Digoxigenin - Digoxigenin
 | |
| Jména | |
|---|---|
| Název IUPAC 3-[(3S,5R,8R,9S,10S,12R,13S,14S,17R) -3,12,14-trihydroxy-10,13-dimethyl-l, 2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,15,16,17-tetradekahydrocyklopenta [A] fenanthren-17-yl] -2H-furan-5-on | |
| Identifikátory | |
| ChEBI | |
| ChEMBL | |
| ChemSpider | |
| Informační karta ECHA | 100.015.279  |
PubChem CID | |
| UNII | |
Řídicí panel CompTox (EPA) | |
| |
| Vlastnosti | |
| C23H34Ó5 | |
| Molární hmotnost | 390,51 g / mol |
| log P | 2.57510[1] |
Pokud není uvedeno jinak, jsou uvedeny údaje o materiálech v nich standardní stav (při 25 ° C [77 ° F], 100 kPa). | |
 ověřit (co je   ?) | |
| Reference Infoboxu | |
Digoxigenin (DIG) je a steroid nachází se výhradně v květinách a listech rostlin Digitalis purpurea, Digitalis orientalis a Digitalis lanata (náprstník), kde je připevněn k cukrům, k vytvoření glykosidy (např. Lanatosid C. ).[2]
Využití v biotechnologii
Digoxigenin je a stalo se, malý molekula s vysokou antigenicita, který se používá v mnoha aplikacích molekulární biologie podobně jako jiné populární hapteny, jako je 2,4-dinitrofenol, biotin, a fluorescein. Typicky se digoxigenin zavádí chemicky (časování ) na biomolekuly (proteiny, nukleové kyseliny), které mají být detekovány v dalších testech.
DIG-vazebné proteiny. Tinberg a kol. navržené umělé proteiny, které vážou DIG Jejich nejlepším pojivem, DIG10.3, byl protein o 141 aminokyselinách, který vázal DIG s a disociační konstanta (K.d) z 541 (+/- 193) pM.[3]
Anti-digoxigenin protilátky s vysokou spřízněnosti a specificita se používají v různých biologických imunotestech (např. ELISA ). Protilátky jsou pro vizualizaci a detekci značeny barvivy, enzymy nebo fluorescencí, přímo nebo sekundárně.
Digoxigenin je tedy univerzální imunoznačka, a zejména standard imunohistochemické značka pro hybridizace in situ.[4][5] V tomto případě je konjugován s jediným druhem RNA nukleosid trifosfát (obvykle uridin ), který je poté začleněn do RNA („riboprobe "), jak je syntetizován buněčným aparátem.
Umožňuje to:
- citlivé neradioaktivní in situ hybridizační sondy k detekci nukleových kyselin v rostlinách, schopné detekovat 1 ug plazmidové DNA.[6]
- konjugáty peptid-DIG, tj. bradykininový test velmi citlivými chemiluminiscenčními imunotesty.[7]
- fluorescenční a DIG značené značkovače pro kompetitivní imunotesty, tj detekce limitu digoxin, lék používaný k léčbě srdeční arytmie, až na 0,2 ng ml−1.[8]
- Digoxigenin může být konjugován s cukry studovat glykosylace Události,[9] dokonce i v biologických systémech.
Reference
- ^ "Digoxigenin". Bezpečnostní list materiálu. ChemSrc.
- ^ Polya G (2003). Biochemické cíle rostlinných bioaktivních sloučenin. New York: CRC Press. ISBN 978-0415308298.
- ^ Tinberg CE, Khare SD, Dou J, Doyle L, Nelson JW, Schena A, Jankowski W, Kalodimos CG, Johnsson K, Stoddard BL, Baker D (září 2013). "Výpočetní design proteinů vázajících ligand s vysokou afinitou a selektivitou". Příroda. 501 (7466): 212–216. doi:10.1038 / příroda12443. PMC 3898436. PMID 24005320.
- ^ Eisel D, Grünewald-Janho S, Krushen B, eds. (2002). Příručka aplikace DIG pro neradioaktivní in situ Hybridizace (3. vyd.). Penzberg: Roche Diagnostics.
- ^ Hauptmann G, Gerster T (srpen 1994). „Dvoubarevná hybridizace in situ na místě s obratlovci a embryi Drosophila“. Trendy v genetice. 10 (8): 266. doi:10.1016 / 0168-9525 (90) 90008-T. PMID 7940754.
- ^ Hart SM, Basu C (duben 2009). „Optimalizace systému imunoanalýzy založeného na digoxigeninu pro detekci genů v Arabidopsis thaliana“ (pdf). Journal of Biomolecular Techniques. 20 (2): 96–100. PMC 2685603. PMID 19503620.
- ^ Décarie A, Drapeau G, Closset J, Couture R, Adam A (1994). "Vývoj digoxigeninem značeného peptidu: aplikace na chemiluminoenzymovou imunotest bradykininu v zanícených tkáních". Peptidy. 15 (3): 511–8. doi:10.1016/0196-9781(94)90214-3. PMID 7937327.
- ^ Mayilo S, Ehlers B, Wunderlich M, Klar TA, Josel HP, Heindl D, Nichtl A, Kürzinger K, Feldmann J (červenec 2009). „Konkurenční homogenní imunoanalýza digoxigeninu založená na zhášení fluorescence nanočásticemi zlata“. Analytica Chimica Acta. 646 (1–2): 119–22. doi:10.1016 / j.aca.2009.05.023. PMID 19523564.
- ^ Goodarzi MT, Rafiq M, Turner G (květen 1995). „Vylepšená vícejamková imunotest s použitím lektinů značených digoxigeninem ke studiu glykosylace čištěných glykoproteinů“. Transakce s biochemickou společností. 23 (2): 168S. doi:10.1042 / bst023168s. PMID 7672194.