DFFA - DFFA
Fragmentační faktor DNA 45 kDa, terminální doména C. | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() nmr struktura domény dff-c | |||||||||
Identifikátory | |||||||||
Symbol | DFF-C | ||||||||
Pfam | PF09033 | ||||||||
InterPro | IPR015121 | ||||||||
|
DNA fragmentační faktor podjednotka alfa (DFFA), také známý jako Inhibitor kasasy aktivované DNázy (ICAD), je protein že u lidí je kódován DFFA gen.[5][6][7]
Apoptóza je proces buněčné smrti, který během vývoje savců odstraňuje toxické a / nebo zbytečné buňky. Apoptotický proces je doprovázen smršťováním a fragmentací buněk a jader a degradací chromozomální DNA na nukleozomální jednotky. Fragmentační faktor DNA (DFF) je heterodimerní protein o podjednotkách 40 kD (DFFB) a 45 kD (DFFA). DFFA je substrátem pro kaspázu-3 a během apoptózy spouští fragmentaci DNA. DFF se aktivuje, když je DFFA štěpena kaspázou-3. Štěpené fragmenty DFFA disociují od DFFB, aktivní složky DFF. Bylo zjištěno, že DFFB během apoptózy spouští fragmentaci DNA i kondenzaci chromatinu. Pro tento gen byly nalezeny dvě alternativně sestříhané varianty transkriptu kódující odlišné izoformy.[7]
The C-terminál doména DFFA (DFF-C) se skládá ze čtyř alfa-šroubovice, což jsou složený v uspořádání šroubovice s ucpávkou alfa-2 a alfa-3 proti dlouhému C-terminálu spirála (alfa-4). Hlavní funkcí této domény je inhibice DFFB vazbou na jeho C-terminál katalytické iontovými interakcemi, čímž inhibuje fragmentaci DNA v apoptotický proces. Kromě blokování DNase aktivita DFFB, C-koncová oblast DFFA je také důležitá pro DFFB specifické skládání garde aktivita, jak dokazuje schopnost DFFA znovu složit DFFB.[8]
Interakce
Bylo prokázáno, že služba DFFA komunikovat s DFFB.[9][10]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000160049 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028974 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Leek JP, Carr IM, Bell SM, Markham AF, Lench NJ (červen 1998). "Přiřazení genu pro faktor fragmentace DNA (DFFA) k pásmům lidských chromozomů 1p36.3 -> p36.2 hybridizací in situ". Cytogenetika a genetika buněk. 79 (3–4): 212–3. doi:10.1159/000134725. PMID 9605855.
- ^ Liu X, Zou H, Slaughter C, Wang X (duben 1997). „DFF, heterodimerní protein, který funguje downstream od kaspázy-3 a spouští fragmentaci DNA během apoptózy“. Buňka. 89 (2): 175–84. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80197-X. PMID 9108473. S2CID 14800864.
- ^ A b „Entrez Gene: DFFA DNA fragmentation factor, 45kDa, alpha polypeptide“.
- ^ Fukushima K, Kikuchi J, Koshiba S, Kigawa T, Kuroda Y, Yokoyama S (srpen 2002). "Struktura řešení DFF-C domény DFF45 / ICAD. Strukturální základ pro regulaci fragmentace apoptotické DNA". Journal of Molecular Biology. 321 (2): 317–27. doi:10.1016 / S0022-2836 (02) 00588-0. PMID 12144788.
- ^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
- ^ McCarty JS, Toh SY, Li P (říjen 1999). „Studie DFF45 v roli chaperonu a inhibitoru: dvě nezávislé inhibiční domény aktivity nukleázy DFF40“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 264 (1): 176–80. doi:10.1006 / bbrc.1999.1497. PMID 10527860.
Další čtení
- Nakanuma Y, Tsuneyama K, Sasaki M, Harada K (srpen 2000). "Zničení žlučovodů v primární biliární cirhóze". Osvědčené postupy a výzkum společnosti Bailliere. Klinická gastroenterologie. 14 (4): 549–70. doi:10.1053 / bega.2000.0103. PMID 10976014.
- Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Enari M, Sakahira H, Yokoyama H, Okawa K, Iwamatsu A, Nagata S (leden 1998). „DNáza aktivovaná kaspázou, která degraduje DNA během apoptózy, a její inhibitor ICAD“. Příroda. 391 (6662): 43–50. Bibcode:1998 Natur.391 ... 43E. doi:10.1038/34112. PMID 9422506. S2CID 4407426.
- Liu X, Zou H, Widlak P, Garrard W, Wang X (květen 1999). „Aktivace apoptotické endonukleázy DFF40 (DNáza nebo nukleáza aktivovaná kaspázou). Oligomerizace a přímá interakce s histonem H1“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (20): 13836–40. doi:10.1074 / jbc.274.20.13836. PMID 10318789.
