Dermatopontin - Dermatopontin
| DPT | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasy | DPT, TRAMP, dermatopontin | ||||||||||||||||||||||||
| Externí ID | OMIM: 125597 MGI: 1928392 HomoloGene: 1458 Genové karty: DPT | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortology | |||||||||||||||||||||||||
| Druh | Člověk | Myš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNA) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (protein) | |||||||||||||||||||||||||
| Místo (UCSC) | Chr 1: 168,7 - 168,73 Mb | Chr 1: 164,8 - 164,82 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed Vyhledávání | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Dermatopontin také známý jako kyselý matrixový protein bohatý na tyrosin (TRAMP) je a protein že u lidí je kódován DPT gen.[5][6] Dermatopontin je 22-kDa protein bez kolagenu extracelulární matrix (ECM) se odhaduje na 12 mg / kg hmotnosti mokré dermis.[7] Dosud byly homology identifikovány u pěti různých savců a 12 různých bezobratlých s více funkcemi.[8] v obratlovců, primární funkcí dermatopontinu je strukturální složka ECM (interakce s dekor a úprava kolagen fibrillogeneze ), buněčná adheze, modulace TGF-p činnost a buněčný klid ). Má také patologické postižení při infarktu (zvýšená exprese kolem zóny infarktu myokardu) a snížená exprese v leiomyom a fibróza. U bezobratlých hraje roli homolog dermatopontinu hemaglutinace, agregace buněk a buněk a exprese během infekce parazity.[8]
Buněčná a tkáňová distribuce
Dermatopontin je vyjádřen v extracelulární matrix (ECM), což je gelovitý tekutý prostor mimo buňku, který se skládá z kolagenových vláken, elastinových vláken, glykoproteinů a proteoglykanů (1). Složky ECM jsou spojeny s proteiny zabudovanými do plazmatické membrány buněk. Tyto membránové proteiny plní mnoho funkcí, včetně transportu materiálů, slouží jako enzymy pro chemické reakce, přenosu buněčných signálů a mezibuněčného spojení (1).
Dermatopontiny jsou primárně exprimovány ve fibroblastech, srdeční tkáni, kosterním svalu, mozku a slinivce břišní. Vyskytují se méně často v plicích a ledvinách a mnohem méně často ve fibroblastech z kůže s hypertrofickou lézí jizev a ve fibroblastech od pacientů se systémovou sklerózou než u normálních fibroblastů kůže (3).
V kůži se DPT nachází v kolagenových vláknech a také v cytoplazmě kultivovaných fibroblastů. “[8] DPT byl také nalezen v rohovka, konkrétně stroma.
Protein se nachází v různých tkáních a mnoho jeho tyrosinových zbytků je sulfatováno.[6]
Funkce
Dermatopontin je součástí mezibuněčné spojení který drží pohromadě membrány sousedních buněk (2). Složky ECM jsou spojeny s proteiny zabudovanými do plazmatické membrány, které jsou zase spojeny s vnitřní cytoskelet buňky. Tato spojení také usnadňují komunikaci mezi buňkami (1).
Dermatopontin zprostředkovává adhezi povrchem buněk integrin váže a urychluje tvorbu kolagenových vláken, což určuje velikost a uspořádání kolagenových fibril v extracelulární matrici (2). Mezi další funkce dermatopontinu patří stabilizace kolagenových fibril proti nízkoteplotní disociaci, inhibice buněčné proliferace, zvyšování TGFB1 činnost a případně slouží jako komunikační spojení mezi pokožkou fibroblasty povrch buňky a její extracelulární prostředí (3).
Samotný dermatopontin je nekolagenní protein ECM, ale usnadňuje vazbu kolagenu (2).
Dermatopontin je extracelulární matrix protein s možnými funkcemi v interakcích buněčné matice a sestavení matice. Extracelulární matrix (ECM) je známá jako nebuněčná složka, která se nachází ve všech orgánech a tkáních. ECM poskytuje nejen fyzické lešení pro jednotlivé buňky, ale také biomechanickou komunikaci mezi buňkami, která je nutná pro morfogeneze, diferenciace a homeostáza.[9] Jednou z hlavních rolí Dermatopontinu je jeho schopnost propagace buněčná adheze. Protože DPT je protein vázající proteoglykany, pomáhá to při adhezi mezi fibroblasty a keratinocyty. Dermatopontin (DPT) má vysokou expresi dermis a je součástí nekolagenní matrice. DPT má také důležitou roli při aktivaci transformující růstový faktor beta 1 (TGF-β1). TGF-β1 hraje důležitou roli v hojení ran.[7]
Re-epitelizace je také důležitou součástí hojení ran. DPT i reepitelizace závisí na migraci epidermy keratinocyty a mnoho různých růstových faktorů, které se nacházejí v extracelulární matrici. Bylo zjištěno, že DPT je schopen pomoci při migraci keratinocytů, ale selhal ve schopnosti indukovat buněčná proliferace. Keratinocyty jsou epidermální buňky, které pomáhají při produkci keratinu, což je vláknitý protein, který se nachází ve vlasech, peří a kopytách.
