Claire M. Fraser - Claire M. Fraser

Pro ostatní lidi jménem Claire Fraser viz Claire Fraser (disambiguation).
Claire M Fraser
Claire M Fraser-Liggett (oříznuto) .jpg
narozený1955
Národnostamerický
Alma mater
Ocenění
Vědecká kariéra
Pole
InstituceUniversity of Maryland, Baltimore
TezeAutoprotilátky a monoklonální protilátky proti ℓgbℓs-adrenergním receptorům: jejich role v charakterizaci receptorů a lidské fyziologii (1981)
webová stránka[1]

Claire M. Fraser (narozen 1955) je Američan genom vědec a mikrobiolog který pracoval v mikrobiální genomice a genomové medicíně.[1] Její výzkum přispěl k pochopení rozmanitosti a vývoje mikrobiálního života. Fraser je ředitelem Ústavu pro genomové vědy v Lékařská fakulta University of Maryland v Baltimore, MD, kde je držitelkou profesorského titulu děkana na lékařské fakultě. Má společné jmenování na fakultě lékařské fakulty University of Maryland v odděleních medicíny a mikrobiologie / imunologie. V roce 2019 začala vykonávat jednoroční funkční období jako nově zvolená prezidentka pro Americká asociace pro rozvoj vědy (AAAS), po kterém bude následovat jednoleté funkční období prezidenta AAAS od února 2020 a jednoleté funkční období jako předseda představenstva v únoru 2021.[2]

Časný život

Fraser byl vychován ředitelem střední školy a učitelem základní školy v Saugus, MA předměstí Boston, MA.[1] Ve škole si vedla dobře a vždy se zajímala o učení.[1] Věda se začala zajímat poté, co ji na střední škole učili biologii.[1] Na Rensselaer Polytechnic Institute (RPI), během svého posledního roku, provedla nezávislý výzkum ve výzkumné laboratoři.[1]

Vzdělávání

Fraser ji přijal B.S. titul v oboru biologie od Rensselaer Polytechnic Institute v roce 1977 a ona Ph.D. titul z farmakologie na Státní univerzita v New Yorku v Buffalu v roce 1981 s prací nazvanou „Autoprotilátky a monoklonální protilátky proti ℓgb -s-adrenergním receptorům: jejich role v charakterizaci receptorů a lidské fyziologii“.[3]

Kariéra

Fraser je autorem více než 300 publikací s více než 50 000 citacemi, upravil čtyři knihy a pracoval v redakčních radách devíti vědeckých časopisů.[4] Je součástí 23 vydaných patentů a 19 publikovaných patentů[4]

Genomika

V letech 1998 až 2007 byl Fraser prezidentem a ředitelem společnosti Institut pro genomický výzkum (TIGR) v Rockville, MD a vedl týmy, které sekvenovaly genomy bakteriálních a parazitických patogenů a první modelovou rostlinu, Arabidopsis thaliana.[5][6][7][8] V roce 1995 byl Fraser součástí týmu, který nejprve sekvenoval kompletní genom volně žijícího organismu -Haemophilus influenzae—Bakterie, která způsobuje infekce dolních cest dýchacích a meningitidu u kojenců a malých dětí.[9] V roce 2007 se Fraser připojil k University of Maryland School of Medicine jako ředitel nového Ústavu pro genomové vědy.[10]

Fraserova práce na roce 2001 Amerithrax Vyšetřování vedlo k identifikaci čtyř genetických mutací v antrax spory, které umožnily FBI vystopovat materiál zpět k jeho původnímu zdroji.[8] Toto úsilí katalyzovalo rozvoj oboru mikrobiální forenzní analýzy. Je expertkou v mikrobiální forenzní oblasti a v rostoucím zájmu o dvojí použití - výzkum, který může poskytnout znalosti a technologie, které by mohly být nesprávně použity.[11]

Fraser vedl úsilí financované NIAID v oblasti genomiky infekčních onemocnění, včetně aktuální iterace genomových center pro infekční onemocnění.[12] Minulé i současné studie financované prostřednictvím těchto iniciativ mají za cíl prozkoumat dynamické interakce mezi vysoce prioritními patogeny, hostiteli, jejich mikrobioty, imunitním systémem a prostředím s cílem poskytnout komplexní porozumění determinantům infekční choroby s hypotézou - řízený výzkum využívající vysoce výkonné technologie „-omics“.[13][14][15][16][17] Tyto projekty stimulují a zlepšují neustálý vývoj technologií v oblasti technologií a datových jader.[18][19][20]