- Gu J, Dong RP, Zhang C, McLaughlin DF, Wu MX, Schlossman SF (červenec 1999). „Funkční interakce DFF35 a DFF45 s nukleázou DFF40 aktivovanou fragmentací DNA kaspázou“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (30): 20759–62. doi:10.1074 / jbc.274.30.20759. PMID 10409614.
- Oh JJ, Grosshans DR, Wong SG, Slamon DJ (říjen 1999). "Identifikace rozdílně exprimovaných genů spojených s nadměrnou expresí HER-2 / neu v lidských buňkách rakoviny prsu". Výzkum nukleových kyselin. 27 (20): 4008–17. doi:10.1093 / nar / 27.20.4008. PMC 148668. PMID 10497265.
- McCarty JS, Toh SY, Li P (říjen 1999). „Studie DFF45 v roli chaperonu a inhibitoru: dvě nezávislé inhibiční domény aktivity nukleázy DFF40“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 264 (1): 176–80. doi:10.1006 / bbrc.1999.1497. PMID 10527860.
- McCarty JS, Toh SY, Li P (říjen 1999). "Více domén DFF45 se synergicky váže na DFF40: role štěpení kaspázy a sekvestrace aktivátorové domény DFF40". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 264 (1): 181–5. doi:10.1006 / bbrc.1999.1498. PMID 10527861.
- Lugovskoy AA, Zhou P, Chou JJ, McCarty JS, Li P, Wagner G (prosinec 1999). „Struktura řešení CIDE-N domény CIDE-B a model interakcí CIDE-N / CIDE-N v dráze fragmentace DNA apoptózy“. Buňka. 99 (7): 747–55. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81672-4. PMID 10619428.
- Otomo T, Sakahira H, Uegaki K, Nagata S, Yamazaki T (srpen 2000). "Struktura heterodimerního komplexu mezi doménami CAD CAD a ICAD". Přírodní strukturní biologie. 7 (8): 658–62. doi:10.1038/77957. PMID 10932250. S2CID 12925074.
- Xerri L, Palmerini F, Devilard E, Defrance T, Bouabdallah R, Hassoun J, Birg F (říjen 2000). „Častá nukleární lokalizace ICAD a cytoplazmatická společná exprese kaspázy-8 a kaspázy-3 v lidských lymfomech“. The Journal of Pathology. 192 (2): 194–202. doi:10.1002 / 1096-9896 (2000) 9999: 9999 <:: AID-PATH685> 3.0.CO; 2-M. PMID 11004695.
- Zhou P, Lugovskoy AA, McCarty JS, Li P, Wagner G (květen 2001). "Struktura řešení komplexu N-terminální domény DFF40 a DFF45 a vzájemná chaperonová aktivita DFF40 a DFF45". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 98 (11): 6051–5. Bibcode:2001PNAS ... 98.6051Z. doi:10.1073 / pnas.111145098. PMC 33420. PMID 11371636.
- Sharif-Askari E, Alam A, Rhéaume E, Beresford PJ, Scotto C, Sharma K, Lee D, DeWolf WE, Nuttall ME, Lieberman J, Sékaly RP (červen 2001). „Přímé štěpení lidského fragmentačního faktoru DNA-45 granzymem B indukuje uvolňování DNázy aktivované kaspázou a fragmentaci DNA“. Časopis EMBO. 20 (12): 3101–13. doi:10.1093 / emboj / 20.12.3101. PMC 150191. PMID 11406587.
- Tsukada T, Watanabe M, Yamashima T (prosinec 2001). „Důsledky CAD a DNázy II při ischemické neuronální nekróze specifické pro hipokampus primátů“. Journal of Neurochemistry. 79 (6): 1196–206. doi:10.1046 / j.1471-4159.2001.00679.x. PMID 11752060.
- Abel F, Sjöberg RM, Ejeskär K, Krona C, Martinsson T (únor 2002). „Analýzy apoptotických regulátorů CASP9 a DFFA na 1P36.2 odhalily vzácné varianty alely v lidských nádorech neuroblastomu“. British Journal of Cancer. 86 (4): 596–604. doi:10.1038 / sj.bjc.6600111. PMC 2375272. PMID 11870543.
- Charrier L, Jarry A, Toquet C, Bou-Hanna C, Chedorge M, Denis M, Vallette G, Laboisse CL (duben 2002). „Růstová fázově závislá exprese ICAD-L / DFF45 moduluje vzorec apoptózy v lidských buňkách rakoviny tlustého střeva“. Výzkum rakoviny. 62 (7): 2169–74. PMID 11929840.