dávky, kde 3 ' stonková smyčka Oblast v RNA roX je klíčová pro lokalizaci MSL a předpokládá se, že je to motiv, který umožňuje, aby dvě RNA RNA byly funkčně redundantní.

Viz také

Reference

  1. ^ Meller, V .; Gordadze, P .; Park, Y .; Chu, X .; Stuckenholz, C .; Kelley, R .; Kuroda, M. (únor 2000). „Objednané shromáždění RNA roX do komplexů MSL na chromozomu X s kompenzací dávky v Drosophile“. Aktuální biologie. 10 (3): 136–143. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 00311-0. ISSN  0960-9822. PMID  10679323.
  2. ^ Hamada, N .; Park, J .; Gordadze, R .; Kuroda, I. (říjen 2005). „Globální regulace chromozomálních genů X komplexem MSL v Drosophila melanogaster“ (Volný plný text). Geny a vývoj. 19 (19): 2289–2294. doi:10.1101 / gad.1343705. ISSN  0890-9369. PMC  1240037. PMID  16204180.
  3. ^ Meller V; Wu K; Roman G .; Kuroda M; Davis R (1997). „RNA roX1 maluje chromozom X mužského druhu Drosophila a je regulován systémem kompenzace dávky“. Buňka. 88 (4): 445–457. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81885-1. PMID  9038336.
  4. ^ Amrein H, Axel R (1997). "Geny exprimované v neuronech dospělého muže Drosophila". Buňka. 88 (4): 459–469. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81886-3. PMID  9038337.
  5. ^ Franke, A .; Baker, B. (červenec 1999). „RNA rox1 a rox2 jsou základními složkami kompenzační látky, která zprostředkovává kompenzaci dávky u Drosophily.“ Molekulární buňka. 4 (1): 117–122. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80193-8. ISSN  1097-2765. PMID  10445033.
  6. ^ Meller, H .; Rattner, P. (březen 2002). „Geny roX kódují redundantní mužské specifické letální přepisy potřebné pro zacílení na komplex MSL“. Časopis EMBO (Volný plný text). 21 (5): 1084–1091. doi:10.1093 / emboj / 21.5.1084. ISSN  0261-4189. PMC  125901. PMID  11867536.
  7. ^ A b Park, W .; Kang, E .; Sypula, G .; Choi, J .; Ach, H .; Park, Y. (listopad 2007). „Evolučně konzervovaná doména roX2 RNA je dostatečná pro indukci acetylace H4-Lys16 na chromosomu Drosophila X“ (Volný plný text). Genetika. 177 (3): 1429–1437. doi:10.1534 / genetika.107.071001. ISSN  0016-6731. PMC  2147973. PMID  18039876.

externí odkazy