Fraserův současný výzkum je součástí Projekt lidského mikrobiomu a je zaměřen na to, jak se mění struktura a funkce mikrobiálních komunit v lidském gastrointestinálním traktu ve spojení s chorobami, jako je obezita a zánětlivé onemocnění střev a jak tyto komunity reagují na intervence, včetně ústních očkování a probiotika správa.[21][22]

Poradní panely a redakční rady

V roce 2019 si Fraser odpykává jednoroční funkční období jako nově zvolený prezident pro Americká asociace pro rozvoj vědy (AAAS), po kterém bude následovat jednoleté funkční období prezidenta AAAS od února 2020 a jednoleté funkční období jako předseda představenstva v únoru 2021.[2] Při přijímání nominace na kandidáta na prezidenta AAAS vyjádřil Fraser přání využít tuto pozici jako horlivý mluvčí vědy a podporovat aplikaci vědecké metody k řešení našich nejnaléhavějších problémů, včetně klimatická změna, antimikrobiální rezistence stejně jako bezpečnost potravin, vodní bezpečnost, a energetická bezpečnost.[23] Poznamenává, že „naši schopnost reagovat na tyto výzvy do značné míry brzdil nedostatek adekvátního financování, tendence financovat„ bezpečnější “výzkumné projekty a relativní nedostatek důvěry veřejnosti ve vědu.“[23]

Fraser byl redaktorem časopisů mBio, Journal of Bacteriology, Microbial Genomics (journal), Molekulární případové studie, a DNA a buněčná biologie.[24][25][26][27][28] Od roku 2006 působil Fraser také jako člen představenstva společnosti Becton, Dickinson and Company (BD), společnosti se zdravotnickými technologiemi z žebříčku Fortune 500.[29]

Ocenění a nominace

Osobní život

Fraser byl předtím ženatý Craig Venter. Od roku 2013 je vdaná za Jacka Kammera, autora, který zkoumá genderové otázky z mužského hlediska.[43] Fraser vlastnil několik standardních pudlů, včetně Shadowa, jehož genom byl sekvenován.[44]

