DHTKD1 - DHTKD1

DHTKD1
Identifikátory
Aliasy	DHTKD1, AMOXAD, CMT2Q, dehydrogenáza E1 a transketolasová doména obsahující 1
Externí ID	OMIM: 614984 MGI: 2445096 HomoloGene: 10278 Genové karty: DHTKD1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 10 (lidský)
Konec	12,123,221 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	5,942,792 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba thiamin pyrofosfátu; • aktivita oxidoreduktázy; • aktivita oxidoreduktázy, působící na aldehydovou nebo oxoskupinu dárců, disulfid jako akceptor; • aktivita oxoglutarát dehydrogenázy (přenášející sukcinyl);
Buněčná složka	• komplex oxoglutarát dehydrogenázy; • cytosol; • mitochondriální matice; • mitochondrie;
Biologický proces	• metabolismus; • cyklus trikarboxylové kyseliny; • glykolytický proces; • generace prekurzorových metabolitů a energie; • oxidačně-redukční proces; • diferenciace hematopoetických progenitorových buněk;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	55526
	209692
	ENSG00000181192
	ENSMUSG00000025815
	Q96HY7
	A2ATU0
	NM_018706
	NM_001081131
	NP_061176
	NP_001074600
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Dehydrogenáza E1 a transketolasová doména obsahující 1 je protein že u lidí je kódován DHTKD1 gen. Tento gen kóduje složku a mitochondriální Protein podobný komplexu 2-oxoglutarát-dehydrogenázy se podílí na degradačních drahách několika aminokyseliny, počítaje v to lysin. Mutace v tomto genu jsou spojeny s 2-aminoadipovou 2-oxoadipovou acidurií a Charcot-Marie-Toothova choroba Typ 2Q.^[5]

Struktura

Gen DHTKD1 kóduje protein, který má 919 aminokyselin a je jednou ze dvou izoformy v komplexu 2-oxoglutarát-dehydrogenáza.^[5]

Funkce

DHTKD1 je součástí superkomplexu podobného OGDHc, který je zodpovědný za zásadní krok v degradačních drahách L-lysinu, L-hydroxylysinu a L-tryptofanu. Konkrétně tento enzym katalyzuje dekarboxylace z 2-oxoadipát na glutaryl-CoA.^[6]Existuje silná korelace mezi úrovněmi exprese DHTKD1 a ATP produkce, což znamená, že DHTKD1 hraje rozhodující roli při výrobě energie v mitochondriích. Navíc potlačení DHTKD1 má za následek snížení hladin biogeneze a zvýšené úrovně reaktivní formy kyslíku (ROS) v mitochondriích. Globálně to zhoršuje růst buněk a zvyšuje je buněčná apoptóza.^[7]

Klinický význam

Mutace v genu DHTKD1 jsou spojeny s alfa-aminoadipovou a alfa-ketoadipovou acidurií, autozomálně recesivní vrozenou chybou lysinu, hydroxylysinu a degradace tryptofanu. U pacientů byla pozorována pouze hrstka mutací, včetně tří mutací missense, dvou nesmyslných mutací, dvou mutací dárce sestřihu, jedné duplikace a jedné delece a inzerce. Dvě mutace missense jsou nejčastější příčinou nedostatku. Klinický obraz tohoto onemocnění je nekonzistentní.^[6]^[8]

Mutace v tomto genu mohou také způsobit neurologické abnormality.^[7] Ve skutečnosti byla s DHTKD1 spojena jedna forma onemocnění Charcot-Marie-Tooth (CMT), i když toto onemocnění zahrnuje široké spektrum klinických neuropatií. Hyterozygotní nesmyslná mutace v genu konkrétně vede ke sníženým hladinám mRNA a proteinů DHTKD1 a ke zhoršení tvorby ATP. To implikuje tuto mutaci jako původce nemoci CMT-2.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000181192 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025815 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: Dehydrogenase E1 and transketolase domain containing 1“.
^ ^A ^b ^C Danhauser K, Sauer SW, Haack TB, Wieland T, Staufner C, Graf E, Zschocke J, Strom TM, Traub T, Okun JG, Meitinger T, Hoffmann GF, Prokisch H, Kölker S (prosinec 2012). „Mutace DHTKD1 způsobují 2-aminoadipovou a 2-oxoadipovou acidurii“. American Journal of Human Genetics. 91 (6): 1082–7. doi:10.1016 / j.ajhg.2012.10.006. PMC 3516599. PMID 23141293.
^ ^A ^b Xu W, Zhu H, Gu M, Luo Q, Ding J, Yao Y, Chen F, Wang Z (listopad 2013). „DHTKD1 je nezbytný pro mitochondriální biogenezi a udržování funkce“. FEBS Dopisy. 587 (21): 3587–92. doi:10.1016 / j.febslet.2013.08.047. PMID 24076469. S2CID 27665973.
^ Hagen J, Te Brinke H, Wanders RJ, Knegt AC, Oussoren E, Hoogeboom AJ, Ruijter GJ, Becker D, Schwab KO, Franke I, Duran M, Waterham HR, Sass JO, Houten SM (duben 2015). „Genetický základ alfa-aminoadipové a alfa-ketoadipové acidurie“. Journal of Inherited Metabolic Disease. 38 (5): 873–9. doi:10.1007 / s10545-015-9841-9. PMID 25860818. S2CID 20379124.

