Stimulační prvek posouvající rámce koronaviru - Coronavirus frameshifting stimulation element
Stimulační prvek posouvající rámce koronaviru | |
---|---|
Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence Corona_FSE | |
Identifikátory | |
Symbol | Corona_FSE |
Rfam | RF00507 |
Další údaje | |
RNA typ | Cis-reg; prvek shifthift |
Domény | Viry |
TAK | SO: 0000233 |
PDB struktur | PDBe |
v molekulární biologie, koronavirus řazení rámů stimulační prvek je konzervovaný kmenová smyčka z RNA nalezen v koronaviry které mohou propagovat ribozomální posun rámců. Tyto molekuly RNA interagují s a dolní region vytvořit a pseudoknot struktura; oblast se liší podle viru, ale je známo, že tvorba pseudoknotů stimuluje řazení rámů. V klasické situaci sekvence 32 nukleotidy pod kmenem je komplementární k části smyčky. U jiných koronavirů však může další struktura kmenové smyčky kolem 150 nukleotidů po proudu interagovat s členy této rodiny za vzniku líbání kmenových smyček a stimulovat posun snímků.[1]
Mezi další rodiny RNA identifikované v koronaviru patří SL-III cis-působící replikační prvek (CRE), motiv podobný koronaviru 3 'kmenové smyčky II (s2m), signál balení koronaviru a koronavirus 3 'UTR pseudoknot.
Během syntézy bílkovin může dojít k rychle se měnícím podmínkám v buňce ribozomální pauza. U koronavirů to může ovlivnit rychlost růstu a vyvolat translační opuštění. Tím se uvolní ribozom z mRNA a neúplný polypeptid je zaměřen na destrukci.[2]
Viz také
- Překladový posun snímků
- Kluzká sekvence
- Koronavirus 5 'UTR
- 3 'UTR koronaviru
- Koronavirový 3 'UTR pseudoknot
- Coronavirus 3 ′ kmen-smyčka II-jako motiv (s2m)
- Signál balení koronaviru
Reference
- ^ Baranov PV, Henderson CM, Anderson CB, Gesteland RF, Atkins JF, Howard MT (únor 2005). „Naprogramovaný posun ribozomálních rámců při dekódování genomu SARS-CoV“. Virologie. 332 (2): 498–510. doi:10.1016 / j.virol.2004.11.038. PMID 15680415.
- ^ Buchan, J. R .; Stansfield, I. (2007). "Zastavení buněčné výrobní linky: reakce na pozastavení ribozomů během překladu". Biol Cell. 99 (9): 475–487. doi:10.1042 / BC20070037.
externí odkazy
Tento molekulární nebo buněčná biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |