Colipase - Colipase

Dostupné proteinové struktury:
Pfam	struktur / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	shrnutí struktury
PDB	1eth, 1lpa, 1lpb, 1n8s, 1ks, 1ks

N-terminální doména kolipázy
	Struktura komplexu pankreatická lipáza-kolipáza inhibovaná C11 alkylfosfonátem.
Identifikátory
Symbol	Colipase
Pfam	PF01114
InterPro	IPR001981
STRÁNKA	PDOC00111
SCOP2	1lpb / Rozsah / SUPFAM
CDD	cd00039
Dostupné proteinové struktury:
Pfam	struktur / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	shrnutí struktury
PDB	1eth, 1lpa, 1lpb, 1n8s, 1ks, 1ks

CLPS
Identifikátory
Aliasy	CLPS, entrez: 1208, colipase
Externí ID	OMIM: 120105 MGI: 88421 HomoloGene: 1383 Genové karty: CLPS
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	35,797,344 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	28,560,766 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: aktivita aktivátoru enzymu 0010577;
Buněčná složka	• extracelulární oblast;
Biologický proces	• lipidový katabolický proces; • trávení; • GO: 0048554 pozitivní regulace katalytické aktivity; • metabolismus lipidů; • reakce na jídlo; • reakce na bakterii; • metabolický proces retinoidů; • trávení lipidů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1208
	109791
	ENSG00000137392
	ENSMUSG00000024225
	P04118
	Q9CQC2
	NM_001832; NM_001252597; NM_001252598
	NM_025469; NM_001317065
	NP_001239526; NP_001239527; NP_001823
	NP_001303994; NP_079745
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Colipase, zkráceně CLPS, je protein koenzym potřebné pro optimální aktivita enzymu z pankreatická lipáza. Je vylučován slinivka břišní v neaktivní formě, procolipase, která je aktivována v lumen střeva pomocí trypsin. Jeho funkcí je zabránit inhibičnímu účinku žlučových solí na lipázou katalyzovanou intraduodenální hydrolýzu dietních potravin s dlouhým řetězcem triglyceridy.

U lidí je protein kolipázy kódován pomocí CLPS gen.^[5]

Proteinová doména

Colipase je také a rodina evolučně příbuzných proteinů.

Kolipáza je malý proteinový kofaktor potřebný pankreatickou lipázou pro účinnou hydrolýzu lipidů ve stravě. Účinná absorpce tuků z potravy závisí na působení triglyceridové lipázy pankreatu. Kolipáza se váže na C-koncovou nekatalytickou doménu lipázy, čímž stabilizuje aktivní konformaci a podstatně zvyšuje hydrofobicitu svého vazebného místa. Strukturální studie komplexu a samotné kolipázy odhalily funkčnost jeho architektury.^[6]^[7]

Kolipáza je malý protein (12K) s pěti konzervovanými disulfidovými vazbami. Byly rozpoznány strukturní analogie mezi vývojovým proteinem (Dickkopf), C-terminální doménou pankreatické lipázy, N-koncovými doménami lipoxygenáz a C-terminální doménou alfa-toxinu. Tyto nekatalytické domény v posledně jmenovaných enzymech jsou důležité pro interakci s membránou. Nebylo stanoveno, zda jsou tyto domény také zapojeny do případné vazby na proteinový kofaktor, jako je tomu v případě pankreatické lipázy.^[7]

C-terminální doména kolipázy

struktura roztoku prasečí pankreatické procolipázy, jak je stanoveno z 1h homonukleární dvou- a trojrozměrné nmr

Identifikátory

Symbol

Colipase_C

1lpb / Rozsah / SUPFAM

CDD

cd00039

Dostupné proteinové struktury:
Pfam	struktur / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	shrnutí struktury

Viz také

Enterostatin

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000137392 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024225 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Davis RC, Xia YR, Mohandas T, Schotz MC, Lusis AJ (květen 1991). "Přiřazení genu lidské pankreatické kolipázy k chromozomu 6p21.1 pter". Genomika. 10 (1): 262–5. doi:10.1016 / 0888-7543 (91) 90509-D. PMID 2045105.
^ Lowe ME (1997). "Struktura a funkce pankreatické lipázy a kolipázy". Annu. Rev. Nutr. 17: 141–158. doi:10.1146 / annurev.nutr.17.1.141. PMID 9240923.
^ ^A ^b Verger R, van Tilbeurgh H, Cambillau C, Bezzine S, Carriere F (1999). "Kolipáza: struktura a interakce s pankreatickou lipázou". Biochim. Biophys. Acta. 1441 (2–3): 173–184. doi:10.1016 / s1388-1981 (99) 00149-3. PMID 10570245.
^ Egloff MP, Marguet F, Buono G, Verger R, Cambillau C, van Tilbeurgh H (březen 1995). „Struktura rozlišení 2,46 A komplexu pankreatické lipázy a kolipázy inhibovaná alkylfosfonátem C11“. Biochemie. 34 (9): 2751–62. doi:10.1021 / bi00009a003. PMID 7893686.