Reference

  1. ^ A b C d E Katherine Lee (17. prosince 2018). ""Claire M. Fraser je průkopnice, která teprve začíná"". Citováno 31. března 2019.
  2. ^ A b „Průkopník mikrobiální genomiky Claire M. Fraserová jmenována zvoleným prezidentem AAAS“.
  3. ^ „Claire Fraser-Liggett“.
  4. ^ A b „Google Scholar“.
  5. ^ Fraser, C. M.; Gocayne, J. D .; et al. (1995). "Minimální genový doplněk Mycoplasma genitalium". Věda. 270 (5235): 397–403. Bibcode:1995Sci ... 270..397F. doi:10.1126 / science.270.5235.397. PMID  7569993.CS1 maint: číselné názvy: seznam autorů (odkaz)
  6. ^ Fraser, C. M.; Casjens, S .; et al. (1997). „Genomická sekvence spirochety s lymskou boreliózou, Borrelia burgdorferi“. Příroda. 390 (6660): 580–586. Bibcode:1997 Natur.390..580F. doi:10.1038/37551. PMID  9403685.
  7. ^ Fraser, C. M.; Norris, S. J .; et al. (1998). "Kompletní genomová sekvence Treponema pallidum, syfilis spirochete". Věda. 281 (5375): 375–388. Bibcode:1998Sci ... 281..375F. doi:10.1126 / science.281.5375.375. PMID  9665876.
  8. ^ A b Rasko, D. A .; Worsham, P.L .; Abshire, T. G .; Stanley, S. T .; Bannan, J. D .; Wilson, M. R.; Langham, R. J .; Decker, R. S .; Jiang, L .; Read, T. D .; Phillippy, A. M .; Salzberg, S.L .; Pop, M .; Van Ert, M. N .; Kenefic, L. J .; Keim, P. S .; Fraser-Liggett, C. M .; Ravel, J. (2011). „Srovnávací analýza genomu Bacillus anthracis na podporu vyšetřování Amerithrax“. Sborník Národní akademie věd. 108 (12): 5027–5032. doi:10.1073 / pnas.1016657108. ISSN  0027-8424. PMC  3064363. PMID  21383169.
  9. ^ Fleischmann, R .; Adams, M .; Bílá, O; Clayton, R .; Kirkness, E .; Kerlavage, A .; Bult, C .; Tomb, J .; Dougherty, B .; Merrick, J .; al., e. (1995). „Náhodné sekvenování a shromáždění celého genomu Haemophilus influenzae Rd ". Věda. 269 (5223): 496–512. Bibcode:1995Sci ... 269..496F. doi:10.1126 / science.7542800. ISSN  0036-8075. PMID  7542800.
  10. ^ „Lékařská fakulta University of Maryland“. somvweb.som.umaryland.edu. Archivovány od originál dne 2018-03-27. Citováno 2015-10-28.
  11. ^ Fraser, Claire M .; Dando, Malcolm R. (2001). „Genomika a budoucí biologické zbraně: potřeba preventivních opatření biomedicínské komunity“. Genetika přírody. 29 (3): 253–256. doi:10.1038 / ng763. ISSN  1061-4036.
  12. ^ „Genomická centra pro infekční nemoci (GCID)“. Citováno 30. března 2019.
  13. ^ „Přehled, hostitel, patogen a mikrobiom: determinanty výsledku nemoci“. Citováno 30. března 2019.
  14. ^ Richter, Taylor K. S .; Hazen, Tracy H .; Lam, Diana; Coles, Christian L .; Seidman, Jessica C .; Vy, Yaqi; Silbergeld, Ellen K .; Fraser, Claire M .; Rasko, David A .; Bradford, Patricia A. (2018). „Časová variabilita rozmanitosti Escherichia coli v gastrointestinálním traktu tanzanských dětí s expozicí antibiotikům i bez nich“. mSphere. 3 (6). doi:10,1128 / mSphere.00558-18. ISSN  2379-5042.
  15. ^ Dara, Antoine; Drábek, Elliott F .; Travassos, Mark A .; Moser, Kara A .; Delcher, Arthur L .; Su, Qi; Hostelley, Timothy; Coulibaly, Drissa; Daou, Modibo; Dembele, Ahmadou; Diarra, Issa; Kone, Abdoulaye K .; Kouriba, Bourema; Laurens, Matthew B .; Niangaly, Amadou; Traore, Karim; Tolo, Youssouf; Fraser, Claire M .; Thera, Mahamadou A .; Djimde, Abdoulaye A .; Doumbo, Ogobara K .; Plough, Christopher V .; Silva, Joana C. (2017). „Nový algoritmus rekonstrukce varů odhaluje vysokou variabilitu sekvence varů v jedné geografické poloze v Mali“. Genomová medicína. 9 (1). doi:10.1186 / s13073-017-0422-4. ISSN  1756-994X. PMC  5368897. PMID  28351419.
  16. ^ Chibucos, Marcus C .; Soliman, Sameh; Gebremariam, Teclegiorgis; Lee, Hongkyu; Daugherty, Sean; Orvis, Joshua; Shetty, Amol C .; Crabtree, Jonathan; Hazen, Tracy H .; Etienne, Kizee A .; Kumari, Priti; O’Connor, Timothy D .; Rasko, David A .; Filler, Scott G .; Fraser, Claire M .; Lockhart, Shawn R .; Skory, Christopher D .; Ibrahim, Ashraf S .; Bruno, Vincent M. (2016). „Integrovaný genomový a transkriptomický průzkum hub způsobujících mukormykózu“. Příroda komunikace. 7 (1). doi:10.1038 / ncomms12218. ISSN  2041-1723. PMC  4961843. PMID  27447865.