V kůži se DPT nachází v kolagenových vláknech a také v cytoplazmě kultivovaných fibroblastů. “ [8] DPT byl také nalezen v rohovka, konkrétně stroma.
Dermatopontin je postulován k úpravě chování TGF beta prostřednictvím interakce s dekor.[6]
Adheze buněk
Adheze buněk je účinek chování buněk v důsledku funkce dermatopontinu. I když aktivita buněčné adheze dermatopontinu není u určitých fibroblastů a neurogenních buněk silná, může mít různé role při hojení ran, protože dermatonpontin byl nalezen v prozatímní matrici, která interagovala s fibrinem a fibronektinem (Fn), který se zlepšil. aktivita buněčné adheze Fn.[8] Prozatímní matrice jsou formy extravazované krve po poranění, které tvoří tekutinu v ráně, fibrin a Fn. V prozatímní matrici funguje Fn jako adhezní a migrační struktura, která poskytuje podporu po celém ECM pro fibroblasty a buňky odvozené z cirkulace, zatímco v tkáních Fn působí jako aktivovaný a shromážděný do Fn matice (fibrilární struktura), která objeveny během vývoje embrya i hojení ran.[8] Dermatopontin byl nalezen v prozatímní matrici i v tekutině rány a prokázal, že dermatopontin podporoval tvorbu Fn fibril, které biologicky fungují při hojení dermální rány, a přítomnost dermatopontinu zvýšila interakci Fn s fibrinem i zesílení buněčné adheze, což naznačuje morfologické změny buněk, které byly adherovány ke komplexu.[10] Dermatopontin byl zjištěn v interakčních místech Fn na III_13 a III_14 a v kryptickém místě III_1, které se všechny podílely na tvorbě Fn fibril a inhibici dermatopontinu považovali za mezi III_ (2-3) a III_ (12 -14), protože dermatopontin nebyl zesílen interakcí mezi III_ (1-5) a III_ (1-2), což by mohly být domény, které se odvíjejí jako narušení dalších interdoménových interakcí.[10] V tomto případě je dermatopontin označený jako doména odvíjející se od molekuly Fn díky vazebnému místu pro anastellin (jediný známý protein, který indukuje tvorbu superfibronektinu) na Fn, je umístěn mezi III_ (2-3) a III_ (12-14) uvnitř interakční místo, které je důležitým vazebným místem pro tvorbu Fn fibril.[10] Dermatopontin je tedy protein v ECM, který může aktivovat Fn a indukovat tvorbu Fn fibril, což by mohlo pomoci při hojení ran v důsledku jeho akumulace v ráně, ať už z obklopené ECM nebo ze séra.
Aplikace
Dermatopontin hraje klíčovou roli v interakcích buněčné matrice a její sestavy, které mohou následně indukovat buněčné apoptóza. V osteosarkom MG-63 buněčná linie umlčení genu DPT snížilo proliferaci buněk MG-63.[11][nespolehlivý lékařský zdroj ]
DPT, spolu s lumican a dekor, je biomarker pro obří buněčný nádor kosti (GCTB).[12][nespolehlivý lékařský zdroj ]
Existuje také vztah mezi CCW (chronická kožní rána) a genem DPT. Hojení CCW lze inhibovat destrukcí některých proteinů matrice, jako je DPT a nízké hladiny exprese DTP zpomalují rychlost hojení.[13][nespolehlivý lékařský zdroj ]
DPT je také biomarker pro OSCC (orální spinocelulární karcinom ) také. Ukázalo se, že buňky OSCC měly potlačenou odpověď na DPT. Exprese DPT měla inverzní vztah s buněčnou adhezí a přímý vztah s její invazivností.[14][nespolehlivý lékařský zdroj ]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000143196 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026574 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Superti-Furga A, Rocchi M, Schäfer BW, Gitzelmann R (srpen 1993). "Doplňková sekvence DNA a chromozomální mapování lidského proteoglykanu vázajícího buněčného adhezivního proteinu (dermatopontin)". Genomika. 17 (2): 463–7. doi:10.1006 / geno.1993.1348. PMID 8104875.
- ^ A b C „Entrez Gene: DPT dermatopontin“.
- ^ A b Krishnaswamy VR, Korrapati PS (prosinec 2014). „Role dermatopontinu v reepitelizaci: důsledky pro migraci a proliferaci keratinocytů“. Vědecké zprávy. 4: 7385. doi:10.1038 / srep07385. PMC 4260223. PMID 25486882.