Další čtení

Weyrich P, Albet S, Lammers R a kol. (2009). „Genetická variabilita prokolipázy souvisí se změnou sekrece inzulínu u nediabetických bělochů“. Exp. Clin. Endokrinol. Cukrovka. 117 (2): 83–7. doi:10.1055 / s-2008-1078733. PMID 18726866.
Crandall WV, Lowe ME (2001). „Zbytky kolipázy Glu64 a Arg65 jsou nezbytné pro normální trávení tuků zprostředkovaných lipázou v přítomnosti micel žlučové soli“. J. Biol. Chem. 276 (16): 12505–12. doi:10,1074 / jbc.M009986200. PMID 11278590.
Miled N, Canaan S, Dupuis L a kol. (2000). "Trávicí lipázy: od trojrozměrné struktury k fyziologii". Biochimie. 82 (11): 973–86. doi:10.1016 / S0300-9084 (00) 01179-2. PMID 11099794.
van Tilbeurgh H, Egloff MP, Martinez C a kol. (1993). „Mezifázová aktivace komplexu lipáza-procolipáza smíšenými micelami odhalená rentgenovou krystalografií“. Příroda. 362 (6423): 814–20. Bibcode:1993 Natur.362..814V. doi:10.1038 / 362814a0. PMID 8479519. S2CID 4305832.
Wermter AK, Scherag A, Holter K a kol. (2009). „Gen procolipase: žádná souvislost s časným nástupem obezity nebo příjmu tuku“. Fakta o obezitě. 2 (1): 40–4. doi:10.1159/000196379. PMC 6444705. PMID 20054203.
Lindner I, Helwig U, Rubin D a kol. (2005). „Předpokládaná asociace mezi novým polymorfismem v exonu 3 (Arg109Cys) genu pro pankreatickou colipázu a diabetes mellitus 2. typu ve dvou nezávislých populacích kavkazských studií“. Mol Nutr Food Res. 49 (10): 972–6. doi:10.1002 / mnfr.200500087. PMID 16189801.
Sims HF, Lowe ME (1992). „Gen lidské kolipázy: izolace, chromozomální umístění a tkáňově specifická exprese“. Biochemie. 31 (31): 7120–5. doi:10.1021 / bi00146a013. PMID 1643046.
Lowe ME, Rosenblum JL, McEwen P, Strauss AW (1990). "Klonování a charakterizace lidské colipázy cDNA". Biochemie. 29 (3): 823–8. doi:10.1021 / bi00455a032. PMID 2337598.
van Tilbeurgh H, Bezzine S, Cambillau C a kol. (1999). "Kolipáza: struktura a interakce s pankreatickou lipázou". Biochim. Biophys. Acta. 1441 (2–3): 173–84. doi:10.1016 / s1388-1981 (99) 00149-3. PMID 10570245.
D'Silva S, Xiao X, Lowe ME (2007). „Polymorfismus v genu kódujícím procolipázu produkuje kolipázu Arg92Cys se sníženou funkcí proti triglyceridům s dlouhým řetězcem“. J. Lipid Res. 48 (11): 2478–84. doi:10.1194 / ml. M700371-JLR200. PMC 3684974. PMID 17715423.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Sternby B, Engström A, Hellman U a kol. (1984). "Primární sekvence lidské pankreatické kolipázy". Biochim. Biophys. Acta. 784 (1): 75–80. doi:10.1016/0167-4838(84)90175-4. PMID 6691986.
Sias B, Ferrato F, Grandval P a kol. (2004). „Protein 2 související s lidskou pankreatickou lipázou je galaktolipáza“. Biochemie. 43 (31): 10138–48. doi:10.1021 / bi049818d. PMID 15287741.
Lowe ME (1997). "Struktura a funkce pankreatické lipázy a kolipázy". Annu. Rev. Nutr. 17: 141–58. doi:10.1146 / annurev.nutr.17.1.141. PMID 9240923.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2002). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Sugar IP, Mizuno NK, Momsen MM a kol. (2003). "Regulace lipáz lipid-lipidovými interakcemi: důsledky pro lipidem zprostředkovanou signalizaci v buňkách". Chem. Phys. Lipidy. 122 (1–2): 53–64. doi:10.1016 / S0009-3084 (02) 00178-0. PMID 12598038.
van Tilbeurgh H, Sarda L, Verger R, Cambillau C (1992). "Struktura komplexu pankreatická lipáza-procolipáza". Příroda. 359 (6391): 159–62. Bibcode:1992 Natur.359..159V. doi:10.1038 / 359159a0. PMID 1522902. S2CID 4360354.
Davis RC, Xia YR, Mohandas T a kol. (1991). "Přiřazení genu lidské pankreatické kolipázy k chromozomu 6p21.1 pter". Genomika. 10 (1): 262–5. doi:10.1016 / 0888-7543 (91) 90509-D. PMID 2045105.

externí odkazy

Kolipázy v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro Pig Colipase

Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR001981

Tento enzym související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000137392 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024225 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid2045105-5] Davis RC, Xia YR, Mohandas T, Schotz MC, Lusis AJ (květen 1991). "Přiřazení genu lidské pankreatické kolipázy k chromozomu 6p21.1 pter". Genomika. 10 (1): 262–5. doi:10.1016 / 0888-7543 (91) 90509-D. PMID 2045105.

[PUB00006494-6] Lowe ME (1997). "Struktura a funkce pankreatické lipázy a kolipázy". Annu. Rev. Nutr. 17: 141–158. doi:10.1146 / annurev.nutr.17.1.141. PMID 9240923.

[PUB00006457-7] A ^b Verger R, van Tilbeurgh H, Cambillau C, Bezzine S, Carriere F (1999). "Kolipáza: struktura a interakce s pankreatickou lipázou". Biochim. Biophys. Acta. 1441 (2–3): 173–184. doi:10.1016 / s1388-1981 (99) 00149-3. PMID 10570245.

[pmid7893686-8] Egloff MP, Marguet F, Buono G, Verger R, Cambillau C, van Tilbeurgh H (březen 1995). „Struktura rozlišení 2,46 A komplexu pankreatické lipázy a kolipázy inhibovaná alkylfosfonátem C11“. Biochemie. 34 (9): 2751–62. doi:10.1021 / bi00009a003. PMID 7893686.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]