  17. ^ Sahl, Jason W .; Sistrunk, Jeticia R .; Fraser, Claire M .; et al. (2015). „Vyšetření populační struktury Enterotoxigenic Escherichia coli během infekce člověka“. mBio. 6 (3). doi:10,1128 / mBio.00501-15. ISSN  2150-7511. PMC  4462620. PMID  26060273.
  18. ^ Chung, Matthew; Teigen, Laura; Liu, Hong; Libro, Silvia; Shetty, Amol; Kumar, Nikhil; Zhao, Xuechu; Bromley, Robin E .; Tallon, Luke J .; Sadzewicz, Lisa; Fraser, Claire M .; Rasko, David A .; Filler, Scott G .; Foster, Jeremy M .; Michalski, Michelle L .; Bruno, Vincent M .; Dunning Hotopp, Julie C. (2018). „Cílené obohacování překonává jiné obohacovací techniky a umožňuje více multidruhových analýz RNA-Seq“. Vědecké zprávy. 8 (1). doi:10.1038 / s41598-018-31420-7. ISSN  2045-2322.
  19. ^ Robinson, Kelly M .; Hawkins, Aziah S .; Santana-Cruz, Ivette; Adkins, Ricky S .; Shetty, Amol C .; Nagaraj, Sushma; Sadzewicz, Lisa; Tallon, Luke J .; Rasko, David A .; Fraser, Claire M .; Mahurkar, Anup; Silva, Joana C .; Dunning Hotopp, Julie C. (2017). „Optimalizace zarovnávače zvyšuje přesnost a snižuje výpočetní časy v datech sekvencí pro více druhů“. Mikrobiální genomika. 3 (9). doi:10,1099 / mg. 0,000122. ISSN  2057-5858.
  20. ^ Kumar, Nikhil; Lin, Mingqun; Zhao, Xuechu; Ott, Sandra; Santana-Cruz, Ivette; Daugherty, Sean; Rikihisa, Yasuko; Sadzewicz, Lisa; Tallon, Luke J .; Fraser, Claire M .; Dunning Hotopp, Julie C. (2016). „Efektivní obohacení bakteriální mRNA ze vzorků celkové RNA hostitele-bakterie“. Vědecké zprávy. 6 (1). doi:10.1038 / srep34850. ISSN  2045-2322.
  21. ^ Zhang, Yan; Brady, Arthur; Jones, Cheron; Song, Yang; Darton, Thomas C .; Jones, Claire; Blohmke, Christoph J .; Pollard, Andrew J .; Magder, Laurence S .; Fasano, Alessio; Sztein, Marcelo B .; Fraser, Claire M .; Dominguez Bello, Maria Gloria (2018). "Kompoziční a funkční rozdíly v lidském střevním mikrobiomu korelují s klinickými výsledky po infekci divokým typem Salmonella enterica Serovar Typhi". mBio. 9 (3). doi:10,1128 / mBio.00686-18. ISSN  2150-7511.
  22. ^ Eloe-Fadrosh, Emiley A .; Brady, Arthur; Crabtree, Jonathan; Drabek, Elliott F .; Ma, Bing; Mahurkar, Anup; Ravel, Jacques; Haverkamp, ​​Miriam; Fiorino, Anne-Maria; Botelho, Christine; Andreyeva, Irina; Hibberd, Patricia L .; Fraser, Claire M .; McFall-Ngai, Margaret J. (2015). "Funkční dynamika střevního mikrobiomu u starších lidí během probiotické konzumace". mBio. 6 (2). doi:10,1128 / mBio.00231-15. ISSN  2150-7511.
  23. ^ A b Lékařská fakulta University of Maryland. „Claire Fraser z UMSOM jmenována nově zvolenou prezidentkou AAAS“. Citováno 31. března 2019.
  24. ^ „redakční rada mBio“. Citováno 31. března 2019.
  25. ^ „Journal of Bacteriology Masthead“ (PDF). Leden 2005. Citováno 31. března 2019.
  26. ^ ""Redakční rada mikrobiální genomiky"". Citováno 31. března 2019.
  27. ^ „O molekulárních případových studiích Cold Spring Harbor“. Citováno 31. března 2019.
  28. ^ „DNA and Cell Biology About This Journal“. Citováno 31. března 2019.
  29. ^ „Představenstvo BD volí Dr. Claire M. Fraser-Liggett“. Citováno 30. března 2019.
  30. ^ „Laureáti Ceny Ernesta Orlanda Lawrencea“ (PDF). Americké ministerstvo energetiky.
  31. ^ „Fraser TIGR, Salzberg oceněn jako AAAS Fellows“.
  32. ^ „Prezident TIGR získal cenu ASM Promega Biotechnology Research Award“. 6. června 2005.
  33. ^ „Cena a přednáška Charlese Thoma“.
  34. ^ „Claire Fraser-Liggett bude uvedena v Marylandské ženské síni slávy“. 19. března 2010.
  35. ^ „Dvě firmy, dva univerzitní programy získaly ceny GBC Maryland Bioscience Awards 2010“.
  36. ^ „Ženy v technologii vyhlašují vítěze své jedenácté výroční ceny za vedení“.
  37. ^ „Síň slávy absolventů“.
  38. ^ „IOM volí 65 nových členů, pět zahraničních spolupracovníků“. 17. října 2011.
  39. ^ „Vlivní Marylander Honorees“.
  40. ^ „Ocenění 2014“.
  41. ^ „Nejvlivnější vědecká mysl na světě 2014“ (PDF).
  42. ^ „Claire Fraser jmenovala inaugurační děkanovu obdařenou profesorku“. 9. prosince 2015.
  43. ^ ""Amazon Jack Kammer"". Citováno 31. března 2019.
  44. ^ ""Venter, Fraser Použijte Pet Poodle pro projekt genomu psů Celera / TIGR"". 10. května 2002. Citováno 31. března 2019.

externí odkazy