- ^ A b C d E F Okamoto O, Fujiwara S (2006). „Dermatopontin, nový hráč v biologii extracelulární matrice“. Výzkum pojivové tkáně. 47 (4): 177–89. doi:10.1080/03008200600846564. PMID 16987749.
- ^ Frantz C, Stewart KM, Weaver VM (prosinec 2010). "Extracelulární matice na první pohled". Journal of Cell Science. 123 (Pt 24): 4195–200. doi:10.1242 / jcs.023820. PMC 2995612. PMID 21123617.
- ^ A b C Kato A, Okamoto O, Ishikawa K, Sumiyoshi H, Matsuo N, Yoshioka H, Nomizu M, Shimada T, Fujiwara S (duben 2011). „Dermatopontin interaguje s fibronektinem, podporuje tvorbu fibronektinových fibril a zvyšuje adhezi buněk“. The Journal of Biological Chemistry. 286 (17): 14861–9. doi:10.1074 / jbc.M110.179762. PMC 3083196. PMID 21398523.
- ^ Xi LC, Ji YX, Yin D, Zhao ZX, Huang SC, Yu SL, Liu BY, Li HY (leden 2018). „Účinky umlčení genu pro dermatopontin na apoptózu a proliferaci buněk osteosarkomu MG ‑ 63“. Zprávy o molekulární medicíně. 17 (1): 422–427. doi:10,3892 / mmr. 2017,7866. PMID 29115446.
- ^ Lieveld M, Bodson E, De Boeck G, Nouman B, Cleton-Jansen AM, Korsching E, Benassi MS, Picci P, Sys G, Poffyn B, Athanasou NA, Hogendoorn PC, Forsyth RG (prosinec 2014). "Profilování genové exprese obrovského buněčného tumoru kosti odhaluje downregulaci složek extracelulární matrice dekrin a lumikán spojené s plicními metastázami". Virchows Archiv. 465 (6): 703–13. doi:10.1007 / s00428-014-1666-7. PMID 25304290.
- ^ Krishnaswamy VR, Manikandan M, Munirajan AK, Vijayaraghavan D, Korrapati PS (prosinec 2014). „Exprese a integrita dermatopontinu v chronických kožních ranách: zásadní faktor zhoršeného hojení ran“. Výzkum buněk a tkání. 358 (3): 833–41. doi:10.1007 / s00441-014-2000-z. PMID 25260909.
- ^ Yamatoji M, Kasamatsu A, Kouzu Y, Koike H, Sakamoto Y, Ogawara K, Shiiba M, Tanzawa H, Uzawa K (červen 2012). "Dermatopontin: potenciální prediktor pro metastázy lidské rakoviny ústní dutiny". International Journal of Cancer. 130 (12): 2903–11. doi:10.1002 / ijc.26328. PMID 21796630.
Další čtení
- Pochampally RR, Ylostalo J, Penfornis P, Matz RR, Smith JR, Prockop DJ (září 2007). „Histaminový receptor H1 a dermatopontin: nové navazující cíle receptoru vitaminu D“. Journal of Bone and Mineral Research. 22 (9): 1338–49. doi:10.1359 / jbmr.070605. PMID 17547532.
- Shaheduzzaman S, Krishnan V, Petrovic A, Bittner M, Meltzer P, Trent J, Venkatesan S, Zeichner S (2002). "Účinky HIV-1 Nef na profily exprese buněčných genů". Journal of Biomedical Science. 9 (1): 82–96. doi:10.1007 / BF02256581. PMID 11810028.
- Kuroda K, Okamoto O, Shinkai H (květen 1999). „Exprese dermatopontinu je snížena u hypertrofických jizev a kožních fibroblastů systémové sklerózy a je regulována transformací růstového faktoru-beta1, interleukinu-4 a matricového kolagenu“. The Journal of Investigative Dermatology. 112 (5): 706–10. doi:10.1046 / j.1523-1747.1999.00563.x. PMID 10233760.
- Okamoto O, Fujiwara S, Abe M, Sato Y (únor 1999). „Dermatopontin interaguje s transformujícím růstovým faktorem beta a zvyšuje jeho biologickou aktivitu“. The Biochemical Journal. 337 (Pt 3) (3): 537–41. doi:10.1042/0264-6021:3370537. PMC 1220007. PMID 9895299.
- Forbes EG, Cronshaw AD, MacBeath JR, Hulmes DJ (září 1994). „Tyrosin-rich acidic matrix protein (TRAMP) je tyrosin-sulfátovaný a široce distribuovaný protein extracelulární matrice“. FEBS Dopisy. 351 (3): 433–6. doi:10.1016/0014-5793(94)00907-4. PMID 8082810.