Další čtení

Xu W, Zhu H, Gu M, Luo Q, Ding J, Yao Y, Chen F, Wang Z (listopad 2013). „DHTKD1 je nezbytný pro mitochondriální biogenezi a udržování funkce“. FEBS Dopisy. 587 (21): 3587–92. doi:10.1016 / j.febslet.2013.08.047. PMID 24076469. S2CID 27665973.
Xu WY, Gu MM, Sun LH, Guo WT, Zhu HB, Ma JF, Yuan WT, Kuang Y, Ji BJ, Wu XL, Chen Y, Zhang HX, Sun FT, Huang W, Huang L, Chen SD, Wang ZG (Prosinec 2012). „Nesmyslná mutace v DHTKD1 způsobuje ve velkém čínském rodokmenu Charcot-Marie-Toothovu chorobu typu 2“. American Journal of Human Genetics. 91 (6): 1088–94. doi:10.1016 / j.ajhg.2012.09.018. PMC 3516600. PMID 23141294.
Bunik VI, Degtyarev D (květen 2008). „Vztahy mezi strukturou a funkcí v rodině 2-oxokyseliny dehydrogenázy: substrátově specifické podpisy a funkční předpovědi pro proteiny podobné 2-oxoglutarátdehydrogenáze“. Proteiny. 71 (2): 874–90. doi:10,1002 / prot.21766. PMID 18004749. S2CID 23882203.
Danhauser K, Sauer SW, Haack TB, Wieland T, Staufner C, Graf E, Zschocke J, Strom TM, Traub T, Okun JG, Meitinger T, Hoffmann GF, Prokisch H, Kölker S (prosinec 2012). „Mutace DHTKD1 způsobují 2-aminoadipovou a 2-oxoadipovou acidurii“. American Journal of Human Genetics. 91 (6): 1082–7. doi:10.1016 / j.ajhg.2012.10.006. PMC 3516599. PMID 23141293.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 10 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000181192 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025815 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: Dehydrogenase E1 and transketolase domain containing 1“.

[pmid231-6] A ^b ^C Danhauser K, Sauer SW, Haack TB, Wieland T, Staufner C, Graf E, Zschocke J, Strom TM, Traub T, Okun JG, Meitinger T, Hoffmann GF, Prokisch H, Kölker S (prosinec 2012). „Mutace DHTKD1 způsobují 2-aminoadipovou a 2-oxoadipovou acidurii“. American Journal of Human Genetics. 91 (6): 1082–7. doi:10.1016 / j.ajhg.2012.10.006. PMC 3516599. PMID 23141293.

[pmid240-7] A ^b Xu W, Zhu H, Gu M, Luo Q, Ding J, Yao Y, Chen F, Wang Z (listopad 2013). „DHTKD1 je nezbytný pro mitochondriální biogenezi a udržování funkce“. FEBS Dopisy. 587 (21): 3587–92. doi:10.1016 / j.febslet.2013.08.047. PMID 24076469. S2CID 27665973.

[8] Hagen J, Te Brinke H, Wanders RJ, Knegt AC, Oussoren E, Hoogeboom AJ, Ruijter GJ, Becker D, Schwab KO, Franke I, Duran M, Waterham HR, Sass JO, Houten SM (duben 2015). „Genetický základ alfa-aminoadipové a alfa-ketoadipové acidurie“. Journal of Inherited Metabolic Disease. 38 (5): 873–9. doi:10.1007 / s10545-015-9841-9. PMID 25860818. S2CID 20379124.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]